DEFA4 - DEFA4

DEFA4
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ZMM
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFA4, DEF4, HNP-4, HP-4, HP4, дефенсин альфа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601157 ГомолоГен: 48059 Генные карты: DEFA4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p23.1 Начинать 6,935,820 бп[1] Конец 6,938,306 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • Просвет Гольджи • внеклеточная область • азурофильная гранула • внеклеточный • специфический просвет гранулы Биологический процесс • ответ защиты • защитный ответ на бактерию • дегрануляция нейтрофилов • врожденная иммунная система • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • Хемотаксис Т-клеток • антимикробный гуморальный ответ • убийство клеток другого организма • защитная реакция на грибок • врожденный иммунный ответ слизистой оболочки • антибактериальный гуморальный ответ • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • защитный ответ на грамположительные бактерии • нарушение мембраны в другом организме • клеточный ответ на липополисахарид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1669	н / д
Ансамбль	ENSG00000164821 ENSG00000285318	н / д
UniProt	P12838	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001925	н / д
RefSeq (белок)	NP_001916	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 8: 6.94 - 6.94 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Дефенсин, альфа 4 (DEFA4), также известный как нейтрофильный дефенсин 4 или же HNP4, это человек дефенсин пептид который закодирован DEFA4 ген.^[3][4] HNP4 выражается в гранулы из нейтрофил где он защищает хозяина от бактерии^[5] и вирусы.^[6]

Функция

Дефенсины - это пептид семья цитотоксический микробициды участвует в врожденный иммунитет.^[7] Члены семейства дефенсинов отличаются консервативным шести-цистеин мотив. Несколько генов альфа-дефенсина человека, включая HNP4, сгруппированы на хромосома 8. DEFA4 отличается от других генов дефенсина дополнительным сегментом из 83 оснований, который, по-видимому, является результатом недавней дупликации в кодирующей области. HNP4 подавляет кортикотропин -стимулированный кортикостерон производство.^[3]

Рекомендации

1. ENSG00000285318 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164821, ENSG00000285318 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Энтрез Ген: DEFA4; дефенсин, альфа 4, кортикостатин (Homo sapiens)".
4. Ву З., Эриксен Б., Такер К. и др. (2004). «Синтез и характеристика человеческих альфа-дефенсинов 4-6». J Pept Res. 64 (3): 118–25. Дои:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID  15317502.
5. Эриксен Б., Ву З., Лу В., Лерер Р.И. (2005). «Антибактериальная активность и специфичность шести α-дефенсинов человека». Антимикробный. Агенты Chemother. 49 (1): 269–75. Дои:10.1128 / AAC.49.1.269-275.2005. ЧВК  538877. PMID  15616305.
6. Ву З., Кокки Ф., Джентлз Д. и др. (3 января 2005 г.). «Человеческий нейтрофильный альфа-дефенсин 4 ингибирует инфицирование ВИЧ-1 in vitro». FEBS Lett. 579 (1): 162–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.11.062. PMID  15620707. S2CID  84062495.
7. Т Ганц; M E Selsted; D Szklarek; и другие. (1985). «Дефенсины. Природные пептидные антибиотики нейтрофилов человека». J Clin Invest. 76 (4): 1427–1435. Дои:10.1172 / JCI112120. ЧВК  424093. PMID  2997278.

дальнейшее чтение

• Шик А., Ву З., Такер К. и др. (2006). «Кристаллические структуры α-дефенсинов человека HNP4, HD5 и HD6». Белковая наука. 15 (12): 2749–60. Дои:10.1110 / пс 062336606. ЧВК  2242434. PMID  17088326.
• Мэллоу Э. Б., Харрис А., Зальцман Н. и др. (1996). «Кишечные дефенсины человека. Структура генов и проявления в процессе развития». J. Biol. Chem. 271 (8): 4038–45. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4038. PMID  8626737.
• Бевинс К.Л., Джонс Д.Е., Дутра А. и др. (1996). «Гены кишечного дефенсина человека: положение на хромосомной карте и модель возможных эволюционных взаимоотношений». Геномика. 31 (1): 95–106. Дои:10.1006 / geno.1996.0014. PMID  8808285.
• Габай Дж. Э., Скотт Р. В., Кампанелли Д. и др. (1989). «Антибиотические белки полиморфно-ядерных лейкоцитов человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (14): 5610–4. Дои:10.1073 / pnas.86.14.5610. ЧВК  297672. PMID  2501794.
• Davila S, Froeling FE, Tan A, et al. (2010). «Новые генетические ассоциации, обнаруженные в исследовании реакции хозяина на вакцину против гепатита В». Гены иммунной. 11 (3): 232–8. Дои:10.1038 / gene.2010.1. PMID  20237496.
• Ким Э, Ли Дж., Намкунг Дж. Х. и др. (2009). «Однонуклеотидные полиморфизмы и гаплотип в гене DEFB1 связаны с атопическим дерматитом в корейской популяции». J. Dermatol. Наука. 54 (1): 25–30. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2008.12.005. PMID  19135873.
• Milanese M, Segat L, Arraes LC и др. (2009). «Вариация числа копий генов дефенсина и ВИЧ-инфекция у бразильских детей». J. Acquir. Иммунодефицит. Syndr. 50 (3): 331–3. Дои:10.1097 / QAI.0b013e3181945f39. PMID  19194307. S2CID  33161105.
• Палфри Р.Г., Садро Л.С., Соломон С. (1993). «Ген, кодирующий предшественник человеческого кортикостатина HP-4, содержит недавнюю дупликацию 86 оснований и расположен на хромосоме 8». Мол. Эндокринол. 7 (2): 199–205. Дои:10.1210 / me.7.2.199. PMID  8469233.
• Фурчи Л., Сирони Ф., Толацци М. и др. (2007). «Альфа-дефенсины блокируют ранние стадии инфицирования ВИЧ-1: вмешательство в связывание gp120 с CD4». Кровь. 109 (7): 2928–35. Дои:10.1182 / кровь-2006-05-024489. PMID  17132727.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Уайлд К.Г., Гриффит Дж. Э., Марра М. Н. и др. (1989). «Очистка и характеристика человеческого нейтрофильного пептида 4, нового члена семейства дефенсинов». J. Biol. Chem. 264 (19): 11200–3. PMID  2500436.
• Сингх А., Бейтман А., Чжу QZ и др. (1988). «Структура нового пептида гранулоцитов человека с активностью против АКТГ». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 155 (1): 524–9. Дои:10.1016 / S0006-291X (88) 81118-5. PMID  2843187.
• Кониши К., Гибсон К.Ф., Линделл К.О. и др. (2009). «Профили экспрессии генов острых обострений идиопатического фиброза легких». Являюсь. J. Respir. Крит. Care Med. 180 (2): 167–75. Дои:10.1164 / rccm.200810-1596OC. ЧВК  2714820. PMID  19363140.
• Emonts M, Vermont CL, Houwing-Duistermaat JJ, et al. (2009). «Полиморфизмы PARP, IL1B, IL4, IL10, C1INH, DEFB1 и DEFA4 при менингококковой инфекции в трех популяциях». Шок (Августа, Джорджия). 34 (1): 17–22. Дои:10.1097 / SHK.0b013e3181ce2c7d. PMID  20016407. S2CID  21743951.