CTDSPL - CTDSPL

CTDSPL
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ХХЛ
Идентификаторы
Псевдонимы	CTDSPL, C3orf8, HYA22, PSR1, RBSP3, SCP3, CTD малые фосфатазы, подобные
Внешние идентификаторы	OMIM: 608592 MGI: 1916524 ГомолоГен: 48881 Генные карты: CTDSPL
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3p22.2 Начинать 37,861,880 бп[1] Конец 37,984,469 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F3 Начинать 118,926,453 бп[2] Конец 119,043,998 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • фосфатазная активность • фосфопротеинфосфатазная активность • гидролазная активность • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • молекулярная функция • CTD фосфатазная активность Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • дефосфорилирование • дефосфорилирование белков • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10217	69274
Ансамбль	ENSG00000144677	ENSMUSG00000047409
UniProt	O15194	P58465
RefSeq (мРНК)	NM_005808 NM_001008392	NM_133710
RefSeq (белок)	NP_001008393 NP_005799	NP_598471
Расположение (UCSC)	Chr 3: 37,86 - 37,98 Мб	Chr 9: 118.93 - 119.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CTD малый белок, подобный фосфатазе является фермент что у людей кодируется CTDSPL ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

CTDSPL был показан взаимодействовать с SNAI1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144677 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047409 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исикава С., Кай М., Тамари М., Такеи Ю., Такеучи К., Бандо Х, Ямане И., Огава М., Накамура И. (август 1997 г.). «Анализ последовательности геномной области размером 685 kb на хромосоме 3p22-p21.3, гомозиготно удаленной в клеточной линии карциномы легкого». ДНК Res. 4 (1): 35–43. Дои:10.1093 / днарес / 4.1.35. PMID  9179494.
6. Протопопов А., Кашуба В., Забаровская В.И., Муравенко О.В., Лерман М.И., Клейн Г., Забаровский Е.Р. (январь 2003 г.). «Интегрированная физическая и генная карта области 3,5 МП хромосомы 3p21.3 (AP20), вовлеченной в основные злокачественные новообразования эпителия человека». Рак Res. 63 (2): 404–12. PMID  12543795.
7. «Ген Entrez: CTDSPL CTD (карбоксиконцевой домен, РНК-полимераза II, полипептид А), подобный малой фосфатазе».
8. Ву, Яди; Эверс Б Марк; Чжоу Биньхуа П (январь 2009 г.). «Малый C-концевой домен фосфатазы усиливает активность улитки за счет дефосфорилирования». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 284 (1): 640–8. Дои:10.1074 / jbc.M806916200. ISSN  0021-9258. ЧВК  2610500. PMID  19004823.

дальнейшее чтение

• О'Киф Б., Фонг Й., Чен Д. и др. (2000). «Потребность в киназно-специфическом шаперонном пути в производстве гетеродимера Cdk9 / циклин T1, ответственного за P-TEFb-опосредованную стимуляцию tat транскрипции ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 275 (1): 279–87. Дои:10.1074 / jbc.275.1.279. PMID  10617616.
• Ким Дж. Б., Sharp PA (2001). «Положительный фактор элонгации транскрипции B фосфорилирует hSPT5 и карбоксиконцевой домен РНК-полимеразы II независимо от циклин-зависимой киназы, активирующей киназу». J. Biol. Chem. 276 (15): 12317–23. Дои:10.1074 / jbc.M010908200. PMID  11145967.
• Раманатан Ю., Раджпара С.М., Реза С.М. и др. (2001). «Три киназы карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II демонстрируют различные субстратные предпочтения». J. Biol. Chem. 276 (14): 10913–20. Дои:10.1074 / jbc.M010975200. PMID  11278802.
• Чжоу М., Нехай С., Бхаруча, округ Колумбия, и др. (2002). «TFIIH ингибирует фосфорилирование CDK9 во время транскрипции вируса иммунодефицита человека типа 1». J. Biol. Chem. 276 (48): 44633–40. Дои:10.1074 / jbc.M107466200. PMID  11572868.
• Лин X, Таубе Р., Фуджинага К., Петерлин Б.М. (2002). «P-TEFb, содержащий циклин K и Cdk9, может активировать транскрипцию через РНК». J. Biol. Chem. 277 (19): 16873–8. Дои:10.1074 / jbc.M200117200. PMID  11884399.
• Ким Ю.К., Буржуа К.Ф., Исель С. и др. (2002). «Фосфорилирование карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II с помощью CDK9 непосредственно отвечает за активацию транскрипции, активируемую Tat вируса иммунодефицита человека 1 типа». Мол. Клетка. Биол. 22 (13): 4622–37. Дои:10.1128 / MCB.22.13.4622-4637.2002. ЧВК  133925. PMID  12052871.
• Йео М., Лин П.С., Дахмус М.Э., Гилл Г.Н. (2003). «Новая фосфатаза С-концевого домена РНК-полимеразы II, которая предпочтительно дефосфорилирует серин 5». J. Biol. Chem. 278 (28): 26078–85. Дои:10.1074 / jbc.M301791200. PMID  12721286.
• Пинхеро Р., Лиав П., Бертенс К., Янкулов К. (2004). «Три циклин-зависимые киназы предпочтительно фосфорилируют различные части С-концевого домена большой субъединицы РНК-полимеразы II». Евро. J. Biochem. 271 (5): 1004–14. Дои:10.1111 / j.1432-1033.2004.04002.x. PMID  15009212.
• Кашуба В.И., Ли Дж., Ван Ф. и др. (2004). «RBSP3 (HYA22) представляет собой ген-супрессор опухолей, участвующий в основных злокачественных новообразованиях эпителия». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (14): 4906–11. Bibcode:2004ПНАС..101.4906К. Дои:10.1073 / pnas.0401238101. ЧВК  387347. PMID  15051889.

внешняя ссылка

• CTDSPL расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• CTDSPL детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.