Кеш-домен - Cache domain

Кеш-домен
Идентификаторы
СимволКэш_1
PfamPF02743
Pfam кланCL0165
ИнтерПроIPR004010
Кэш-домен (тип 2)
Идентификаторы
СимволКэш_2
PfamPF08269
Pfam кланCL0165
ИнтерПроIPR013163

В молекулярной биологии домен кеша является внеклеточный белковый домен который, как предполагается, играет роль в распознавании малых молекул в широком спектре белков, включая животное дигидропиридин -чувствительный по напряжению Ca2 + канал альфа-2-дельта-субъединица и различные бактериальный хемотаксис рецепторы. Название Cache происходит от CAlcium каналы и CHEрецепторы мотаксиса. Этот домен состоит из N-концевой часть с тремя предсказанными нитями и альфа-спираль, а С-концевую часть с цепью диада за ним следует относительно неструктурированный регион. N-концевая часть (неперестановочного) домена кэша содержит три прогнозируемых нити, которые могут образовывать лист, аналогичный тому, который присутствует в ядре PAS домен структура. Кеш домены особенно широко распространены у бактерий, таких как Холерный вибрион. Кальциевый канал животных альфа-2-дельта подразделения могли приобрести часть внеклеточного домены из бактериальный источник.[1] Домен кеша, похоже, возник из GAF-PAS. складывать несмотря на их расходящиеся функции.[2]

Рекомендации

  1. ^ Анантараман В., Аравинд Л. (ноябрь 2000 г.). «Кэш - сигнальный домен, общий для субъединиц Са (2 +) - канала животных и класса прокариотических рецепторов хемотаксиса». Trends Biochem. Наука. 25 (11): 535–7. Дои:10.1016 / s0968-0004 (00) 01672-8. PMID  11084361.
  2. ^ Анантараман В., Кунин Е.В., Аравинд Л. (апрель 2001 г.). «Регуляторный потенциал, филетическое распределение и эволюция древних внутриклеточных доменов, связывающих небольшие молекулы». J. Mol. Биол. 307 (5): 1271–92. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4508. PMID  11292341.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR004010
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR013163