DMBT1 - DMBT1

DMBT1
Идентификаторы
Псевдонимы	DMBT1, GP340, муклин, SAG, удаленный в злокачественных опухолях головного мозга 1, SALSA
Внешние идентификаторы	OMIM: 601969 MGI: 106210 ГомолоГен: 68990 Генные карты: DMBT1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q26.13 Начинать 122,560,665 бп[1] Конец 122,643,740 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F3 Начинать 131,032,046 бп[2] Конец 131,121,628 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0008329 активность рецептора распознавания образов • кальций-зависимое связывание с белками • GO: 0001948 связывание с белками • связывание зимогена • липополисахаридное связывание • Связывание ДНК • активность рецептора поглотителя • связывание липотейхоевой кислоты • связывание гепарансульфата Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана фагоцитарных везикул • мембрана • мембрана из гранул зимогена • внеклеточная область • внеклеточная экзосома • внешний компонент мембраны • внеклеточный • внешняя сторона плазматической мембраны • внеклеточный матрикс Биологический процесс • метаболический процесс клеточного белка • дифференциация клеток • дифференцировка эпителиальных клеток • развитие многоклеточного организма • защитный ответ на вирус • транспорт белка • врожденная иммунная система • GO: 0022415 вирусный процесс • сигнальный путь рецептора распознавания образов • рецептор-опосредованного эндоцитоза • транспорт • индукция бактериальной агглютинации • защитный ответ на грамотрицательные бактерии • защитный ответ на грамположительные бактерии • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • везикулярный транспорт • эндоцитоз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1755	12945
Ансамбль	ENSG00000187908	ENSMUSG00000047517
UniProt	Q9UGM3	Q60997
RefSeq (мРНК)	NM_004406 NM_007329 NM_017579 NM_001320644 NM_001377530	NM_007769 NM_001347632
RefSeq (белок)	NP_001307573 NP_004397 NP_015568 NP_060049	NP_001334561 NP_031795
Расположение (UCSC)	Chr 10: 122,56 - 122,64 Мб	Chr 7: 131.03 - 131.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Удален при злокачественных опухолях головного мозга 1 белок это белок что у людей кодируется DMBT1 ген.^[5][6]

Функция

Утрата последовательностей хромосомы 10q человека была связана с прогрессированием рака человека. Ген DMBT1 был первоначально выделен на основании его делеции в клеточной линии медуллобластомы. DMBT1 экспрессируется с транскриптами размером 6,0, 7,5 и 8,0 т.п.н. в легком плода и с одним транскриптом размером 8,0 т.п.н. в легком взрослого человека, хотя транскрипт в 7,5 т.п.н. Белок DMBT1 представляет собой гликопротеин, содержащий несколько доменов, богатых цистеином (SRCR) рецепторов-поглотителей, разделенных доменами с вкраплениями SRCR (SID). Было показано, что вариант транскрипта 2 (8,0 т.п.н.) связывает сурфактантный белок D независимо от распознавания углеводов. Это указывает на то, что DMBT1 может не быть классическим геном-супрессором опухоли, а скорее играет роль во взаимодействии опухолевых клеток и иммунной системы.^[7]

Распознавание образов и потенциальное использование DMBT1 в наномедицине

На эпителиальных барьерах молекулярные механизмы распознавания образов действуют как тральщики против вредных факторов окружающей среды и, таким образом, играют решающую роль в защите от вторжения бактериальных и вирусных патогенов. Однако стало очевидно, что некоторые из белков, участвующих в этих защитных процессах хозяина, могут одновременно функционировать как регуляторы регенерации тканей во внеклеточном матриксе, таким образом связывая защитные функции с регуляцией стволовых клеток. Хотя распознавание молекулярных образов выполняет сложные физиологические роли, и мы только начинаем понимать его различные функции, простота основных принципов распознавания определенных классов молекул может создать новые отправные точки для наномедицинских подходов к доставке лекарств через эпителиальные барьеры. Белок DMBT1 показал активность распознавания образов в отношении полисульфатированных и полифосфорилированных лигандов, включая нуклеиновые кислоты, и способность агрегировать лиганды. Это поднимает интересный вопрос о том, насколько эти свойства могут быть использованы для сборки нанокомплексов нуклеиновых кислот и пептидов, и можно ли это использовать для модуляции фармакологических свойств нуклеиновых кислот и / или для доставки нуклеиновых кислот в клетки-мишени. ^[8] Недавно пептиды, производные от DMBT1, были успешно использованы для внутриклеточной доставки siRNA. ^[9]

