DEFA5 - DEFA5

DEFA5
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4Э82, 4Э83, 4Э86, 4RBW, 4RBX, 5КУМ, 5CUJ, 5CUI
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFA5, DEF5, HD-5, дефенсин альфа 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 600472 ГомолоГен: 128604 Генные карты: DEFA5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p23.1 Начинать 7,055,304 бп[1] Конец 7,056,739 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • Просвет Гольджи • просвет секреторной гранулы • транспортная везикула • цитоплазматический пузырек • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • ответ защиты • защитный ответ на бактерию • защитная реакция на грибок • антимикробный гуморальный ответ • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • врожденная иммунная система • положительное регулирование проницаемости мембраны • убийство клеток другого организма • врожденный иммунный ответ слизистой оболочки • антибактериальный гуморальный ответ • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • защитный ответ на грамположительные бактерии • нарушение мембраны в другом организме • клеточный ответ на липополисахарид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1670	н / д
Ансамбль	ENSG00000164816 ENSG00000285251	н / д
UniProt	Q01523	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_021010	н / д
RefSeq (белок)	NP_066290	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 8: 7.06 - 7.06 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Дефенсин, альфа 5 (DEFA5) также известный как человеческий альфа-дефенсин 5 (HD5) человек белок который закодирован DEFA5 ген.^[3][4] DEFA5 выражается в Клетки Панета из подвздошная кишка.^[5]

Defensins представляют собой семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, которые, как считается, участвуют в защите хозяина. Их много в гранулах нейтрофилов, а также они обнаруживаются в эпителии слизистых оболочек, таких как кишечник, дыхательные пути, мочевыводящие пути и влагалище. Члены семейства дефенсинов очень похожи по белковой последовательности и отличаются консервативным цистеиновым мотивом. Несколько человек альфа-дефенсин гены, по-видимому, сгруппированы на хромосоме 8. Кодируемый этим геном белок дефенсин альфа 5 высоко экспрессируется в секреторных гранулах клеток Панета подвздошной кишки.^[3]

Рекомендации

1. ENSG00000285251 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164816, ENSG00000285251 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ген Entrez: дефенсин DEFA5, альфа 5, специфичный для клеток Панета».
4. Джонс Д.Е., Бевинс С.Л. (январь 1993 г.). «МРНК дефенсина-6 в человеческих клетках Панета: значение антимикробных пептидов в защите кишечника человека от хозяина». FEBS Lett. 315 (2): 187–92. Дои:10.1016/0014-5793(93)81160-2. PMID  8417977. S2CID  45099115.
5. Чжао С., Ван И., Лерер Р.И. (24 ноября 1996 г.). «Широко распространенная экспрессия бета-дефенсина hBD-1 в секреторных железах человека и эпителиальных клетках». FEBS Lett. 396 (2–3): 319–22. Дои:10.1016/0014-5793(96)01123-4. PMID  8915011. S2CID  22367037.

дальнейшее чтение

• Мэллоу Э. Б., Харрис А., Зальцман Н. и др. (1996). «Кишечные дефенсины человека. Структура генов и проявления в процессе развития». J. Biol. Chem. 271 (8): 4038–45. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4038. PMID  8626737.
• Бевинс К.Л., Джонс Д.Е., Дутра А. и др. (1996). «Гены кишечного дефенсина человека: положение на хромосомной карте и модель возможных эволюционных взаимоотношений». Геномика. 31 (1): 95–106. Дои:10.1006 / geno.1996.0014. PMID  8808285.
• Портер Э.М., Лю Л., Орен А. и др. (1997). «Локализация дефенсина 5 кишечника человека в гранулах клеток Панета». Заразить. Иммунная. 65 (6): 2389–95. Дои:10.1128 / IAI.65.6.2389-2395.1997. ЧВК  175331. PMID  9169779.
• Куэйл А.Дж., Портер Э.М., Нуссбаум А.А. и др. (1998). «Экспрессия генов, иммунолокализация и секреция человеческого дефенсина-5 в женских половых путях человека». Являюсь. Дж. Патол. 152 (5): 1247–58. ЧВК  1858596. PMID  9588893.
• Гош Д., Портер Э., Шен Б. и др. (2002). «Трипсин клеток Панета является процессирующим ферментом дефенсина-5 человека». Nat. Иммунол. 3 (6): 583–90. Дои:10.1038 / ni797. PMID  12021776. S2CID  22022089.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Зальцман Н.Х., Гош Д., Хаттнер К.М. и др. (2003). «Защита от кишечного сальмонеллеза у трансгенных мышей, экспрессирующих человеческий дефенсин кишечника». Природа. 422 (6931): 522–6. Дои:10.1038 / природа01520. PMID  12660734. S2CID  1096692.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Шик А., Ву З., Такер К. и др. (2006). «Кристаллические структуры альфа-дефенсинов человека HNP4, HD5 и HD6». Белковая наука. 15 (12): 2749–60. Дои:10.1110 / пс 062336606. ЧВК  2242434. PMID  17088326.
• Ву З., Эриксен Б., Такер К. и др. (2004). «Синтез и характеристика человеческих альфа-дефенсинов 4-6». J Pept Res. 64 (3): 118–25. Дои:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID  15317502.
• де Лиу Э., Буркс С.Р., Ли Х и др. (2007). «Структурно-зависимые функциональные свойства человеческого дефенсина 5». FEBS Lett. 581 (3): 515–20. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.12.036. ЧВК  1832120. PMID  17250830.