DDO (ген) - DDO (gene)

DDO
Идентификаторы
Псевдонимы	DDO, Ddo, 5330420D20Rik, 5730402C02Rik, AI467244, DASOX, DDO-1, DDO-2, D-аспартатоксидаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 124450 MGI: 1925528 ГомолоГен: 101531 Генные карты: DDO
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начинать 110,391,771 бп[1] Конец 110,415,562 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B1 Начинать 40,630,011 бп[2] Конец 40,681,847 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • Привязка FAD • рецепторное связывание • GO: 0001948 связывание с белками • Активность оксидазы D-аминокислот • Активность D-аспартатоксидазы Сотовый компонент • пероксисома • пероксисомальный матрикс • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • осеменение • личный уход • метаболический процесс аспартата • Процесс обмена D-аминокислот • гормональный метаболический процесс • катаболический процесс аспартата • Катаболический процесс D-аминокислот • окислительно-восстановительный процесс • клеточный процесс обмена азотистых соединений • белок нацелен на пероксисому Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8528	70503
Ансамбль	ENSG00000203797	ENSMUSG00000063428
UniProt	Q99489	Q922Z0
RefSeq (мРНК)	NM_003649 NM_004032	NM_027442 NM_001316716 NM_001316717 NM_001316718 NM_001316719
RefSeq (белок)	NP_004023 NP_001355099 NP_001355100 NP_001355101 NP_001355102 NP_001355103 NP_001355104 NP_001359037	NP_001303645 NP_001303646 NP_001303647 NP_001303648 NP_081718
Расположение (UCSC)	Chr 6: 110.39 - 110.42 Мб	Chr 10: 40.63 - 40.68 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

D-аспартатоксидаза является фермент который закодирован DDO ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой пероксисомальный флавопротеин, который катализирует окислительное дезаминирование D-аспартата и N-метил D-аспартата. Динуклеотид флавинаденин или динуклеотид 6-гидроксифлавинаденин может служить кофактором в этой реакции. Два (или четыре, по Q99489) для этого гена были обнаружены варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000203797 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063428 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сетояма С., Миура Р. (июль 1997 г.). «Структурно-функциональная характеристика D-аспартатоксидазы головного мозга человека». J Biochem. 121 (4): 798–803. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021655. PMID  9163533.
6. «Энтрез Ген: DDO D-аспартатоксидаза».

дальнейшее чтение

• Баркер РФ, Хопкинсон Д.А. (1977). «Генетические и биохимические свойства оксидаз D-аминокислот в тканях человека». Анна. Гм. Genet. 41 (1): 27–42. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1977.tb01959.x. PMID  21608. S2CID  40488767.
• Ван Велдховен П.П., Брис К., Маннаертс Г.П. (1991). «D-аспартатоксидаза, пероксисомальный фермент в печени крысы и человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1073 (1): 203–8. Дои:10.1016 / 0304-4165 (91) 90203-С. PMID  1991137.
• Нагасаки Х (1994). «Гендерные различия D-аспартатоксидазы печени мышей в активности и ответе на введение D-аспартата и пролифераторов пероксисом». Int. J. Biochem. 26 (3): 415–23. Дои:10.1016 / 0020-711X (94) 90062-0. PMID  8187937.
• Симоник Т., Дуга С., Негри А. и др. (1997). «Клонирование кДНК и экспрессия флавопротеин D-аспартатоксидазы из коры почек крупного рогатого скота». Biochem. J. 322 (3): 729–35. Дои:10.1042 / bj3220729. ЧВК  1218248. PMID  9148742.
• Эмери Л., Брис С., Баес М. и др. (1999). «С-концевой трипептид Ser-Asn-Leu (SNL) D-аспартатоксидазы человека является функциональным сигналом нацеливания на пероксисомы». Biochem. J. 336 (2): 367–71. Дои:10.1042 / bj3360367. ЧВК  1219880. PMID  9820813.
• Заар К., Кёст Х.П., Шад А. и др. (2002). «Клеточное и субклеточное распределение D-аспартатоксидазы в мозге человека и крысы». J. Comp. Neurol. 450 (3): 272–82. Дои:10.1002 / cne.10320. PMID  12209855. S2CID  24459809.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.