Фактор коагуляции XIII, полипептид A1 - Coagulation factor XIII, A1 polypeptide - Wikipedia

F13A1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1EVU, 1EX0, 1F13, 1FIE, 1GGT, 1ГГУ, 1ГГГ, 1QRK, 4KTY
Идентификаторы
Псевдонимы	F13A1, F13A, А-цепь фактора XIII свертывания крови
Внешние идентификаторы	OMIM: 134570 MGI: 1921395 ГомолоГен: 20077 Генные карты: F13A1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п25.1 Начинать 6,144,084 бп[1] Конец 6,321,013 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.3 Начинать 36,867,178 бп[2] Конец 37,050,244 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • белок-глутамин-гамма-глутамилтрансфераза активность • трансферазная активность, перенос ацильных групп • связывание ионов металлов • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • просвет альфа-гранул тромбоцитов • микрочастица крови • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • сшивание пептидов • свертывание крови, образование фибринового сгустка • дегрануляция тромбоцитов • гемостаз • коагуляция крови • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2162	74145
Ансамбль	ENSG00000124491	ENSMUSG00000039109
UniProt	P00488	Q8BH61
RefSeq (мРНК)	NM_000129	NM_001166391 NM_028784
RefSeq (белок)	NP_000120	NP_001159863 NP_083060
Расположение (UCSC)	Chr 6: 6.14 - 6.32 Мб	Chr 13: 36.87 - 37.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор коагуляции XIII A цепь это белок что у людей кодируется F13A1 ген.

Функция

Этот ген кодирует субъединицу XIII фактора свертывания крови. Фактор коагуляции XIII - последний зимоген, который активируется в каскаде свертывания крови. Фактор XIII плазмы представляет собой гетеротетрамер, состоящий из 2 субъединиц A и 2 субъединиц B. Субъединицы А выполняют каталитическую функцию, а субъединицы В не обладают ферментативной активностью и могут служить молекулами-носителями плазмы. Фактор XIII тромбоцитов состоит всего из 2 субъединиц A, которые идентичны субъединицам плазменного происхождения. При расщеплении активирующего пептида тромбином и в присутствии иона кальция фактор XIII плазмы диссоциирует свои субъединицы B и дает такой же активный фермент, фактор XIIIa, что и фактор XIII тромбоцитов. Этот фермент действует как трансглутаминаза, катализируя образование сшивки гамма-глутамил-эпсилон-лизин между молекулами фибрина, таким образом стабилизируя фибриновый сгусток. Он также связывает ингибитор альфа-2-плазмина или фибронектин с альфа-цепями фибрина. Дефицит фактора XIII подразделяется на две категории: дефицит I типа, характеризующийся отсутствием субъединиц A и B; и дефицит типа II, характеризующийся отсутствием только субъединицы A. Эти дефекты могут привести к пожизненной тенденции к кровотечению, неправильному заживлению ран и привычному выкидышу.^[5]

Взаимодействия

Было показано, что полипептид фактора свертывания XIII, A1 взаимодействовать с F13B.^[6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124491 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039109 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор свертывания крови XIII F13A1, полипептид A1».
6. Каррелл Н.А., Эриксон HP, МакДонах Дж. (Январь 1989 г.). «Электронная микроскопия и гидродинамические свойства субъединиц фактора XIII». J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. PMID  2491853.
7. Ачютан К.Э., Роуленд Т.К., Биркбихлер П.Дж., Ли К.Н., Бишоп П.Д., Ачютан А.М. (сентябрь 1996 г.). «Иерархия связывания человеческого фактора XIII, фактора XIIIa и трансглутаминазы эндотелиальных клеток с фибриногеном, фибрином и фибронектином плазмы человека». Мол. Клетка. Биохим. 162 (1): 43–9. Дои:10.1007 / bf00250994. PMID  8905624. S2CID  23583301.

