CRADD - CRADD

CRADD
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2O71, 2OF5, 3CRD
Идентификаторы
Псевдонимы	CRADD, MRT34, RAIDD, CASP2 и домен RIPK1, содержащий адаптер с доменом смерти
Внешние идентификаторы	OMIM: 603454 MGI: 1336168 ГомолоГен: 2821 Генные карты: CRADD
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q22 Начните 93,677,375 бп[1] Конец 93,894,840 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 C2 | 10 49,26 см Начните 95,174,746 бп[2] Конец 95,324,133 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с белками, мостик • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеазы • привязка домена смерти Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • клеточный ответ на механический раздражитель • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • положительная регуляция апоптотического сигнального пути • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • внешний апоптотический сигнальный путь через рецепторы домена смерти • преобразование сигнала • апоптотический процесс • регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция апоптотического процесса • апоптотический сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8738	12905
Ансамбль	ENSG00000169372	ENSMUSG00000045867
UniProt	P78560 Q8IY43	O88843
RefSeq (мРНК)	NM_003805 NM_001320099 NM_001320100 NM_001320101 NM_001330126	NM_009950 NM_001330138 NM_001330141 NM_001330175
RefSeq (белок)	NP_001307028 NP_001307029 NP_001307030 NP_001317055 NP_003796 NP_001307028.1	NP_001317067 NP_001317070 NP_001317104 NP_034080
Расположение (UCSC)	Chr 12: 93,68 - 93,89 Мб	Chr 10: 95.17 - 95.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий домен смерти, CRADD это белок что у людей кодируется CRADD ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является белком, содержащим домен смерти (CARD / DD), и было показано, что он вызывает апоптоз клеток. Через свой домен CARD этот белок взаимодействует с каспазой 2 / ICH1 и, таким образом, рекрутирует ее в комплекс передачи сигнала клеточной смерти, который включает рецептор 1 фактора некроза опухоли (TNFR1A), киназу RIPK1 / RIP и ряд других белков, содержащих домен CARD. .^[7]

Взаимодействия

CRADD был показан взаимодействовать с РИПК1^[5][6] и Caspase 2.^[5][8][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169372 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045867 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Дуан Х., Диксит В.М. (январь 1997 г.). «RAIDD - новая« смертельная »адаптерная молекула» (PDF). Природа. 385 (6611): 86–9. Дои:10.1038 / 385086a0. HDL:2027.42/62739. PMID  8985253. S2CID  4317538.
6. Ахмад М., Сринивасула С.М., Ван Л., Таланян Р.В., Литвак Г., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Е.С. (март 1997 г.). «CRADD, новая человеческая апоптотическая адапторная молекула для каспазы-2 и белок RIP, взаимодействующий с рецептором фактора некроза опухоли». Рак Res. 57 (4): 615–9. PMID  9044836.
7. «Ген Entrez: CRADD CASP2 и домен RIPK1, содержащий адаптер с доменом смерти».
8. Тинель А., Чопп Дж. (Май 2004 г.). «PIDDosome, белковый комплекс, участвующий в активации каспазы-2 в ответ на генотоксический стресс». Наука. 304 (5672): 843–6. Дои:10.1126 / science.1095432. PMID  15073321. S2CID  6583298.
9. Дроин Н., Бошемин М., Солари Е., Бертран Р. (декабрь 2000 г.). «Идентификация изоформы каспазы-2, которая ведет себя как эндогенный ингибитор каскада каспаз». Рак Res. 60 (24): 7039–47. PMID  11156409.

внешняя ссылка

• Человек CRADD расположение генома и CRADD страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Леннон Г., Оффрей С., Полимеропулос М., Соареш МБ (1996). «Консорциум I.M.A.G.E.: комплексный молекулярный анализ геномов и их экспрессии». Геномика. 33 (1): 151–2. Дои:10.1006 / geno.1996.0177. PMID  8617505.
• Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Е., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М (1996). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Genome Res. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Чжоу Дж.Дж., Мацуо Х., Дуан Х., Вагнер Г. (1998). «Структура решения RAIDD CARD и модель взаимодействия CARD / CARD в рекрутинге каспазы-2 и каспазы-9». Ячейка. 94 (2): 171–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81417-8. PMID  9695946. S2CID  16499945.
• Хорват С., Медрано Дж. Ф. (1998). «Контиг YAC и BAC размером 500 т.п.н., включающий быстрорастущую делецию в хромосоме 10 мыши и идентификацию гена Raidd / Cradd мыши в области-кандидате». Геномика. 54 (1): 159–64. Дои:10.1006 / geno.1998.5540. PMID  9806843.
• Ширвин-Уайатт Л.М., Харви Н.Л., Кумар С. (2000). «Субклеточная локализация и CARD-зависимая олигомеризация адаптера смерти RAIDD». Разница в гибели клеток. 7 (2): 155–65. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400632. PMID  10713730.
• Чаудхари П.М., Эби М.Т., Жасмин А., Кумар А., Лю Л., Худ Л. (2000). «Активация пути NF-kappaB каспазой 8 и ее гомологами». Онкоген. 19 (39): 4451–60. Дои:10.1038 / sj.onc.1203812. PMID  11002417.
• Дроин Н., Бошемин М., Солари Е., Бертран Р. (2000). «Идентификация изоформы каспазы-2, которая ведет себя как эндогенный ингибитор каскада каспаз». Рак Res. 60 (24): 7039–47. PMID  11156409.
• Guo Y, Srinivasula SM, Druilhe A, Fernandes-Alnemri T, Alnemri ES (2002). «Каспаза-2 вызывает апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий». J. Biol. Chem. 277 (16): 13430–7. Дои:10.1074 / jbc.M108029200. PMID  11832478.
• Тинель А, Чопп Дж (2004). «PIDDosome, белковый комплекс, участвующий в активации каспазы-2 в ответ на генотоксический стресс». Наука. 304 (5672): 843–6. Дои:10.1126 / science.1095432. PMID  15073321. S2CID  6583298.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Пак ХХ, Ву Х (2006). «Кристаллическая структура домена смерти RAIDD подразумевает потенциальный механизм сборки PIDDosome». J. Mol. Биол. 357 (2): 358–64. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.12.082. ЧВК  2902980. PMID  16434054.
• Вакифахметоглу Х., Олссон М, Оррениус С, Животовский Б. (2006). «Функциональная связь между p53 и каспазой-2 необходима для апоптоза, вызванного повреждением ДНК». Онкоген. 25 (41): 5683–92. Дои:10.1038 / sj.onc.1209569. PMID  16652156.
• Пак ХХ, Ву Х (2007). «Кристаллизация и предварительные рентгеноструктурные исследования комплекса олигомерного домена смерти между PIDD и RAIDD». Acta Crystallographica Раздел F. 63 (Pt 3): 229–32. Дои:10.1107 / S1744309107007889. ЧВК  2330181. PMID  17329820.