ОБЪЕДИНЕНИЕ - COMBINE - Wikipedia

COMBINE complete.svg

ОБЪЕДИНЕНИЕ, COmputational Modeling in BIology NEtwork, является инициативой по координации разработки различных стандартов и форматов сообщества для вычислительных моделей, первоначально в системная биология и связанные области.[1]

История

Инициатива COMBINE была начата в 2010 году в попытке начать более широкую серию научных встреч, чтобы заменить несколько небольших и более целенаправленных встреч и хакатоны, в частности Графическая нотация системной биологии (SBGN) и Язык разметки системной биологии (SBML) встречи. Первая встреча КОМБАЙНА была организована Игорь Горянин и проводился в Школа информатики Эдинбургского университета в октябре 2010 года. За заключительной сессией встречи последовало мероприятие, посвященное 10-летию SBML.[2] С тех пор собрания КОМБАЙНА проводятся ежегодно; КОМБАЙН 2014 был организован Университет Южной Калифорнии и COMBINE 2015 будут организованы группой Криса Майерса на Университет Юты.[3]

Форматы представления

Инициатива COMBINE направлена ​​на координацию разработки стандартов и форматов сообщества для компьютерного моделирования, особенно в системной биологии. При этом ожидается, что будет разработан набор дополнительных, но непересекающихся стандартов, охватывающих все аспекты компьютерного моделирования во всех областях биологии.[1] Основные форматы представления, охватываемые деятельностью COMBINE: BioPAX язык стандартов, SBGN, SBML и СЭД-МЛ и CellML языки разметки.[4] Соответствующие усилия по стандартизации: МИРИАМ, SBO, KiSAO и BioModels.net репозиторий моделей.[4]

Рекомендации

  1. ^ а б «Вычислительное моделирование в сети биологии». комбинировать. Получено 23 апреля 2014.
  2. ^ «События / Форумы / COMBINE 2010 - SBML.caltech.edu». Получено 6 августа 2015.
  3. ^ «События - КОМБИНАТ». Получено 6 августа 2015.
  4. ^ а б «Стандарты, относящиеся к деятельности КОМБАЙНА или связанные с ней». комбинировать. Получено 23 апреля 2014.

внешняя ссылка