CLIP1 - CLIP1

CLIP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CP5, 2CP6, 2E3H, 2E3I, 2E4H, 2HQH, 2QK0, 3E2U, 3РДВ
Идентификаторы
Псевдонимы	CLIP1, CLIP, CLIP-170, CLIP170, CYLN1, RSN, CAP-Gly домен, содержащий линкерный белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 179838 MGI: 1928401 ГомолоГен: 74455 Генные карты: CLIP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.31 Начните 122,271,432 бп[1] Конец 122,422,632 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начните 123,577,795 бп[2] Конец 123,684,618 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • связывание микротрубочек • связывание плюсовых концов микротрубочек • связывание ионов металлов • связывание тубулина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов цинка • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитозоль • эндосома • центросома • проекция клетки • мембрана • цитоскелет микротрубочек • взъерошить • плюс-конец микротрубочки • макропиносома • цитоплазматическая микротрубочка • микротрубочки • цитоскелет • промежуточная нить • мембрана цитоплазматических везикул • цитоплазматический пузырек • кинетохора • ядерная оболочка • цитоплазма Биологический процесс • образование пучка микротрубочек • положительное регулирование полимеризации микротрубочек • транспорт белка в рафт плазматической мембраны • GO: 0007067 митотический клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6249	56430
Ансамбль	ENSG00000130779	ENSMUSG00000049550
UniProt	P30622	Q922J3
RefSeq (мРНК)	NM_001247997 NM_002956 NM_198240	NM_001291229 NM_019765 NM_001347468 NM_001359220 NM_001359221 NM_001359222 NM_001359223 NM_001359224
RefSeq (белок)	NP_001234926 NP_002947 NP_937883	NP_001278158 NP_001334397 NP_062739 NP_001346149 NP_001346150 NP_001346151 NP_001346152 NP_001346153
Расположение (UCSC)	Chr 12: 122,27 - 122,42 Мб	Chr 5: 123.58 - 123.68 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CAP-GLY домен, содержащий линкерный белок 1, также известен как CLIP1, это белок который у человека кодируется CLIP1 ген.^[5]

Взаимодействия

CLIP1 был показан взаимодействовать с участием IQGAP1,^[6] Млекопитающие-мишени рапамицина^[7] и PAFAH1B1.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130779 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049550 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: домен CLIP1 CAP-GLY, содержащий линкерный белок 1».
6. Фуката М., Ватанабэ Т., Норитаке Дж., Накагава М., Ямага М., Курода С., Мацуура Ю., Ивамацу А., Перес Ф, Кайбути К. (июнь 2002 г.). «Rac1 и Cdc42 захватывают микротрубочки через IQGAP1 и CLIP-170». Ячейка. 109 (7): 873–85. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00800-0. PMID  12110184. S2CID  15158637.
7. Чой Дж. Х., Бертрам П. Г., Дренан Р., Карвалью Дж., Чжоу Х. Х., Чжэн XF (октябрь 2002 г.). «Белок, ассоциированный с рапамицином FKBP12 (FRAP), представляет собой киназу CLIP-170». Отчеты EMBO. 3 (10): 988–94. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf197. ЧВК  1307618. PMID  12231510.
8. Coquelle FM, Caspi M, Cordelières FP, Dompierre JP, Dujardin DL, Koifman C, Martin P, Hoogenraad CC, Akhmanova A, Galjart N, De Mey JR, Reiner O (май 2002 г.). «LIS1, ключ CLIP-170 к пути динеин / динактин». Молекулярная и клеточная биология. 22 (9): 3089–102. Дои:10.1128 / MCB.22.9.3089-3102.2002. ЧВК  133759. PMID  11940666.

