KiSAO - KiSAO

KiSAO
KiSAO logo.svg
Содержание
ОписаниеОнтология, обеспечивающая поддержку однозначного обращения к алгоритмам моделирования при описании имитационного эксперимента.
Типы данных
захвачен
алгоритмы моделирования, их характеристики и параметры
Контакт
Исследовательский центрEMBL-EBI
Основное цитированиеPMID  22027554
Доступ
СтандартыМИРИАМ
Формат данныхСОВА
Интернет сайтДомашняя страница KiSAO, KiSAO в BioPortal
Скачать URLДомашняя страница KiSAO
Инструменты
АвтономныйlibKiSAO, библиотека Java для запросов KiSAO
Разное
ЛицензияХудожественная лицензия
Версия2.3.5 (апрель 2014 г.)
Политика курированияда (руководство)
Закладки
сущности
да

В Онтология алгоритма кинетического моделирования (KiSAO) предоставляет информацию о существующих алгоритмах, доступных для моделирования системная биология модели, их характеристика и взаимосвязи. KiSAO является частью BioModels.net проекта и ОБЪЕДИНЕНИЕ инициатива.[1]

Структура

KiSAO состоит из трех основных филиалов:

  • алгоритм моделирования
  • характеристика алгоритма моделирования
  • параметр алгоритма моделирования

Элементы каждой ветви алгоритма связаны с характеристиками и ветвями параметров с помощью имеет характерный и имеет параметр отношения соответственно. Сама ветвь алгоритма иерархически структурирована с использованием отношений, которые обозначают, что алгоритмы-потомки были получены от более общих предков или определяют их.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Courtot, M .; Juty, N .; Knupfer, C .; Waltemath, D .; Жукова, А .; Drager, A .; Dumontier, M .; Finney, A .; Голебевский, М .; Hastings, J .; Обручи, S .; Китинг, S .; Келл, Д. Б.; Kerrien, S .; Lawson, J .; Lister, A .; Lu, J .; Machne, R .; Mendes, P .; Pocock, M .; Rodriguez, N .; Villeger, A .; Уилкинсон, Д. Дж .; Wimalaratne, S .; Laibe, C .; Hucka, M .; Ле Новер, Н. (2014). «Управляемые словари и семантика в системной биологии». Молекулярная системная биология. 7: 543. Дои:10.1038 / msb.2011.77. ЧВК  3261705. PMID  22027554.