Взаимодействия

DMBT1 был показан взаимодействовать с Поверхностно-активное вещество протеин D.^[10][11] Пептиды, производные от DMBT1, также взаимодействуют с нуклеиновыми кислотами. ^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187908 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000047517 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Молленхауэр Дж, Виманн С., Шерлен В., Корн Б., Хаяши Ю., Вильгенбус К.К., фон Даймлинг А., Поустка А. (октябрь 1997 г.). «DMBT1, новый член суперсемейства SRCR, на хромосоме 10q25.3-26.1 удален при злокачественных опухолях головного мозга». Nat. Genet. 17 (1): 32–9. Дои:10.1038 / ng0997-32. PMID  9288095. S2CID  5274568.
6. Rosenstiel P, Sina C, End C, Renner M, Lyer S, Till A, Hellmig S, Nikolaus S, Fölsch UR, Helmke B, Autschbach F, Schirmacher P, Kioschis P, Hafner M, Poustka A, Mollenhauer J, Schreiber S (Июнь 2007 г.). «Регулирование DMBT1 через NOD2 и TLR4 в кишечных эпителиальных клетках модулирует распознавание и инвазию бактерий». J. Immunol. 178 (12): 8203–11. Дои:10.4049 / jimmunol.178.12.8203. PMID  17548659.
7. «Ген Entrez: DMBT1 удален в злокачественных опухолях головного мозга 1».
8. Казелла, Чинция; Туттоломондо, Мартина; Хойлунд-Карлсен, Пол Флемминг; Молленхауэр, янв (01.01.2014). «Естественные механизмы распознавания образов на эпителиальных барьерах и потенциальное использование в наномедицине». Европейский журнал наномедицины. 6 (3). Дои:10.1515 / ejnm-2014-0020. ISSN  1662-596X. S2CID  84103470.
9. Туттоломондо, Мартина; Казелла, Чинция; Хансен, Пернилле Лунд; Поло, Эстер; Herda, Luciana M .; Dawson, Kenneth A .; Ditzel, Henrik J .; Молленхауэр, янв (2017). "Человеческие DMBT1-производные проникающие в клетки пептиды для внутриклеточной доставки siRNA". Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты. 8: 264–276. Дои:10.1016 / j.omtn.2017.06.020. ISSN  2162-2531. ЧВК  5514624. PMID  28918028.
10. Тино MJ, Райт JR (1999). «Гликопротеин-340 связывает сурфактантный белок-A (SP-A) и стимулирует миграцию альвеолярных макрофагов SP-A-независимым образом». Являюсь. J. Respir. Cell Mol. Биол. 20 (4): 759–68. Дои:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID  10101009.
11. Холмсков У., Лоусон П., Тейснер Б., Торное И., Уиллис А.С., Морган С., Кох С., Рид КБ (1997). «Выделение и характеристика нового члена суперсемейства рецепторов скавенджеров, гликопротеина-340 (gp-340), в качестве молекулы, связывающей белок D сурфактанта легких». J. Biol. Chem. 272 (21): 13743–9. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID  9153228.

