CRABP2 - CRABP2

CRABP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BLR, 1БМ5, 1КБК, 1CBS, 1XCA, 2CBS, 2FR3, 2FRS, 2FS6, 2FS7, 2G78, 2G79, 2Г7Б, 3CBS, 3CR6, 3CWK, 3Д95, 3Д96, 3Д97, 3F8A, 3F9D, 3FA6, 3FA7, 3FA8, 3FA9, 3FEK, 3FEL, 3FEN, 3FEP, 3I17, 4I9R, 4I9S, 4М6С, 4М7М, 4QGV, 4QGW, 4QGX, 4YBP, 4YBU, 4YKM, 4YKO, 4YCH, 4YGZ, 4YFP, 4YFQ, 4YGH, 4YH0, 4YFR, 4YCE, 4YGG, 4YDA, 4YDB, 5 Гц
Идентификаторы
Псевдонимы	CRABP2, CRABP-II, RBP6, клеточный белок, связывающий ретиноевую кислоту 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 180231 MGI: 88491 ГомолоГен: 1415 Генные карты: CRABP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.1 Начните 156,699,606 бп[1] Конец 156,705,816 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 Начните 87,948,666 бп[2] Конец 87,953,376 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • транспортная деятельность • липидное связывание • связывание ретинола • связывание ретиноевой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • связывание сетчатки • ретиноидное связывание Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование побочного прорастания • метаболический процесс ретиноевой кислоты • эмбриональный морфогенез передних конечностей • преобразование сигнала • регуляция сигнального пути рецептора ретиноевой кислоты • развитие эпидермиса • процесс биосинтеза ретиноевой кислоты • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1382	12904
Ансамбль	ENSG00000143320	ENSMUSG00000004885
UniProt	P29373	P22935
RefSeq (мРНК)	NM_001878 NM_001199723	NM_007759
RefSeq (белок)	NP_001186652 NP_001869	NP_031785
Расположение (UCSC)	Chr 1: 156,7 - 156,71 Мб	Chr 3: 87.95 - 87.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Клеточный белок, связывающий ретиноевую кислоту 2 является цитоплазматическим связыванием белок что у людей кодируется CRABP2 ген.^[5][6][7]

CRABP2 структурно похож на CRABP1, но CRABP2 имеет меньшее сродство к ретиноевая кислота (РА).^[5] CRABP2 связан с клетками, которые продуцируют большое количество ретиноевой кислоты, и может играть роль в опосредовании эффектов ретиноевой кислоты в клетке.^[5][8]

Функция

Обнаружен ряд специфических белков-переносчиков для членов семейства витаминов А. Ретиноевая кислота - активный метаболит витамина А (ретинол).^[8] Белки, связывающие клеточную ретиноевую кислоту (CRABP), представляют собой низкомолекулярные белки, точная функция которых остается в значительной степени неизвестной.

Индуцибельность гена CRABP2 предполагает, что эта изоформа важна для опосредованной ретиноевой кислотой регуляции роста, дифференциации и развития кожи человека. CRABP2 участвует в метаболизме и транспортировке ретиноевой кислоты из цитозоля к RAR (рецепторам ретиноевой кислоты), расположенным в ядре.^[5][7][8][9] CRABP2 специфически коэкспрессируется с генами RAR-β и клеточного ретинол-связывающего белка 1 в некоторых тканях.^[5] Было высказано предположение, что ген CRABP2 транскрипционно регулируется вновь синтезированным регуляторным белком.^[7]

Распределение тканей

Распределение гена CRABP2 в тканях изучали в первую очередь на мышах. Во время эмбрионального развития CRABP2 присутствует в тканях по всему телу более диффузно, чем CRABP1.^[5] CRABP1 более изолирован от конкретных областей, хотя он проявляется в более высоких концентрациях.^[5] CRABP1 и 2 часто перекрываются в тканях.^[5]

Экспрессия гена CRABP2 широко распространена в туловище и заднем мозге (и в меньшей степени в переднем мозге), но присутствует в других областях тела.^[5] Было показано, что такие структуры, как конечности, задний мозг и клетки краниального нервного гребня, чрезмерно чувствительны к высоким уровням ретиноевой кислоты.^[5] Сегментация ромбомеров в заднем мозге и развитие краниальных ганглиев V, VII, VIII, IX и X также, по-видимому, частично зависят от экспрессии CRABP2.^[5] CRABP2 в изобилии присутствует в дорсальной части конечности во время развития.^[5]

Гены CRABP2 также экспрессируются в структурах, которые менее чувствительны к уровням ретиноидов в организме во время эмбрионального развития.^[5] Эти структуры включают глоточные карманы, переднюю и среднюю кишку, нижнюю и лобную части. мезенхима, развивающиеся мышцы, межпальцевая мезенхима, мочеполовая система, сосуды зрительного нерва и сенсорный эпителий внутреннего уха.^[5]

Дефекты

Было показано, что дефицит витамина А у мышей вызывает проблемы со сперматогенезом, нерегулярные эстральные циклы, изменения в эпителии матки и репродуктивную недостаточность, заканчивающуюся гибелью плода и его реабсорбцией.^[8]

Ткани с CRABP2 могут быть чувствительны к высоким уровням ретиноевой кислоты, что может вызывать дефекты в развитии этих тканей.^[5]

Исследования нокаута гена CRABP2 должны быть выполнены для определения любых конкретных дефектов, вызванных потерей этого гена.

