COTL1 - COTL1

COTL1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1T2L, 1T3X, 1T3Y, 1TMW, 1VFQ, 1WNJ
Идентификаторы
Псевдонимы	COTL1, CLP, коактозин-подобный F-актин-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606748 MGI: 1919292 ГомолоГен: 10898 Генные карты: COTL1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 16 (человек)
Конец	84,618,078 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	119,840,544 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• связывание ферментов; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание актина;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • внеклеточная экзосома; • цитоскелет; • внутриклеточный; • ядро клетки; • внеклеточная область; • просвет секреторной гранулы; • Просвет гранул, богатых фиколином-1;
Биологический процесс	• защитная реакция на грибок; • дегрануляция нейтрофилов; • биологический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23406
	72042
	ENSG00000103187
	ENSMUSG00000031827
	Q14019
	Q9CQI6
	NM_021149
	NM_028071
	NP_066972
	NP_082347
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Коактозин-подобный белок (COTL1 или CLP) это белок что у людей кодируется COTL1 ген.^[5]^[6]^[7]^[8]

Функция

Этот ген кодирует один из многочисленных актин-связывающих белков, которые регулируют актиновый цитоскелет. Этот белок связывает F-актин, а также взаимодействует и тем самым стабилизирует 5-липоксигеназа (ALOX5). Хотя сообщалось, что этот ген отображается на хромосоме 17 в области синдрома Смита-Магениса, наилучшее выравнивание для этого гена происходит с хромосомой 16. Область синдрома Смита-Магениса является местом расположения двух связанных псевдогенов.^[8]

Взаимодействия

COTL1 был показан взаимодействовать с ALOX5.^[9] ALOX5 - первый коммитированный фермент в метаболизме арахидоновая кислота к ряду биологически важных клеточная сигнализация агенты: а) провоспалительный медиатор, лейкотриен B4 (LTB4); б) сужения дыхательных путей, LTC4, LTD4, и LTE4; в) то 5-гидроксиэйкозатетраеновая кислота семейство медиаторов провоспалительных и проаллергических реакций, 5-HETE и 5-оксо-эйкозатетраеновая кислота. ALOX5 также способствует метаболизму арахидоновой кислоты и других полиненасыщенные жирные кислоты к агентам, которые блокируют воспаление и аллергические реакции, специализированные посредники по разрешению споров из липоксин и решающий подклассы. На основании исследований in vitro, COTL1 служит для стабилизации ALOX5, действуя как сопровождающий или каркас, чтобы предотвратить инактивацию фермента и, тем самым, способствовать его метаболической активности.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103187 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031827 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Провост П., Самуэльссон Б., Родмарк О. (апрель 1999 г.). «Взаимодействие 5-липоксигеназы с клеточными белками». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (5): 1881–5. Дои:10.1073 / pnas.96.5.1881. ЧВК 26705. PMID 10051563.
^ Chen KS, Manian P, Koeuth T., Potocki L, Zhao Q, Chinault AC, Lee CC, Lupski JR (ноябрь 1997 г.). «Гомологичная рекомбинация генного кластера фланкирующих повторов является механизмом для общего синдрома делеции смежных генов». Nat. Genet. 17 (2): 154–63. Дои:10.1038 / ng1097-154. PMID 9326934. S2CID 27742511.
^ Rakonjac M, Fischer L, Provost P, Werz O, Steinhilber D, Samuelsson B., Rådmark O (сентябрь 2006 г.). «Коактозиноподобный белок поддерживает активность фермента 5-липоксигеназы и стимулирует выработку лейкотриена A4». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (35): 13150–5. Дои:10.1073 / pnas.0605150103. ЧВК 1559768. PMID 16924104.
^ ^а ^б «Ген Entrez: COTL1, подобный коактозину 1 (Dictyostelium)».
^ Провост П., Дусет Дж., Хаммарберг Т., Гериш Дж., Самуэльссон Б., Радмарк О. (май 2001 г.). «5-липоксигеназа взаимодействует с коактозиноподобным белком». J. Biol. Chem. 276 (19): 16520–7. Дои:10.1074 / jbc.M011205200. PMID 11297527.
^ Анвар Ю., Сабир Дж. С., Куреши М. И., Шайни К. С. (2014). «5-липоксигеназа: перспективный лекарственный препарат-мишень против воспалительных заболеваний - биохимическая и фармакологическая регуляция». Текущие цели в отношении лекарств. 15 (4): 410–22. Дои:10.2174/1389450114666131209110745. PMID 24313690.