дальнейшее чтение

• Канг В., Рид КБ (2003). «DMBT1, регулятор гомеостаза слизистой оболочки посредством связывания защиты слизистой оболочки и регенерации?». FEBS Lett. 540 (1–3): 21–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00217-5. PMID  12681477. S2CID  36334379.
• Робби С., Параскева С., Молленхауэр Дж., Михальски Дж. С., Серджи С., Корфилд А. (2005). «Экспрессия DMBT1 и гликозилирование во время последовательности аденома-карцинома при колоректальном раке». Biochem. Soc. Транс. 33 (Пт 4): 730–2. Дои:10.1042 / BST0330730. PMID  16042587.
• Рашид Б.К., МакЛендон Р.Э., Фридман Х.С., Фридман А.Х., Фукс Х.Э., Бигнер Д.Д., Бигнер С.Х. (1995). «Картирование делеции хромосомы 10 в глиомах человека: общая область делеции в 10q25». Онкоген. 10 (11): 2243–6. PMID  7784070.
• Холмсков У., Лоусон П., Тейснер Б., Торное И., Уиллис А.С., Морган С., Кох С., Рид КБ (1997). «Выделение и характеристика нового члена суперсемейства рецепторов скавенджеров, гликопротеина-340 (gp-340), в качестве молекулы, связывающей белок D сурфактанта легких». J. Biol. Chem. 272 (21): 13743–9. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID  9153228.
• Мори М., Сираиси Т., Танака С., Ямагата М., Мафуне К., Танака И., Уэо Х., Барнард Г. Ф., Сугимачи К. (1999). «Отсутствие экспрессии DMBT1 при раке пищевода, желудка и толстой кишки». Br. J. Рак. 79 (2): 211–3. Дои:10.1038 / sj.bjc.6690035. ЧВК  2362205. PMID  9888459.
• Тино MJ, Райт JR (1999). «Гликопротеин-340 связывает сурфактантный белок-A (SP-A) и стимулирует миграцию альвеолярных макрофагов SP-A-независимым образом». Являюсь. J. Respir. Cell Mol. Биол. 20 (4): 759–68. Дои:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID  10101009.
• Holmskov U, Mollenhauer J, Madsen J, Vitved L, Gronlund J, Tornoe I, Kliem A, Reid KB, Poustka A, Skjodt K (1999). «Клонирование gp-340, предполагаемого рецептора опсонина для легочного сурфактантного белка D». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (19): 10794–9. Bibcode:1999PNAS ... 9610794H. Дои:10.1073 / пнас.96.19.10794. ЧВК  17962. PMID  10485905.
• Такешита Х., Сато М., Шиваку Х.о., Семба С., Сакурада А., Хоши М., Хаяси Й., Тагава Й., Аябе Х., Хории А. (1999). «Экспрессия гена DMBT1 часто подавляется при раке легких человека». Jpn. J. Cancer Res. 90 (9): 903–8. Дои:10.1111 / j.1349-7006.1999.tb00833.x. ЧВК  5926167. PMID  10551316.
• Молленхауэр Дж., Холмсков Ю., Виманн С., Кребс И., Гербертц С., Мэдсен Дж., Киошис П., Кой Дж. Ф., Поустка А. (1999). «Геномная структура гена DMBT1: свидетельство области, подверженной геномной нестабильности». Онкоген. 18 (46): 6233–40. Дои:10.1038 / sj.onc.1203071. PMID  10597221. S2CID  12085482.
• Пракобпхол А., Сюй Ф., Хоанг В.М., Ларссон Т., Бергстром Дж., Йоханссон И., Френгсмир Л., Холмсков Ю., Леффлер Х., Нильссон С., Борен Т., Райт Дж. Р., Стрёмберг Н., Фишер С.Дж. (2000). «Слюнный агглютинин, который связывает Streptococcus mutans и Helicobacter pylori, представляет собой богатый цистеином белок gp-340 рецептора легочного скавенджера». J. Biol. Chem. 275 (51): 39860–6. Дои:10.1074 / jbc.M006928200. PMID  11007786.
• Ма Дж. Ф., Такито Дж., Виджаякумар С., Пил Д. М., Олссон Калифорния, Аль-Авкати К. (2001). «Простатическая экспрессия хенсина, белка, участвующего в терминальной дифференцировке эпителия». Предстательная железа. 49 (1): 9–18. Дои:10.1002 / pros.1113. PMID  11550206. S2CID  33550624.
• Ligtenberg TJ, Bikker FJ, Groenink J, Tornoe I., Leth-Larsen R, Veerman EC, Nieuw Amerongen AV, Holmskov U (2001). «Агглютинин слюны человека связывается с белком сурфактанта легких-D и идентичен белку рецептора поглотителя gp-340». Biochem. J. 359 (Пт 1): 243–8. Дои:10.1042/0264-6021:3590243. ЧВК  1222141. PMID  11563989.
• Молленхауэр Дж., Гербертц С., Хельмке Б., Коллендер Г., Кребс И., Мэдсен Дж., Холмсков Ю., Зоргер К., Шмитт Л., Виманн С., Отто Х. Ф., Грёне Х. Дж., Поустка А. (2001). «В злокачественных опухолях головного мозга удалена 1 универсальная муциноподобная молекула, которая, вероятно, играет дифференциальную роль в раке пищеварительного тракта». Рак Res. 61 (24): 8880–6. PMID  11751412.
• Биккер Ф. Дж., Лигтенберг А. Дж., Ван дер Валь Дж. Э., ван ден Кейбус П. А., Холмсков Ю., Веерман Е. С., Ньив Амеронген А. В. (2002). «Иммуногистохимическое определение агглютинина слюны / gp-340 в околоушных, поднижнечелюстных и губных слюнных железах». J. Dent. Res. 81 (2): 134–9. Дои:10.1177/154405910208100210. PMID  11829014.
• Сасаки Х, Бетенский Р.А., Кэрнкросс Дж. Г., Луи Д. Н. (2002). «Полиморфизм DMBT1: связь с онкогенезом злокачественной глиомы». Рак Res. 62 (6): 1790–6. PMID  11912156.
• Шульц Б.Л., Оксли Д., Пакер Н.Х., Карлссон Н.Г. (2002). «Идентификация двух высокосиалилированных изоформ DMBT1 человеческой слезной жидкости: основных высокомолекулярных гликопротеинов в человеческих слезах». Biochem. J. 366 (Pt 2): 511–20. Дои:10.1042 / BJ20011876. ЧВК  1222789. PMID  12015815.
• Bikker FJ, Ligtenberg AJ, Nazmi K, Veerman EC, van't Hof W., Bolscher JG, Poustka A, Nieuw Amerongen AV, Mollenhauer J (2002). «Идентификация бактериально-связывающего пептидного домена на слюнном агглютинине (gp-340 / DMBT1), члене суперсемейства, богатого цистеином». J. Biol. Chem. 277 (35): 32109–15. Дои:10.1074 / jbc.M203788200. PMID  12050164.
• Фан Х, Муньос Дж, Санко С.Г., Кастресана Дж.С. (2002). «Изменения PTEN, DMBT1 и p16 в диффузно инфильтрирующих астроцитомах». Int. Дж. Онкол. 21 (3): 667–74. Дои:10.3892 / ijo.21.3.667. PMID  12168116.
• Мюллер В., Молленхауэр Дж., Штокхаммер Ф., Поустка А., фон Даймлинг А. (2002). «Редкие мутации гена DMBT1 в астроцитарных глиомах человека». Онкоген. 21 (38): 5956–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1205733. PMID  12185598.