Взаимодействия

CRABP2 был показан взаимодействовать с участием Циклин D3.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143320 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004885 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Руберте Э., Фридрих В., Моррис-Кей Г., Шамбон П. (август 1992 г.). «Дифференциальные паттерны распределения транскриптов CRABP I и CRABP II во время эмбриогенеза мышей». Развитие. 115 (4): 973–987. PMID  1333403.
6. Астрем А., Таваккол А., Петтерссон Ю., Кроми М., Элдер Дж. Т., Вурхиз Дж. Дж. (Сентябрь 1991 г.). «Молекулярное клонирование двух белков, связывающих ретиноевую кислоту человека (CRABP). Экспрессия CRABP-II, но не CRABP-I, индуцированная ретиноевой кислотой, в коже взрослого человека in vivo и в фибробластах кожи in vitro». Журнал биологической химии. 266 (26): 17662–6. PMID  1654334.
7. «Ген Entrez: клеточный белок 2, связывающий ретиноевую кислоту CRABP2».
8. Zheng WL, Ong DE (апрель 1998 г.). «Пространственные и временные паттерны экспрессии клеточного ретинол-связывающего белка и клеточного связывающего ретиноевую кислоту белков в матке крысы на ранних сроках беременности». Биология размножения. 58 (4): 963–970. Дои:10.1095 / биолрепрод58.4.963. PMID  9546726.
9. Маден М., Онг Д.Е., Саммербелл Д., Хитил Ф. (апрель 1989 г.). «Роль ретиноид-связывающих белков в формировании паттерна в развивающейся конечности, регенерирующей конечности и нервной системе». Развитие. 107 Дополнение: 109–119. PMID  2561479.
10. Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (февраль 2003 г.). «Циклин D3 является кофактором рецепторов ретиноевой кислоты, модулируя их активность в присутствии клеточного белка II, связывающего ретиноевую кислоту». Журнал биологической химии. 278 (8): 6355–62. Дои:10.1074 / jbc.M210697200. PMID  12482873.