внешние ссылки

Человек COTL1 расположение генома и COTL1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

Wu C, Friedlander P, Lamoureux C, Zannis-Hadjopoulos M, Price GB (1993). «клоны кДНК обладают автономной репликационной активностью». Биохим. Биофиз. Acta. 1174 (3): 241–57. Дои:10.1016 / 0167-4781 (93) 90193-ч. PMID 7690594.
Провост П., Дусет Дж., Хаммарберг Т., Гериш Дж., Самуэльссон Б., Радмарк О. (2001). «5-липоксигеназа взаимодействует с коактозиноподобным белком». J. Biol. Chem. 276 (19): 16520–7. Дои:10.1074 / jbc.M011205200. PMID 11297527.
Провост П., Дусет Дж., Сток А, Гериш Дж., Самуэльссон Б., Родмарк О. (2001). «Коактозин-подобный белок, человеческий F-актин-связывающий белок: критическая роль лизина-75». Biochem. J. 359 (Pt 2): 255–63. Дои:10.1042/0264-6021:3590255. ЧВК 1222143. PMID 11583571.
Накацура Т., Сенджу С., Ито М., Нисимура Ю., Ито К. (2002). «Клеточные и гуморальные иммунные ответы на антиген рака поджелудочной железы человека, коактозин-подобный белок, первоначально определенный методом SEREX». Евро. J. Immunol. 32 (3): 826–36. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200203) 32: 3 <826 :: AID-IMMU826> 3.0.CO; 2-Y. PMID 11870627.
Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Дай Х, Ву Дж, Сюй И, Яцзюнь Т., Хушенг Д., Ши И (2004). «Назначение резонансов 1H, 13C и 15N и вторичные структуры человеческого коактозин-подобного белка (hCLP) D123N». J. Biomol. ЯМР. 29 (3): 455–6. Дои:10.1023 / B: JNMR.0000032550.18424.aa. PMID 15213466. S2CID 27858479.
Лю Л., Ван И, Чжан П., Ченг З, Ван М., Чжоу З, Гун В. (2004). «Экспрессия, очистка и предварительные кристаллографические исследования коактозиноподобного белка человека». Acta Crystallogr. D. 60 (Pt 9): 1651–3. Дои:10.1107 / S0907444904016701. PMID 15333945.
Ли X, Лю X, Lou Z, Дуань X, Wu H, Лю Y, Rao Z (2004). «Кристаллическая структура коактозиноподобного белка человека при разрешении 1,9 A». Белковая наука. 13 (11): 2845–51. Дои:10.1110 / пс 04937304. ЧВК 2286586. PMID 15459340.
Ли X, Лю X, Чжао Q, Лю Y, Дуань X, Rao Z (2004). «Кристаллизация и предварительные кристаллографические исследования коактозиноподобного белка человека (CLP)». Acta Crystallogr. D. 60 (Pt 12 Pt 2): 2387–8. Дои:10.1107 / S0907444904028112. PMID 15583396.
Геваерт К., Стаес А., Ван Дамм Дж, Де Гроот С., Хюгелье К., Демол Х, Мартенс Л., Гетальс М., Вандекеркхове Дж. (2005). «Глобальный анализ фосфопротеома гепатоцитов человека HepG2 с использованием обращенно-фазовой диагональной ЖК». Протеомика. 5 (14): 3589–99. Дои:10.1002 / pmic.200401217. PMID 16097034.
Дай Х, Хуанг В., Сюй Дж., Яо Б., Сюн С., Дин Х, Тан И, Лю Х, Ву Дж, Ши И (2006). «Модель связывания человеческого коактозин-подобного белка с актином филамента, выявленная мутагенезом». Биохим. Биофиз. Acta. 1764 (11): 1688–700. Дои:10.1016 / j.bbapap.2006.06.017. PMID 17070122.

Эта статья о ген на хромосома человека 16 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103187 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031827 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10051563-5] Провост П., Самуэльссон Б., Родмарк О. (апрель 1999 г.). «Взаимодействие 5-липоксигеназы с клеточными белками». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (5): 1881–5. Дои:10.1073 / pnas.96.5.1881. ЧВК 26705. PMID 10051563.

[pmid9326934-6] Chen KS, Manian P, Koeuth T., Potocki L, Zhao Q, Chinault AC, Lee CC, Lupski JR (ноябрь 1997 г.). «Гомологичная рекомбинация генного кластера фланкирующих повторов является механизмом для общего синдрома делеции смежных генов». Nat. Genet. 17 (2): 154–63. Дои:10.1038 / ng1097-154. PMID 9326934. S2CID 27742511.

[pmid16924104-7] Rakonjac M, Fischer L, Provost P, Werz O, Steinhilber D, Samuelsson B., Rådmark O (сентябрь 2006 г.). «Коактозиноподобный белок поддерживает активность фермента 5-липоксигеназы и стимулирует выработку лейкотриена A4». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (35): 13150–5. Дои:10.1073 / pnas.0605150103. ЧВК 1559768. PMID 16924104.

[entrez-8] а ^б «Ген Entrez: COTL1, подобный коактозину 1 (Dictyostelium)».

[pmid11297527-9] Провост П., Дусет Дж., Хаммарберг Т., Гериш Дж., Самуэльссон Б., Радмарк О. (май 2001 г.). «5-липоксигеназа взаимодействует с коактозиноподобным белком». J. Biol. Chem. 276 (19): 16520–7. Дои:10.1074 / jbc.M011205200. PMID 11297527.

[pmid24313690-10] Анвар Ю., Сабир Дж. С., Куреши М. И., Шайни К. С. (2014). «5-липоксигеназа: перспективный лекарственный препарат-мишень против воспалительных заболеваний - биохимическая и фармакологическая регуляция». Текущие цели в отношении лекарств. 15 (4): 410–22. Дои:10.2174/1389450114666131209110745. PMID 24313690.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]