CYTH2 - CYTH2

CYTH2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ПБВ, 1R8M, 1R8Q, 1R8S, 1S9D, 4JMI, 4JMO, 4JWL, 4JXH, 4Л5М, 4Z21
Идентификаторы
Псевдонимы	CYTH2, ARNO, CTS18, CTS18.1, PSCD2, PSCD2L, SEC7L, Sec7p-L, Sec7p-подобный, цитогезин 2, цитогезин-2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602488 MGI: 1334255 ГомолоГен: 32116 Генные карты: CYTH2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начните 48,469,208 бп[1] Конец 48,482,314 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B3 Начните 45,806,637 бп[2] Конец 45,814,581 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • инозитол, 1,4,5-трифосфатное связывание • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • липидное связывание • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • конус роста • клеточная мембрана • проекция клетки • мембрана • Мембрана Гольджи • цитозоль • стык • двухклеточное плотное соединение • соединение клеток Биологический процесс • регуляция передачи сигнала белка ARF • эндоцитоз • организация актинового цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9266	19158
Ансамбль	ENSG00000105443	ENSMUSG00000003269
UniProt	Q99418	P63034
RefSeq (мРНК)	NM_004228 NM_017457	NM_001112701 NM_011181
RefSeq (белок)	NP_004219 NP_059431	NP_001106171 NP_035311
Расположение (UCSC)	Chr 19: 48.47 - 48.48 Мб	Chr 7: 45,81 - 45,81 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитогезин-2 это белок что у людей кодируется CYTH2 ген.^[5][6][7]

Функция

Цитогезин-2 (CYTH2), ранее известный как гомология плэкстрина, Sec7 и coiled / coil домены 2 (PSCD2), является членом семейства цитогезинов. Члены этого семейства имеют идентичную структурную организацию, которая состоит из N-концевого мотива спиральной спирали, центрального домена Sec7 и C-концевого домена гомологии плекстрина (PH). Мотив спиральной спирали участвует в гомодимеризации, домен Sec7 содержит активность белка обмена гуанин-нуклеотид (GEP), а домен PH взаимодействует с фосфолипидами и отвечает за ассоциацию CYTH с мембранами. Члены этого семейства, по-видимому, опосредуют регуляцию сортировки белков и мембранного переноса. CYTH2 проявляет активность GEP in vitro с ARF1, ARF3 и ARF6. Белок CYTH2 на 83% гомологичен CYTH1. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

CYTH2 был показан взаимодействовать с участием Аррестин бета 2^[8] и Аррестин бета 1. ^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105443 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003269 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Коланус В., Нагель В., Шиллер Б., Цайтлманн Л., Годар С., Стокингер Н., Сид Б. (сентябрь 1996 г.). «Связывание интегрина альфа L бета 2 / LFA-1 с ICAM-1, индуцированное цитохезином-1, цитоплазматической регуляторной молекулой». Ячейка. 86 (2): 233–42. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80095-1. PMID  8706128. S2CID  18390795.
6. Шарден П., Пэрис С., Антонни Б., Робино С., Беро-Дюфур С., Джексон С. Л., Шабре М. (1996). «Человеческий фактор обмена для ARF содержит домены гомологии Sec7 и плекстрина». Природа. 384 (6608): 481–4. Дои:10.1038 / 384481a0. PMID  8945478. S2CID  4361989.
7. «Ген Entrez: гомология плекстрина PSCD2, Sec7 и домены 2 спиральной спирали (цитохезин-2)».
8. Claing A, Chen W., Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (ноябрь 2001 г.). «Опосредованная бета-аррестином активация фактора 6 АДФ-рибозилирования и эндоцитоз бета 2-адренорецепторов». J. Biol. Chem. 276 (45): 42509–13. Дои:10.1074 / jbc.M108399200. PMID  11533043.