внешние ссылки

• Человек CRABP2 расположение генома и CRABP2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Эллер М.С., Олексиак М.Ф., Маккуэйд Т.Дж., МакАфи С.Г., Гилкрест Б.А. (февраль 1992 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия двух кДНК CRABP из кожи человека». Экспериментальные исследования клеток. 198 (2): 328–36. Дои:10.1016 / 0014-4827 (92) 90387-Н. PMID  1309505.
• Старейшина Дж. Т., Астрем А., Петтерссон Ю., Вурхис Дж. Дж., Трент Дж. М. (июль 1992 г.). «Присвоение гена CRABP-II человека хромосоме 1q21 с помощью неизотопной гибридизации in situ» (PDF). Генетика человека. 89 (5): 487–90. Дои:10.1007 / BF00219171. PMID  1321791.
• Aström A, Pettersson U, Voorhees JJ (декабрь 1992 г.). «Структура гена человеческого клеточного белка II, связывающего ретиноевую кислоту. Ранняя регуляция транскрипции ретиноевой кислотой». Журнал биологической химии. 267 (35): 25251–5. PMID  1334086.
• Томпсон Дж. Р., Братт Дж. М., Банашак Л. Дж. (Сентябрь 1995 г.). «Кристаллическая структура клеточного белка, связывающего ретиноевую кислоту I, показывает увеличенный доступ к полости связывания из-за образования межмолекулярного бета-слоя». Журнал молекулярной биологии. 252 (4): 433–46. Дои:10.1006 / jmbi.1995.0509. PMID  7563063.
• Клейвегт Г.Дж., Бергфорс Т., Сенн Х., Ле Мотт П., Гселл Б., Шудо К., Джонс Т.А. (декабрь 1994 г.). «Кристаллические структуры клеточных белков, связывающих ретиноевую кислоту I и II, в комплексе с полностью транс-ретиноевой кислотой и синтетическим ретиноидом». Структура. 2 (12): 1241–58. Дои:10.1016 / S0969-2126 (94) 00125-1. PMID  7704533.
• Стефану А., Сарлис Нью-Джерси, Ричардс Р., Хандвергер С. (июль 1994 г.). «Экспрессия подтипов рецепторов ретиноевой кислоты и клеточных мРНК белка-II, связывающего ретиноевую кислоту, во время дифференцировки клеток трофобласта человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 202 (2): 772–80. Дои:10.1006 / bbrc.1994.1997. PMID  8048948.
• Sanquer S, Eller MS, Gilchrest BA (февраль 1993 г.). «Ретиноиды и состояние дифференцировки модулируют экспрессию гена CRABP II в кожном эквиваленте». Журнал следственной дерматологии. 100 (2): 148–53. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12462785. PMID  8381448.
• Ван Л., Ли И, Ян Х (январь 1997 г.). «Взаимосвязь между структурой и функцией клеточных белков, связывающих ретиноевую кислоту. Количественный анализ лиганд-связывающих свойств белков дикого типа и сайт-направленных мутантов». Журнал биологической химии. 272 (3): 1541–7. Дои:10.1074 / jbc.272.3.1541. PMID  8999826.
• Flagiello D, Apiou F, Gibaud A, Poupon MF, Dutrillaux B, Malfoy B (1997). «Присвоение генов клеточного белка, связывающего ретиноевую кислоту 1 (CRABP1) и 2 (CRABP2), полосе хромосомы человека 15q24 и 1q21.3, соответственно, посредством гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 76 (1–2): 17–8. Дои:10.1159/000134502. PMID  9154115.
• Брар А.К., Кесслер Калифорния, Мейер А.Дж., Сидарс М.И., Джикихара Х. (март 1996 г.). «Ретиноевая кислота подавляет децидуализацию in vitro стромальных клеток эндометрия человека». Молекулярная репродукция человека. 2 (3): 185–93. Дои:10.1093 / моль · ч / 2.3.185. PMID  9238678.
• Чен Х, Тордова М., Гиллиланд Г.Л., Ван Л., Ли И, Ян Х, Джи Х (май 1998 г.). «Кристаллическая структура апоклеточного белка, связывающего ретиноевую кислоту типа II (R111M), предполагает механизм проникновения лиганда» (PDF). Журнал молекулярной биологии. 278 (3): 641–53. Дои:10.1006 / jmbi.1998.1734. PMID  9600845.
• Ван Л., Ли И, Абильдгаард Ф, Маркли Дж. Л., Ян Х. (сентябрь 1998 г.). «Структура раствора ЯМР человеческого клеточного белка, связывающего ретиноевую кислоту типа II: последствия для связывания лиганда». Биохимия. 37 (37): 12727–36. Дои:10.1021 / bi9808924. PMID  9737849.
• Ван Л., Ян Х (сентябрь 1998 г.). «Исследование ЯМР предполагает важную роль Arg111 в поддержании структуры и динамических свойств человеческого клеточного белка, связывающего ретиноевую кислоту». Биохимия. 37 (37): 13021–32. Дои:10.1021 / bi981021x. PMID  9737883.
• Чаудхури Б.Н., Клейвегт Г.Дж., Брутин-Л'Эрмит I, Бергфорс Т., Сенн Х., Ле Мотт П., Партуш О., Джонс Т.А. (ноябрь 1999 г.). «Структуры клеточных белков, связывающих ретиноевую кислоту I и II в комплексе с синтетическими ретиноидами». Acta Crystallographica Раздел D. 55 (Pt 11): 1850–7. Дои:10.1107 / S0907444999011026. PMID  10531482.
• Будху А.С., Ной Н. (апрель 2002 г.). «Прямая передача ретиноевой кислоты между клеточным белком II, связывающим ретиноевую кислоту, и рецептором ретиноевой кислоты, сенсибилизирует клетки карциномы молочной железы к остановке роста, вызванной ретиноевой кислотой». Молекулярная и клеточная биология. 22 (8): 2632–41. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2632-2641.2002. ЧВК  133717. PMID  11909957.
• Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (февраль 2003 г.). «Циклин D3 является кофактором рецепторов ретиноевой кислоты, модулируя их активность в присутствии клеточного белка II, связывающего ретиноевую кислоту». Журнал биологической химии. 278 (8): 6355–62. Дои:10.1074 / jbc.M210697200. PMID  12482873.
• Беренс Г.М., Геншель Дж., Шмидт Р.Э., Шмидт Х.Х. (май 2003 г.). «Отсутствие мутаций в LMNA, его промоторной области и клеточном белке, связывающем ретиноевую кислоту II (CRABP II) при липодистрофии, связанной с ВИЧ». Европейский журнал медицинских исследований. 8 (5): 221–5. PMID  12844477.
• Ван ден Богэрдт А.Дж., Эль-Гальбзури А., Хенсберген П.Дж., Рейнен Л., Веркерк М., Крун-Смитс М., Мидделкоп Е., Ульрих М.М. (март 2004 г.). «Дифференциальная экспрессия CRABP-II в фибробластах, полученных из дермы и подкожного жира». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 315 (2): 428–33. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.01.069. PMID  14766225.