CST5 - CST5

Для TC LID CST5 см. Sable Island § Станция Sable Island.

CST5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1RN7, 1ROA
Идентификаторы
Псевдонимы	CST5, цистатин D
Внешние идентификаторы	OMIM: 123858 MGI: 1930004 ГомолоГен: 55615 Генные карты: CST5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p11.21 Начните 23,875,934 бп[1] Конец 23,879,748 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 G3 Начните 149,405,057 бп[2] Конец 149,410,293 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа • связывание протеазы Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточная экзосома • внеклеточный Биологический процесс • отрицательная регуляция активности пептидазы • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа • отрицательная регуляция активности эндопептидазы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1473	58214
Ансамбль	ENSG00000170367	ENSMUSG00000033156
UniProt	P28325	Q9JM84
RefSeq (мРНК)	NM_001900	NM_021405
RefSeq (белок)	NP_001891	NP_067380
Расположение (UCSC)	Chr 20: 23,88 - 23,88 Мб	Chr 2: 149.41 - 149.41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цистатин-D это белок что у людей кодируется CST5 ген.^[5][6]

Суперсемейство цистатина включает белки, которые содержат несколько цистатиноподобных последовательностей. Некоторые из членов являются активными ингибиторами цистеиновой протеазы, в то время как другие утратили или, возможно, никогда не приобрели эту ингибирующую активность. В суперсемействе есть три ингибирующих семейства, включая цистатины 1 типа (стефины), цистатины 2 типа и кининогены. Белки цистатина 2 типа представляют собой класс ингибиторов цистеиновых протеиназ, обнаруженных в различных жидкостях и секретах человека. Локус цистатина на хромосоме 20 содержит большинство генов цистатина 2 типа и псевдогенов. Этот ген расположен в локусе цистатина и кодирует белок, содержащийся в слюне и слезах. Кодируемый белок может играть защитную роль против протеиназ, присутствующих в полости рта.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170367 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033156 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фрейе Дж. П., Абрахамсон М., Олафссон И., Веласко Г., Грабб А., Лопес-Отин С. (декабрь 1991 г.). «Структура и экспрессия гена, кодирующего цистатин D, новый ингибитор цистеиновой протеиназы человека». J Biol Chem. 266 (30): 20538–43. PMID  1939105.
6. «Энтрез Ген: цистатин D CST5».

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: I25.005
• Человек CST5 расположение генома и CST5 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P28325 (Цистатин-Д) в PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Браун WM, Дзегелевская KM (1997). «Друзья и родственники надсемейства цистатинов - новые члены и их эволюция». Белковая наука. 6 (1): 5–12. Дои:10.1002 / pro.5560060102. ЧВК  2143511. PMID  9007972.
• Сайто Э., Исемура С., Санада К. и др. (1989). «Суперсемейство цистатина. Доказательства того, что гены цистатина семейства II эволюционно связаны с генами цистатина семейства III». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 369 Дополнение: 191–7. PMID  3202964.
• Дикинсон Д.П., Тисс М., Демпси Л.Д., Миллар С.Дж. (1993). «Геномное клонирование, физическое картирование и экспрессия генов цистатина 2 типа человека». Крит. Rev. Oral Biol. Med. 4 (3–4): 573–80. Дои:10.1177/10454411930040034401. PMID  7690606.
• Дикинсон Д.П., Чжао Ю., Тисс М., Сицилиано М.Дж. (1995). «Прямое картирование семи генов, кодирующих человеческие цистатины 2-го типа, в один сайт, расположенный в 20p11.2». Геномика. 24 (1): 172–5. Дои:10.1006 / geno.1994.1595. PMID  7896273.
• Бальбин М., Холл А, Грабб А. и др. (1994). «Структурная и функциональная характеристика двух аллельных вариантов человеческого цистатина D, разделяющих характерный спектр ингибирования против цистеиновых протеиназ млекопитающих». J. Biol. Chem. 269 (37): 23156–62. PMID  8083219.
• Тисс М., Миллар С.Дж., Дикинсон Д.П. (1994). «Семейство генов цистатина 2 типа человека состоит из восьми-девяти членов, по крайней мере, из семи генов, сгруппированных в одном локусе на хромосоме 20 человека». ДНК клетки биол. 13 (2): 97–116. Дои:10.1089 / dna.1994.13.97. PMID  8179826.
• Freije JP, Balbín M, Abrahamson M и др. (1993). «Клонирование кДНК цистатина D. человека, характеристика ингибитора, экспрессируемого Escherichia coli, и идентификация нативного белка в слюне». J. Biol. Chem. 268 (21): 15737–44. PMID  8340398.
• Freije JP, Pendás AM, Velasco G, et al. (1993). «Локализация гена цистатина D человека (CST5) на хромосоме 20p11.21 путем гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 62 (1): 29–31. Дои:10.1159/000133438. PMID  8422752.
• Balbín M, Freije JP, Abrahamson M, et al. (1993). «Вариация последовательности гена цистатина D человека, приводящая к аминокислотному (Cys / Arg) полиморфизму на уровне белка». Гм. Genet. 90 (6): 668–9. Дои:10.1007 / BF00202491. PMID  8444475. S2CID  23090315.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Дикинсон Д.П., Тисс М., Хикс М.Дж. (2002). «Экспрессия генов цистатина типа 2 CST1-CST5 в тканях взрослого человека и развивающейся поднижнечелюстной железе». ДНК клетки биол. 21 (1): 47–65. Дои:10.1089/10445490252810311. PMID  11879580.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Альварес-Фернандес М., Лян Ю.Х., Абрахамсон М., Су XD (2005). «Кристаллическая структура человеческого цистатина D, ингибитора цистеинпептидазы с ограниченным профилем ингибирования» (PDF). J. Biol. Chem. 280 (18): 18221–8. Дои:10.1074 / jbc.M411914200. PMID  15728581. S2CID  12151927.