CST7 (ген) - CST7 (gene)

CST7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CH9
Идентификаторы
Псевдонимы	CST7, CMAP, цистатин F
Внешние идентификаторы	OMIM: 603253 MGI: 1298217 ГомолоГен: 37832 Генные карты: CST7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p11.21 Начните 24,949,269 бп[1] Конец 24,959,928 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 G3 Начните 150,570,415 бп[2] Конец 150,578,944 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора пептидазы • активность ингибитора эндопептидазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеазы • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная область • внеклеточный • лизосома • эндосома • поздняя эндосома • мультивезикулярное тело • эндоплазматический ретикулум • аппарат Гольджи • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • отрицательная регуляция активности пептидазы • иммунная реакция • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа • отрицательная регуляция активности эндопептидазы • положительное регулирование миелинизации • ингибирование активности эндопептидазы цистеинового типа • отрицательная регуляция активации микроглиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8530	13011
Ансамбль	ENSG00000077984	ENSMUSG00000068129
UniProt	O76096	O89098
RefSeq (мРНК)	NM_003650	NM_009977
RefSeq (белок)	NP_003641	NP_034107
Расположение (UCSC)	Chr 20: 24.95 - 24.96 Мб	Chr 2: 150,57 - 150,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цистатин-F это белок что у людей кодируется CST7 ген.^[5][6][7]

Суперсемейство цистатина включает белки, которые содержат несколько цистатиноподобных последовательностей. Некоторые из членов являются активными ингибиторами цистеиновой протеазы, в то время как другие утратили или, возможно, никогда не приобрели эту ингибирующую активность. В суперсемействе есть три ингибирующих семейства, включая цистатины 1 типа (стефины), цистатины 2 типа и кининогены. Белки цистатина 2 типа представляют собой класс ингибиторов цистеиновых протеиназ, обнаруженных в различных жидкостях и секретах человека. Этот ген кодирует ингибитор гликозилированной цистеиновой протеазы с предполагаемой ролью в иммунной регуляции посредством ингибирования уникальной мишени в гематопоэтической системе. Экспрессия белка наблюдалась в различных линиях раковых клеток человека, полученных из злокачественных опухолей.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000077984 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068129 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ни Дж., Фернандес М.А., Даниэльссон Л., Чиллакуру Р.А., Чжан Дж., Грабб А., Су Дж., Генц Р., Абрахамсон М. (октябрь 1998 г.). «Цистатин F представляет собой гликозилированный ингибитор цистеиновой протеиназы человека с низкой молекулярной массой». J Biol Chem. 273 (38): 24797–804. Дои:10.1074 / jbc.273.38.24797. PMID  9733783.
6. Halfon S, Ford J, Foster J, Dowling L, Lucian L, Sterling M, Xu Y, Weiss M, Ikeda M, Liggett D, Helms A, Caux C, Lebecque S, Hannum C, Menon S, McClanahan T, Gorman D , Zurawski G (август 1998). «Лейкоцистатин, новый цистатин класса II, избирательно экспрессируемый гемопоэтическими клетками». J Biol Chem. 273 (26): 16400–8. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16400. PMID  9632704.
7. «Ген Entrez: CST7 цистатин F (лейкоцистатин)».

'

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: I25.007
• Человек CST7 расположение генома и CST7 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Браун WM, Дзегелевская KM (1997). «Друзья и родственники надсемейства цистатинов - новые члены и их эволюция». Белковая наука. 6 (1): 5–12. Дои:10.1002 / pro.5560060102. ЧВК  2143511. PMID  9007972.
• Сайто Э., Исемура С., Санада К. и др. (1989). «Суперсемейство цистатина. Доказательства того, что гены цистатина семейства II эволюционно связаны с генами цистатина семейства III». Биол. Chem. Hoppe-Seyler. 369 Дополнение: 191–7. PMID  3202964.
• Тисс М., Миллар С.Дж., Дикинсон Д.П. (1994). «Семейство генов цистатина 2 типа человека состоит из восьми-девяти членов, по крайней мере, из семи генов, сгруппированных в одном локусе на хромосоме 20 человека». ДНК клетки биол. 13 (2): 97–116. Дои:10.1089 / dna.1994.13.97. PMID  8179826.
• Морита М., Ёсиучи Н., Аракава Н., Нисимура С. (1999). «CMAP: новый цистатиноподобный ген, участвующий в метастазировании в печень». Рак Res. 59 (1): 151–8. PMID  9892200.
• Морита М., Хара Й, Тамай Й и др. (2001). «Геномная конструкция и картирование гена CMAP (лейкоцистатин / цистатин F, CST7) и идентификация проксимального нового гена, BSCv (C20orf3)». Геномика. 67 (1): 87–91. Дои:10.1006 / geno.2000.6237. PMID  10945474.
• Журне А, Часовня А, Киффер С. и др. (2001). «К человеческому репертуару моноцитарных лизосомальных белков». Электрофорез. 21 (16): 3411–9. Дои:10.1002 / 1522-2683 (20001001) 21:16 <3411 :: AID-ELPS3411> 3.0.CO; 2-M. PMID  11079561.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Натансон CM, Васселиус Дж, Валлин Х, Абрахамсон М (2003). «Регулируемая экспрессия и внутриклеточная локализация цистатина F в человеческих клетках U937». Евро. J. Biochem. 269 (22): 5502–11. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.03252.x. PMID  12423348.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Капелло Ф., Гатти Э., Камоссетто В. и др. (2004). «Цистатин F секретируется, но искусственная модификация его С-конца может вызвать его нацеливание на эндоциты». Exp. Cell Res. 297 (2): 607–18. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.03.048. PMID  15212960.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Лангерхольк Т., Завасник-Бергант В., Тюрк Б. и др. (2005). «Ингибирующие свойства цистатина F и его локализация в клетках промоноцитов U937». FEBS J. 272 (6): 1535–45. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04594.x. PMID  15752368. S2CID  46239078.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Schüttelkopf AW, Hamilton G, Watts C, van Aalten DM (2006). «Структурные основы редукционно-зависимой активации человеческого цистатина F.» J. Biol. Chem. 281 (24): 16570–5. Дои:10.1074 / jbc.M601033200. PMID  16601115.