дальнейшее чтение

• Миччи Э., Цай С.К., Адамик Р., Мосс Дж., Воган М. (1997). «Цитогезин-1, цитозольный гуанин-нуклеотид-обменный белок для фактора ADP-рибозилирования». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (5): 1745–8. Дои:10.1073 / пнас.94.5.1745. ЧВК  19987. PMID  9050849.
• Франк С., Апендер С., Хансен С.Х., Казанова Дж. Э. (1998). «ARNO представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов на фактор ADP-рибозилирования 6». J. Biol. Chem. 273 (1): 23–7. Дои:10.1074 / jbc.273.1.23. PMID  9417041.
• Мосессова Е., Гулбис Дж. М., Гольдберг Дж. (1998). «Структура домена Sec7 фактора обмена гуаниновых нуклеотидов человеческого арно и анализ взаимодействия с ARF GTPase». Ячейка. 92 (3): 415–23. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80933-2. PMID  9476900. S2CID  8093935.
• Cherfils J, Ménétrey J, Mathieu M, Le Bras G, Robineau S, Béraud-Dufour S, Antonny B, Chardin P (1998). «Структура Sec7 домена фактора обмена Arf ARNO». Природа. 392 (6671): 101–5. Дои:10.1038/32210. PMID  9510256. S2CID  4334627.
• Венкатесварлу К., Оати ПБ, Таваре Дж. М., Каллен П. Дж. (1998). «Инсулинозависимая транслокация ARNO к плазматической мембране адипоцитов требует фосфатидилинозитол-3-киназы». Curr. Биол. 8 (8): 463–6. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70181-2. PMID  9550703. S2CID  12974067.
• Ким HS (1998). «Отнесение гена cts18.1 человека PSCD2L к полосе q13 хромосомы 19 с использованием панели радиационного гибридного картирования». Cytogenet. Cell Genet. 83 (1–2): 43. Дои:10.1159/000015163. PMID  9925920. S2CID  31220052.
• Санти Л.С., Фрэнк С.Р., Хатфилд Дж. К., Казанова Дж. Э. (1999). «Регулирование обмена нуклеотидов ARNO с помощью электростатического переключателя PH домена». Curr. Биол. 9 (20): 1173–6. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 80019-6. PMID  10531036. S2CID  17664498.
• Огасавара М., Ким С.К., Адамик Р., Тогава А., Ферранс В.Дж., Такеда К., Кирби М., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Сходства в функции и структуре генов цитогезина-4 и цитогезина-1, белков обмена гуаниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования». J. Biol. Chem. 275 (5): 3221–30. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3221. PMID  10652308.
• Смит Дж. С., Тачибана И., Поль У, Ли Х. К., Танараджасингам У, Портье Б. П., Уэки К., Рамасвами С., Биллингс С. Дж., Моренвайзер Х. У., Луис Д. Н., Дженкинс Р. Б. (2000). «Карта транскриптов области супрессора опухоли глиомы 19q-плеча хромосомы». Геномика. 64 (1): 44–50. Дои:10.1006 / geno.1999.6101. PMID  10708517.
• Витале Н., Пачеко-Родригес Г., Ферранс В.Дж., Рименшнайдер В., Мосс Дж., Воган М. (2000). «Специфическое функциональное взаимодействие человеческого цитохезина-1 и белка домена фактора ADP-рибозилирования (ARD1)». J. Biol. Chem. 275 (28): 21331–9. Дои:10.1074 / jbc.M909642199. PMID  10748148.
• Macia E, Paris S, Chabre M (2000). «Связывание PH и многоосновных C-концевых доменов ARNO с фосфоинозитидами и кислыми липидами». Биохимия. 39 (19): 5893–901. Дои:10.1021 / bi992795w. PMID  10801341.
• Ли С.Ю., Похайдак Б. (2000). «N-концевое нацеливание факторов обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) на факторы рибозилирования ADP (ARF) в Гольджи». J. Cell Sci. 113 (11): 1883–9. PMID  10806099.
• Claing A, Chen W., Miller WE, Vitale N, Moss J, Premont RT, Lefkowitz RJ (2001). «Опосредованная бета-аррестином активация фактора 6 АДФ-рибозилирования и эндоцитоз бета 2-адренорецепторов». J. Biol. Chem. 276 (45): 42509–13. Дои:10.1074 / jbc.M108399200. PMID  11533043.
• Китано Дж., Кимура К., Ямадзаки Ю., Сода Т, Шигемото Р., Накадзима Ю., Наканиши С. (2002). «Тамалин, белок, содержащий домен PDZ, связывает образование белкового комплекса из метаботропных рецепторов глутамата группы 1 и цитохезинов фактора обмена гуаниновых нуклеотидов». J. Neurosci. 22 (4): 1280–9. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-04-01280.2002. ЧВК  6757580. PMID  11850456.
• Мансур М., Ли С.Ю., Похайдак Б. (2002). "N-концевой домен спиральной спирали семейства цитохезин / ARNO факторов обмена гуаниновых нуклеотидов взаимодействует с каркасным белком CASP". J. Biol. Chem. 277 (35): 32302–9. Дои:10.1074 / jbc.M202898200. PMID  12052827.
• Букет-Пояу К., Мехенни Х., Радхакришна У., Антонаракис С.Е. (2002). «Поиск второго локуса синдрома Пейтца-Егерса: исключение генов STK13, PRKCG, KLK10 и PSCD2 на хромосоме 19 и гена STK11IP на хромосоме 2». Cytogenet. Genome Res. 97 (3–4): 171–8. Дои:10.1159/000066620. PMID  12438709. S2CID  36446950.
• Ха М., Хан Дж. Х., Лим С.С., Ли С.Х., Ким С., Ким И, Каанг Б.К. (2003). «Регулирование нейритогенеза и синаптической передачи с помощью msec7-1, фактора обмена гуаниновых нуклеотидов, в культивируемых нейронах аплизии». J. Neurochem. 85 (1): 282–5. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2003.01718.x. PMID  12641750. S2CID  35888745.