DOT1L - DOT1L

DOT1L
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1NW3, 2MV7, 3QOW, 3QOX, 3SR4, 3SX0, 3UWP, 4EK9, 4ЭКГ, 4EKI, 4EQZ, 4ER0, 4ER3, 4ER5, 4ER6, 4ER7, 4HRA, 4WVL, 5DSX, 5JUW, 5DRT, 5ДТМ, 5DTQ, 5DT2, 5 СУХИЙ, 5DTR
Идентификаторы
Псевдонимы	DOT1L, DOT1, KMT4, DOT1 как гистон-лизинметилтрансфераза
Внешние идентификаторы	OMIM: 607375 MGI: 2143886 ГомолоГен: 32779 Генные карты: DOT1L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.3 Начинать 2,163,933 бп[1] Конец 2,232,578 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C1 Начинать 80,755,206 бп[2] Конец 80,795,461 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • Связывание ДНК • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • гистон-метилтрансферазная активность • активность гистон-лизин N-метилтрансферазы • активность гистонметилтрансферазы (специфическая для H3-K79) Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • хромосома, теломерная область • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • теломерная организация • метилирование • подавление хроматина • регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции • регулирование каскада JAK-STAT • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительное регулирование пролиферации клеток • метилирование гистона H3-K79 • Контрольная точка повреждения ДНК • Ремонт ДНК • подавление хроматина на теломерах • организация хроматина • регуляция клеточного цикла Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84444	208266
Ансамбль	ENSG00000104885	ENSMUSG00000061589
UniProt	Q8TEK3	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_032482	NM_199322
RefSeq (белок)	NP_115871	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 19: 2.16 - 2.23 Мб	Chr 10: 80.76 - 80.8 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DOT1-подобный (Нарушитель теломерного сайленсинга 1-подобный), гистон H3K79 метилтрансфераза (С. cerevisiae), также известный как DOT1L, это белок найден у человека, а также у других эукариот.^[5][6]В метилирование гистона H3 лизина 79 (H3K79) с помощью DOT1L, который является консервативным эпигенетический во многих эукариотических эпигеномах, прогрессивно увеличивается вдоль старение процесс, предполагающий, что «DOT1L может функционировать как жизненно важные часы, бесстрастно отсчитывая часы».^[7]

Сообщалось, что DOT1L играет важную роль в процессах лейкоз смешанного происхождения (MLL) - перенесенные лейкемии^[8]

Были разработаны низкомолекулярные ингибиторы каталитической активности Dot1L.^[9][10]

Все три формы метилирования H3K79 (H3K79me1; H3K79me2; H3K79me3) катализируются DOT1 у дрожжей или DOT1L у млекопитающих. Метилирование H3K79 участвует в ответе на повреждение ДНК и играет множество ролей в эксцизионной репарации нуклеотидов и рекомбинационной репарации сестринских хроматид.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104885 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061589 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: DOT1L, подобная DOT1, метилтрансфераза гистона H3 (S. cerevisiae)».
6. Vlaming H, van Leeuwen F (2016). «Вверх и вниз по течению от метилирования H3K79 с помощью DOT1L». Хромосома. 125 (4): 1–13. Дои:10.1007 / s00412-015-0570-5. PMID  26728620. S2CID  18876283.
7. Сориа-Валлес С., Осорио Ф.Г., Лопес-Отин С. (2015). «Перепрограммирование старения посредством ингибирования DOT1L». Клеточный цикл. 14 (21): 3345–3346. Дои:10.1080/15384101.2015.1093443. ЧВК  4825545. PMID  26375309.
8. Сланы РК (2016). «Молекулярная механика лейкемии смешанного происхождения». Онкоген. 35 (40): 5215–5223. Дои:10.1038 / onc.2016.30. PMID  26923329. S2CID  34116587.
9. Яо Й, Чен П., Диао Дж., Ченг Дж., Дэн Л., Энглин Дж. Л., Прасад Б. В., Сонг Й (2011). «Селективные ингибиторы гистон-метилтрансферазы DOT1L: дизайн, синтез и кристаллографические исследования». Журнал Американского химического общества. 133 (42): 16746–9. Дои:10.1021 / ja206312b. ЧВК  3492951. PMID  21936531.
10. Chen S, Li L, Chen Y, Hu J, Liu J, Liu YC, Liu R, Zhang Y, Meng F, Zhu K, Lu J, Zheng M, Chen K, Zhang J, Jiang H, Yao Z, Luo C (2016). «Идентификация нового разрушителя теломерных Silencing 1-подобных ингибиторов (DOT1L) посредством виртуального скрининга на основе структуры и биологических анализов». Журнал химической информации и моделирования. 56 (3): 527–34. Дои:10.1021 / acs.jcim.5b00738. PMID  26914852.
11. Чен Ю., Жу Чжу (июль 2016 г.). «Биологическая функция и регуляция метилирования гистонового и негистонового лизина в ответ на повреждение ДНК». Acta Biochim. Биофиз. Грех. (Шанхай). 48 (7): 603–16. Дои:10.1093 / abbs / gmw050. PMID  27217472.

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О. (апрель 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 8 (2): 85–95. Дои:10.1093 / днарес / 8.2.85. PMID  11347906.
• Feng Q, Wang H, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Struhl K, Zhang Y (июнь 2002 г.). «Метилирование H3-лизина 79 опосредуется новым семейством HMTases без домена SET». Текущая биология. 12 (12): 1052–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00901-6. PMID  12123582. S2CID  17263035.
• Мин Дж, Фэн Кью, Ли З, Чжан И, Сюй Р.М. (март 2003 г.). «Структура каталитического домена DOT1L человека, нуклеосомной гистон-метилтрансферазы без домена SET». Клетка. 112 (5): 711–23. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00114-4. PMID  12628190. S2CID  17822742.
• Джикуя Х., Такано Дж., Кикуно Р., Хиросава М., Нагасе Т., Номура Н., Охара О. (февраль 2003 г.). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека. II. Полные последовательности 81 клона кДНК». ДНК исследования. 10 (1): 49–57. Дои:10.1093 / dnares / 10.1.49. PMID  12693554.
• Окада Й, Фэн Ц., Лин И, Цзян Ц., Ли И, Коффилд В. М., Су Л, Сюй Г, Чжан И (апрель 2005 г.). «hDOT1L связывает метилирование гистонов с лейкемогенезом». Клетка. 121 (2): 167–78. Дои:10.1016 / j.cell.2005.02.020. PMID  15851025. S2CID  15638573.
• Систаянарайн А., Цунэяма К., Чжэн Х., Такахаши Х., Номото К., Ченг С., Мурай Ю., Танака А., Такано И. (2006). «Экспрессия киназы Aurora-B и фосфорилированного гистона H3 в гепатоцеллюлярной карциноме». Противораковые исследования. 26 (5A): 3585–93. PMID  17094487.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8TEK3 (Гистон-лизин-N-метилтрансфераза, H3-лизин-79-специфическая) на PDBe-KB.