DEFB106A - DEFB106A

DEFB106A
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2LWL
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFB106A, BD-6, DEFB-6, DEFB106, дефенсин бета 106A
Внешние идентификаторы	ГомолоГен: 134659 Генные карты: DEFB106A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p23.1 Начинать 7,825,139 бп[1] Конец 7,829,053 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • липополисахаридное связывание • связывание гепарина • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с хемокиновым рецептором CCR2 Сотовый компонент • внеклеточная область • ядро клетки • поверхность клетки • внешний компонент мембраны • микровезикула • мембрана Биологический процесс • ответ защиты • защитный ответ на бактерию • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	245909	н / д
Ансамбль	ENSG00000186579 ENSG00000285617	н / д
UniProt	Q8N104	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_152251	н / д
RefSeq (белок)	NP_689464	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 8: 7,83 - 7,83 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Бета-дефенсин 106 это белок что у людей кодируется DEFB106A ген.^[3][4]

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, производимых нейтрофилами. Дефенсины - это короткие процессированные пептидные молекулы, которые по структуре классифицируются на три группы: альфа-дефенсины, бета-дефенсины и тета-дефенсины. Все гены бета-дефенсина плотно сгруппированы в четырех-пяти синтенных хромосомных областях. Хромосома 8p23 содержит по крайней мере две копии дублированного кластера бета-дефенсина. Это дублирование приводит к двум идентичным копиям дефенсина, бета 106, DEFB106A и DEFB106B, в ориентации голова к голове. Этот ген, DEFB106A, представляет собой более центромерную копию.^[4]

Функция

Очищенный DEFB106 показал антимикробную активность против кишечная палочка, грибковые микроорганизмы албиканс и Золотистый стафилококк.^[5]

Рекомендации

1. ENSG00000285617 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186579, ENSG00000285617 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Schutte BC, Mitros JP, Bartlett JA, Walters JD, Jia HP, Welsh MJ, Casavant TL, McCray PB Jr (февраль 2002 г.). «Открытие пяти кластеров консервативных генов бета-дефенсина с использованием стратегии компьютерного поиска». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (4): 2129–33. Дои:10.1073 / pnas.042692699. ЧВК  122330. PMID  11854508.
4. «Энтрез Ген: дефенсин DEFB106A, бета 106A».
5. Синь А (январь 2014 г.). «Растворимая гибридная экспрессия, характеристика и локализация человеческого β-дефенсина 6 ...» Мол Мед Реп. 9 (1): 149–55. Дои:10.3892 / mmr.2013.1768. PMID  24189797.

дальнейшее чтение

• Ямагути Ю., Нагасе Т., Макита Р. и др. (2002). «Идентификация множества новых изоформ бета-дефенсина, специфичных для придатка яичка, у людей и мышей». J. Immunol. 169 (5): 2516–23. Дои:10.4049 / jimmunol.169.5.2516. PMID  12193721.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Као CY, Chen Y, Zhao YH, Wu R (2003). «Поиск на основе ORFeome новых генов человеческого β-дефенсина, специфичных для эпителиальных клеток дыхательных путей». Являюсь. J. Respir. Cell Mol. Биол. 29 (1): 71–80. CiteSeerX  10.1.1.108.7808. Дои:10.1165 / rcmb.2002-0205OC. PMID  12600824.
• Семпл CA, Рольф М., Дорин-младший (2003). «Дублирование и отбор в эволюции генов бета-дефенсина приматов». Геном Биол. 4 (5): R31. Дои:10.1186 / gb-2003-4-5-r31. ЧВК  156587. PMID  12734011.
• Холлокс EJ, Armor JA, Barber JC (2003). «Обширная вариация нормального числа копий кластера антимикробных генов бета-дефенсина». Являюсь. J. Hum. Genet. 73 (3): 591–600. Дои:10.1086/378157. ЧВК  1180683. PMID  12916016.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Таудиен С., Галгоци П., Хусе К. и др. (2006). «Полиморфные сегментарные дупликации в 8p23.1 затрудняют определение индивидуальных репертуаров генов дефенсина и сборку непрерывной контрольной последовательности человека». BMC Genomics. 5 (1): 92. Дои:10.1186/1471-2164-5-92. ЧВК  544879. PMID  15588320.
• Бониотто М., Вентура М., Эскдейл Дж. И др. (2005). «Доказательства дупликации гена дефенсина человека DEFB4 в хромосомной области 8p22-23 и значение для анализа распределения аллелей SNP». Genet. Тест. 8 (3): 325–7. Дои:10.1089 / gte.2004.8.325. PMID  15727258.
• Патил А.А., Цай Й, Сан И и др. (2006). «Межвидовой анализ семейства генов бета-дефенсина млекопитающих: наличие кластеров синтенных генов и преимущественная экспрессия в мужском репродуктивном тракте». Physiol. Геномика. 23 (1): 5–17. Дои:10.1152 / физиолгеномика.00104.2005. PMID  16033865.