дальнейшее чтение

• Адани Р. (1997). «Внутриклеточный фактор XIII: клеточное распределение субъединицы а фактора XIII у человека». Семин. Тромб. Хемост. 22 (5): 399–408. Дои:10.1055 / с-2007-999038. PMID  8989823.
• Адани Р., Бардош Х (2003). «Субъединица А фактора XIII как внутриклеточная трансглутаминаза». Клетка. Мол. Life Sci. 60 (6): 1049–60. Дои:10.1007 / s00018-003-2178-9. PMID  12861374. S2CID  7831538.
• Берецкий З., Катона Э., Мусбек Л. (2005). «Стабилизация фибрина (фактор XIII), структура фибрина и тромбоз». Патофизиол. Гемост. Тромб. 33 (5–6): 430–7. Дои:10.1159/000083841. PMID  15692256. S2CID  12156307.
• Доска P, Coggan M, Miloszewski K (1992). «Выявление точечной мутации дефицита субъединицы A фактора XIII». Кровь. 80 (4): 937–41. Дои:10.1182 / кровь.V80.4.937.937. PMID  1353995.
• Камура Т., Окамура Т., Муракава М., Цуда Х., Тешима Т., Сибуя Т., Харада М., Нихо Ю. (1992). «Дефицит субъединицы фактора XIII A свертывания крови, вызванный делецией динуклеотида на 5'-конце экзона III». J. Clin. Вкладывать деньги. 90 (2): 315–9. Дои:10.1172 / JCI115864. ЧВК  443104. PMID  1644910.
• Харсфалви Дж., Фесус Л., Тарча Е., Лачко Дж., Лоуи А.Г. (1991). «Присутствие ковалентно сшитой матрицы в тромбоцитах человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1073 (2): 268–74. Дои:10.1016 / 0304-4165 (91) 90131-У. PMID  2009280.
• Бишоп П.Д., Теллер, округ Колумбия, Смит Р.А., Лассер Г.В., Гилберт Т., Сил Р.Л. (1990). «Экспрессия, очистка и характеристика человеческого фактора XIII в Saccharomyces cerevisiae». Биохимия. 29 (7): 1861–9. Дои:10.1021 / bi00459a028. PMID  2184890.
• Hilgenfeld R, Liesum A, Storm R, Metzner HJ, Karges HE (1990). «Кристаллизация фактора свертывания крови XIII с помощью автоматизированной процедуры». FEBS Lett. 265 (1–2): 110–2. Дои:10.1016 / 0014-5793 (90) 80896-Q. PMID  2365049. S2CID  23295980.
• Каррелл Н.А., Эриксон HP, МакДонах Дж. (1989). «Электронная микроскопия и гидродинамические свойства субъединиц фактора XIII». J. Biol. Chem. 264 (1): 551–6. PMID  2491853.
• Такахаши Н., Такахаши Ю., Патнэм Ф.В. (1986). «Первичная структура фактора XIIIa свертывания крови (фибринолигаза, трансглутаминаза) из плаценты человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (21): 8019–23. Bibcode:1986ПНАС ... 83.8019Т. Дои:10.1073 / pnas.83.21.8019. ЧВК  386858. PMID  2877456.
• Grundmann U, Amann E, Zettlmeissl G, Küpper HA (1986). «Характеристика кДНК, кодирующей фактор XIIIa человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (21): 8024–8. Bibcode:1986PNAS ... 83.8024G. Дои:10.1073 / pnas.83.21.8024. ЧВК  386859. PMID  2877457.
• Ичинос А, Дэви Э. У. (1988). «Характеристика гена субъединицы человеческого фактора XIII (трансглутаминазы плазмы), фактора свертывания крови». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 85 (16): 5829–33. Bibcode:1988PNAS ... 85.5829I. Дои:10.1073 / пнас.85.16.5829. ЧВК  281858. PMID  2901091.
• Board PG, Webb GC, McKee J, Ichinose A (1988). «Локализация гена субъединицы фактора XIII свертывания крови (F13A) в полосах хромосомы 6p24 ---- p25». Cytogenet. Cell Genet. 48 (1): 25–7. Дои:10.1159/000132580. PMID  2903011.
• Ичиносе А., Хендриксон Л. Е., Фудзикава К., Дэви Е. В. (1987). «Аминокислотная последовательность субъединицы фактора XIII человека». Биохимия. 25 (22): 6900–6. Дои:10.1021 / bi00370a025. PMID  3026437.
• Такаги Т., Дулиттл Р.Ф. (1974). «Исследования аминокислотной последовательности фактора XIII и пептида, высвобождаемого при его активации тромбином». Биохимия. 13 (4): 750–6. Дои:10.1021 / bi00701a018. PMID  4811064.
• Yee VC, Pedersen LC, Bishop PD, Stenkamp RE, Teller DC (1995). «Структурное свидетельство того, что активационный пептид не высвобождается при расщеплении тромбином фактора XIII». Тромб. Res. 78 (5): 389–97. Дои:10.1016 / 0049-3848 (95) 00072-У. PMID  7660355.
• Когган М., Бейкер Р., Милошевски К., Вудфилд Г., Доска P (1995). «Мутации, вызывающие дефицит субъединицы A фактора XIII: характеристика мутантных белков после экспрессии в дрожжах». Кровь. 85 (9): 2455–60. Дои:10.1182 / blood.V85.9.2455.bloodjournal8592455. PMID  7727776.
• Качмарек Э., Лю Й., Берс Б., Чен С.С., МакДонах Дж. (1995). «Биосинтез фактора XIII плазмы: доказательства транскрипции и трансляции в клетках гепатомы». Биохим. Биофиз. Acta. 1247 (1): 127–34. Дои:10.1016 / 0167-4838 (94) 00167-ф. PMID  7873582.
• Yee VC, Pedersen LC, Le Trong I, Bishop PD, Stenkamp RE, Teller DC (1994). «Трехмерная структура трансглутаминазы: фактор XIII свертывания крови человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (15): 7296–300. Bibcode:1994PNAS ... 91.7296Y. Дои:10.1073 / пнас.91.15.7296. ЧВК  44386. PMID  7913750.
• Сузуки К., Ивата М., Ито С., Мацуи К., Учида А., Мизой Ю. (1994). «Молекулярная основа различий подтипов« а »субъединицы фактора свертывания крови XIII с описанием генезиса подтипов». Гм. Genet. 94 (2): 129–35. Дои:10.1007 / bf00202857. PMID  7913909. S2CID  20800219.