DLGAP4 - DLGAP4

DLGAP4
Идентификаторы
Псевдонимы	DLGAP4, DAP-4, DAP4, DLP4, SAPAP-4, SAPAP4, большой гомолог, связанный с дисками, белок 4, связанный с DLG белок 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 616191 MGI: 2138865 ГомолоГен: 8935 Генные карты: DLGAP4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.23 Начните 36,306,336 бп[1] Конец 36,528,637 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H1 Начните 156,613,705 бп[2] Конец 156,764,363 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена Сотовый компонент • мембрана • клеточная мембрана • синапс • нервномышечное соединение • глутаматергический синапс • холинергический синапс • постсинаптическая специализация Биологический процесс • сигнализация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	22839	228836
Ансамбль	ENSG00000080845	ENSMUSG00000061689
UniProt	Q9Y2H0	B1AZP2
RefSeq (мРНК)	NM_001042486 NM_014902 NM_183006 NM_001365621	NM_001042487 NM_001042488 NM_001277186 NM_001277187 NM_146128
RefSeq (белок)	NP_001035951 NP_055717 NP_892118 NP_001352550	NP_001035952 NP_001035953 NP_001264115 NP_001264116 NP_666240
Расположение (UCSC)	Chr 20: 36.31 - 36.53 Мб	Chr 2: 156.61 - 156.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Диски большой ассоциированный белок 4 (DAP-4) также известный как SAP90 / PSD-95-ассоциированный белок 4 (SAPAP-4) - это белок что у людей кодируется DLGAP4 ген.^[5][6]

Функция

DAP-4 представляет собой мембранно-связанный гуанилаткиназа найдено в постсинаптический плотность в нейрональные клетки. Это сигнальная молекула, которая может взаимодействовать с калиевые каналы и рецепторы, а также другие сигнальные молекулы. DAP-4 может взаимодействовать с PSD-95 через свой домен гуанилаткиназы и может участвовать в кластеризации PSD-95 в области постсинаптической плотности. Кодируемый белок является одним из по меньшей мере четырех обнаруженных подобных белков. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000080845 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061689 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Такеучи М., Хата Й, Хирао К., Тойода А., Ирие М., Такай И. (июнь 1997 г.). «SAPAPs. Семейство белков, связанных с PSD-95 / SAP90, локализованных в постсинаптической плотности». J Biol Chem. 272 (18): 11943–51. Дои:10.1074 / jbc.272.18.11943. PMID  9115257.
6. «Ген Entrez: диски DLGAP4, большой (Drosophila) гомолог-ассоциированный белок 4».

дальнейшее чтение

• Ким Дж. Х., Ляо Д., Лау Л. Ф., Хуганир Р. Л. (1998). «SynGAP: синаптический RasGAP, который ассоциируется с семейством белков PSD-95 / SAP90». Нейрон. 20 (4): 683–91. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 81008-9. PMID  9581761. S2CID  12247592.
• Чен Х. Дж., Рохас-Сото М., Огуни А., Кеннеди МБ (1998). «Синаптический белок, активирующий Ras-GTPase (p135 SynGAP), ингибируемый киназой II CaM». Нейрон. 20 (5): 895–904. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80471-7. PMID  9620694. S2CID  14655729.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (1): 63–70. Дои:10.1093 / днарес / 6.1.63. PMID  10231032.
• Кавабе Х., Хата Ю., Такеучи М. и др. (1999). «nArgBP2, новый нервный член семейства понсин / ArgBP2 / винексин, который взаимодействует с синапс-ассоциированным белком 90 / постсинаптической плотностью-95-ассоциированным белком (SAPAP)». J. Biol. Chem. 274 (43): 30914–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30914. PMID  10521485.
• Husi H, Ward MA, Choudhary JS и др. (2000). «Протеомный анализ сигнальных комплексов рецептор NMDA-белок адгезии». Nat. Неврологи. 3 (7): 661–9. Дои:10.1038/76615. HDL:1842/742. PMID  10862698. S2CID  14392630.
• Пей Л., Тевес Р.Л., Уоллес М.К., Гурд Дж. В. (2001). «Преходящая церебральная ишемия увеличивает фосфорилирование тирозина синаптического белка, активирующего RAS-GTPase, SynGAP». J. Cereb. Метаб кровотока. 21 (8): 955–63. Дои:10.1097/00004647-200108000-00008. PMID  11487731.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Рифлер Г.М., Баласингам Дж., Лукас К.Г. и др. (2003). «Субъединица комплекса экзоцисты sec8 связывается с белком постсинаптической плотности-95 (PSD-95): новое взаимодействие, регулируемое ципином (цитозольный блокатор PSD-95)». Biochem. J. 373 (Чт. 1): 49–55. Дои:10.1042 / BJ20021838. ЧВК  1223477. PMID  12675619.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Песня B, Ян XB, Чжан GY (2004). «PSD-95 способствует катализируемому CaMKII фосфорилированию серина синаптического белка SynGAP, активирующего RAS-GTPase, после временной ишемии мозга в гиппокампе крысы». Мозг Res. 1005 (1–2): 44–50. Дои:10.1016 / j.brainres.2004.01.032. PMID  15044063. S2CID  33854259.
• Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.