CYYR1 - CYYR1

CYYR1
Идентификаторы
ПсевдонимыCYYR1, C21orf95, богатые цистеином и тирозином 1
Внешние идентификаторыOMIM: 616020 MGI: 2152187 ГомолоГен: 14191 Генные карты: CYYR1
Расположение гена (человек)
Хромосома 21 (человека)
Chr.Хромосома 21 (человека)[1]
Хромосома 21 (человека)
Геномное расположение CYYR1
Геномное расположение CYYR1
Группа21q21.3Начинать26,466,209 бп[1]
Конец26,573,286 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CYYR1 gnf1h01221 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

116159

224405

Ансамбль

ENSG00000166265

ENSMUSG00000041134

UniProt

Q96J86

Q8VIH7

RefSeq (мРНК)

NM_052954
NM_001320768

NM_144853

RefSeq (белок)

NP_001307697
NP_443186

NP_659102

Расположение (UCSC)Chr 21: 26,47 - 26,57 МбChr 16: 85,42 - 85,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цистеин и богатый тирозином белок 1 это белок что у людей кодируется CYYR1 ген[5][6][7] и расположен на хромосоме 21, в месте 21q21.2. Этот белок имеет функцию, которая в настоящее время не изучена.

Протеин

Продукт гена однопроходный типа 1 трансмембранный белок с четырьмя экзоны и очень большой интрон 85,8 т.п.н. и кодирует белок, содержащий 154 аминокислоты.[8] Наиболее характерной особенностью, идентифицированной в белке, является центральный, уникальный цистеин и богатый тирозином белковый домен, на части белка, который находится внутри клетки. Было обнаружено, что этот домен сильно консервативен от низших позвоночных (рыб) к человеку, но отсутствует у бактерий и беспозвоночных.[6]

Свойства и домены

Биоинформатика Анализ предсказал следующие свойства для CYYR1:

  • Молекулярный вес = 16,6 кдал
  • Изоэлектрическая точка = 8.28

В аминокислотная последовательность имеет длину 153 аминокислоты и содержит 3 домена.[9]

1 MDAPRLPVRP GVLLPKLVLL FVYADDCLAQ CGKDCKSYCC DGTTPYCCSY51 YAYIGNILSG TAIAGIVFGI VFIMGVIAGI AICICMCMKN HRATRVGILR101 TTHINTVSSY PGPPPYGHDP YGKTPEYLPPGPGPYGHDP

С помощью биоинформатических инструментов были определены следующие области:

Ортологи

Множественное выравнивание последовательностей было выполнено с ортологи гена CYYR1, и они показывают, что последовательность белка высоко консервативна у всех позвоночных.

РазновидностьНомер доступаЛичность
Пан троглодитыXP_001158941.199.2%[10]
Macaca mulattaXP_001104127.195.5%[10]
Mus musculusNP_659102.188.2%[10]
Xenopus laevisNP_001088967.174.3%[10]
Данио РериоNP_998047.160.4%[10]

Нет никаких известных или прогнозируемых паралоги у homo sapiens.

Взаимодействия

Показано, что CYYR1 увеличивает глутатион уровень в дрожжевых клетках при комплементации дефекта захвата GSH дрожжевыми клетками, в которых отсутствует Hgt1p, первичный переносчик захвата GSH дрожжей.[11] Однако ген CYYR1 в природе не встречается у дрожжей, поэтому функция CYYR1 все еще неизвестна.


Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166265 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041134 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Реймонд А., Камарго А.А., Дойч С., Стивенсон Б.Дж., Пармиджани Р.Б., Укла С., Беттони Ф., Россье С., Лайл Р., Гиппони М., де Соуза С., Изели С., Джонженель К.В., Бухер П., Симпсон А.Дж., Антонаракис С.Е. (май 2002). «Девятнадцать дополнительных непредсказуемых транскриптов с 21 хромосомы человека». Геномика. 79 (6): 824–32. Дои:10.1006 / geno.2002.6781. PMID  12036297.
  6. ^ а б Витале Л., Касадей Р., Канайдер С., Лензи Л., Стрипполи П., Д'Аддаббо П., Джанноне С., Каринчи П., Заннотти М. (июнь 2002 г.). «Богатый цистеином и тирозином 1 (CYYR1), новый непредсказуемый ген на хромосоме 21 человека (21q21.2), кодирует богатый цистеином и тирозином белок и определяет новое семейство высококонсервативных генов, специфичных для позвоночных». Ген. 290 (1–2): 141–51. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00550-4. PMID  12062809.
  7. ^ «Энтрез Ген: CYYR1, богатый цистеином / тирозином 1».
  8. ^ а б c d «Предшественник богатого цистеином и тирозином белка 1 - Homo sapiens».
  9. ^ SDSC Biology Workbench 2.0
  10. ^ а б c d е «Цистеин / тирозин-богатый 1 - Homo sapiens».
  11. ^ Ши С., Нотенбум С., Дюмон М.Э., Баллатори Н. (январь 2010 г.). «Идентификация продуктов генов человека, содержащих мотивы Pro-Pro-x-Tyr (PY), которые усиливают поглощение глутатиона и эндоцитотических маркеров дрожжами». Cell Physiol Biochem. 25 (2–3): 293–306. Дои:10.1159/000276570. ЧВК  3030462. PMID  20110690.

дальнейшее чтение