DTX1 - DTX1

DTX1
Идентификаторы
Псевдонимы	DTX1, hDx-1, deltex 1, deltex E3 убиквитинлигаза 1, RNF140
Внешние идентификаторы	OMIM: 602582 MGI: 1352744 ГомолоГен: 74522 Генные карты: DTX1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.13 Начинать 113,056,709 бп[1] Конец 113,098,028 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 F | 5 60,64 см Начинать 120,680,202 бп[2] Конец 120,711,927 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание ионов металлов • Крепление с выемкой • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • ядерное тело Биологический процесс • Notch сигнальный путь • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • дифференцировка глиальных клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция сигнального пути Notch • отрицательная регуляция дифференцировки Т-клеток • отрицательная регуляция дифференцировки нейронов • убиквитинирование белков • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1840	14357
Ансамбль	ENSG00000135144	ENSMUSG00000029603
UniProt	Q86Y01	Q61010
RefSeq (мРНК)	NM_004416	NM_008052
RefSeq (белок)	NP_004407	NP_032078
Расположение (UCSC)	Chr 12: 113.06 - 113,1 Мб	Chr 5: 120,68 - 120,71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок дельтекс-1 это белок что у людей кодируется DTX1 ген.^[5][6]

Функция

Исследования на дрозофиле идентифицировали этот ген как кодирующий позитивный регулятор сигнальный путь notch. Ген человека кодирует белок неизвестной функции; однако он может играть роль в основной активности фактора транскрипции спираль-петля-спираль.^[6]

Взаимодействия

DTX1 был показан взаимодействовать с EP300.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135144 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029603 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мацуно К., Истман Д., Мициадес Т., Куинн А.М., Карканчиу М.Л., Ордентлих П., Кадеш Т., Артаванис-Цаконас С. (май 1998 г.). «Человеческая дельта - консервативный регулятор передачи сигналов Notch». Природа Генетика. 19 (1): 74–8. Дои:10.1038 / ng0598-74. PMID  9590294. S2CID  6812613.
6. «Ген Entrez: гомолог 1 дельтекс DTX1 (Drosophila)».
7. Ямамото Н., Ямамото С., Инагаки Ф., Кавайчи М., Фукамизу А., Киши Н., Мацуно К., Накамура К., Вайнмастер Г., Окано Х., Накафуку М. (ноябрь 2001 г.). «Роль Deltex-1 в качестве регулятора транскрипции ниже рецептора Notch». Журнал биологической химии. 276 (48): 45031–40. Дои:10.1074 / jbc.M105245200. PMID  11564735.

дальнейшее чтение

• Сайто Т., Чиба С., Итикава М., Кунисато А., Асаи Т., Симидзу К., Ямагути Т., Ямамото Г., Со С., Кумано К., Накагами-Ямагути Е., Хамада И., Айзава С., Хираи Х (май 2003 г.). «Notch2 предпочтительно экспрессируется в зрелых B-клетках и необходим для развития линии B в маргинальной зоне». Иммунитет. 18 (5): 675–85. Дои:10.1016 / S1074-7613 (03) 00111-0. PMID  12753744.
• Takeyama K, Aguiar RC, Gu L, He C, Freeman GJ, Kutok JL, Aster JC, Shipp MA (июнь 2003 г.). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные члены семейства Deltex проявляют активность убиквитин-протеин-изопептид-лигазы». Журнал биологической химии. 278 (24): 21930–7. Дои:10.1074 / jbc.M301157200. PMID  12670957.
• Гупта-Росси Н., Сторк С., Грибель П. Дж., Рейно, Калифорния, Вайль Дж. К., Дахан А. (март 2003 г.). «Специфическая сверхэкспрессия дельтекса и нового кельч-подобного белка в В-клетках зародышевого центра человека». Молекулярная иммунология. 39 (13): 791–9. Дои:10.1016 / S0161-5890 (03) 00002-6. PMID  12617994.
• Изон DJ, Астер Дж. К., Хе И, Вен А., Карнелл Ф. Г., Патриуб В., Сюй Л., Баккур С., Родригес С., Оллман Д., Груша В. С. (февраль 2002 г.). «Deltex1 перенаправляет лимфоидные предшественники к линии B-клеток, противодействуя Notch1». Иммунитет. 16 (2): 231–43. Дои:10.1016 / S1074-7613 (02) 00271-6. PMID  11869684.
• Ямамото Н., Ямамото С., Инагаки Ф., Кавайчи М., Фукамизу А., Киши Н., Мацуно К., Накамура К., Вайнмастер Г., Окано Х., Накафуку М. (ноябрь 2001 г.). «Роль Deltex-1 в качестве регулятора транскрипции ниже рецептора Notch». Журнал биологической химии. 276 (48): 45031–40. Дои:10.1074 / jbc.M105245200. PMID  11564735.
• Киши Н., Тан З., Маэда Й., Хираи А., Мо Р, Ито М., Сузуки С., Накао К., Киношита Т., Кадеш Т., Хуэй С., Артаванис-Цаконас С., Окано Х., Мацуно К. (февраль 2001 г.). «Мышиные гомологи deltex определяют новое семейство генов, участвующих в передаче сигналов Notch и нейрогенезе позвоночных». Международный журнал нейробиологии развития. 19 (1): 21–35. Дои:10.1016 / S0736-5748 (00) 00071-X. PMID  11226752. S2CID  21859491.
• Ли Л., Доуханик-Морриссетт Дж., Кац А., Юкофски Л., Кранц И.Д. (декабрь 2000 г.). «Хромосомная локализация, геномная характеристика и картирование критической области синдрома Нунана человеческого гена Deltex (DTX1)». Генетика человека. 107 (6): 577–81. Дои:10.1007 / s004390000431. PMID  11153911. S2CID  38695463.
• Блаумюллер CM, Qi H, Zagouras P, Artavanis-Tsakonas S (июль 1997 г.). «Внутриклеточное расщепление Notch приводит к гетеродимерному рецептору на плазматической мембране». Клетка. 90 (2): 281–91. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80336-0. PMID  9244302. S2CID  16544864.
• Мацуно К., Дидерих Р.Дж., Го М.Дж., Блаумюллер К.М., Артаванис-Цаконас С. (август 1995 г.). «Deltex действует как положительный регулятор передачи сигналов Notch посредством взаимодействия с анкириновыми повторами Notch». Разработка. 121 (8): 2633–44. PMID  7671825.