внешние ссылки

• Человек CLIP1 расположение генома и CLIP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Galjart N (июнь 2005 г.). «CLIP и CLASP и сотовая динамика». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология. 6 (6): 487–98. Дои:10.1038 / nrm1664. PMID  15928712. S2CID  23216754.
• Пьер П., Шил Дж., Рикард Дж. Э., Крайс Т. Э. (сентябрь 1992 г.). «CLIP-170 связывает эндоцитарные везикулы с микротрубочками». Ячейка. 70 (6): 887–900. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90240-Д. PMID  1356075. S2CID  41119165.
• Бильбе Дж., Делаби Дж., Брюгген Дж., Ришенер Х., Ассельбергс Ф.А., Черлетти Н., Сорг С., Одинк К., Тарксай Л., Визендангер В. (июнь 1992 г.). «Рестин: новый ассоциированный с промежуточными филаментами белок, высоко экспрессируемый в клетках Рида-Штернберга при болезни Ходжкина». Журнал EMBO. 11 (6): 2103–13. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05269.x. ЧВК  556677. PMID  1600942.
• Пьер П., Пепперкок Р., Крайс Т.Э. (июль 1994 г.). «Молекулярная характеристика двух функциональных доменов CLIP-170 in vivo». Журнал клеточной науки. 107 (7): 1909–20. PMID  7983157.
• Хилликер С., Делаби Дж., Спелеман Ф., Бильбе Дж., Брюгген Дж., Ван Лёвен Ф., Ван ден Берге Х. (1993). «Локализация гена (RSN), кодирующего рестин, маркер клеток Рида-Штернберга при болезни Ходжкина, в полосе хромосомы человека 12q24.3 и YAC-клонирование локуса». Цитогенетика и клеточная генетика. 65 (3): 172–6. Дои:10.1159/000133625. PMID  8222754.
• Griparic L, Keller TC (октябрь 1998 г.). «Идентификация и экспрессия двух новых изоформ CLIP-170 / Restin, экспрессируемых преимущественно в мышцах». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1405 (1–3): 35–46. Дои:10.1016 / S0167-4889 (98) 00096-2. PMID  9784600.
• Перес Ф., Диамантопулос Г.С., Сталдер Р., Крайс Т.Э. (февраль 1999 г.). «CLIP-170 подчеркивает растущие концы микротрубочек in vivo». Ячейка. 96 (4): 517–27. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80656-X. PMID  10052454. S2CID  18082011.
• Ахманова A, Hoogenraad CC, Drabek K, Stepanova T, Dortland B, Verkerk T, Vermeulen W., Burgering BM, De Zeeuw CI, Grosveld F, Galjart N (март 2001 г.). «Кламмеры представляют собой связывающие белки CLIP-115 и -170, участвующие в региональной регуляции динамики микротрубочек в подвижных фибробластах». Ячейка. 104 (6): 923–35. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00288-4. PMID  11290329. S2CID  14443149.
• Coquelle FM, Caspi M, Cordelières FP, Dompierre JP, Dujardin DL, Koifman C, Martin P, Hoogenraad CC, Akhmanova A, Galjart N, De Mey JR, Reiner O (май 2002 г.). «LIS1, ключ CLIP-170 к пути динеин / динактин». Молекулярная и клеточная биология. 22 (9): 3089–102. Дои:10.1128 / MCB.22.9.3089-3102.2002. ЧВК  133759. PMID  11940666.
• Гриффит К.Дж., Райан Дж. П., Сенекаль Дж. Л., Фрицлер М. Дж. (Март 2002 г.). «Цитоплазматический линкерный белок CLIP-170 является аутоантигеном человека». Клиническая и экспериментальная иммунология. 127 (3): 533–8. Дои:10.1046 / j.1365-2249.2002.01756.x. ЧВК  1906301. PMID  11966772.
• Фуката М., Ватанабе Т., Норитаке Дж., Накагава М., Ямага М., Курода С., Мацуура Ю., Ивамацу А., Перес Ф, Кайбути К. (июнь 2002 г.). «Rac1 и Cdc42 захватывают микротрубочки через IQGAP1 и CLIP-170». Ячейка. 109 (7): 873–85. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00800-0. PMID  12110184. S2CID  15158637.
• Чой Дж. Х., Бертрам П. Г., Дренан Р., Карвалью Дж., Чжоу Х. Х., Чжэн XF (октябрь 2002 г.). «Белок, ассоциированный с рапамицином FKBP12 (FRAP), представляет собой киназу CLIP-170». Отчеты EMBO. 3 (10): 988–94. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf197. ЧВК  1307618. PMID  12231510.
• Сахин У., Нойман Ф., Туреси О., Шмитс Р., Перес Ф., Пфреундшу М. (декабрь 2002 г.). «Связанный с клетками Ходжкина и Рида-Штернберга аутоантиген CLIP-170 / restin является маркером дендритных клеток и участвует в доставке макропинозом в цитоскелет, поддерживая функциональную концепцию клеток Ходжкина и Рида-Штернберга». Кровь. 100 (12): 4139–45. Дои:10.1182 / кровь.V100.12.4139. PMID  12433698.
• Goodson HV, Skube SB, Stalder R, Valetti C, Kreis TE, Morrison EE, Schroer TA (июль 2003 г.). «CLIP-170 взаимодействует с динактиновым комплексом и APC-связывающим белком EB1 по разным механизмам». Подвижность клеток и цитоскелет. 55 (3): 156–73. Дои:10,1002 / см. 10114. PMID  12789661.
• Хо С.М., Лау К.М., Мок С.К., Сайед В. (июль 2003 г.). «Профилирование изменений экспрессии генов, индуцированных фолликулостимулирующим гормоном, в нормальных и злокачественных эпителиальных клетках яичников человека». Онкоген. 22 (27): 4243–56. Дои:10.1038 / sj.onc.1206437. PMID  12833147.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Ватанабэ Т., Ван С., Норитаке Дж., Сато К., Фуката М., Такефудзи М., Накагава М., Изуми Н., Акияма Т., Кайбути К. (декабрь 2004 г.). «Взаимодействие с IQGAP1 связывает APC с Rac1, Cdc42 и актиновыми филаментами во время поляризации и миграции клеток». Клетка развития. 7 (6): 871–83. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.10.017. PMID  15572129.