DYNLL1 - DYNLL1

DYNLL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1CMI, 3ZKE, 3ZKF, 1F95, 1F3C, 1F96
Идентификаторы
Псевдонимы	DYNLL1, DLC1, DLC8, DNCL1, DNCLC1, LC8, LC8a, PIN, hdlc1, динеиновая легкая цепь LC8-типа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601562 MGI: 1861457 ГомолоГен: 133063 Генные карты: DYNLL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.31 Начните 120,469,850 бп[1] Конец 120,498,493 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начните 115,297,110 бп[2] Конец 115,300,999 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • клеточно-двигательная активность • связывание с белками цитоскелета • АТФ-зависимая моторная активность микротрубочек, направленная на плюс-конец • связывание промежуточной цепи динеина • связывание легкой промежуточной цепи динеина • связывание ферментов • активность регулятора синтазы оксида азота • активность гомодимеризации белков • активность гетеродимеризации белков • связывание с белками каркаса Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центросома • мембрана • клеточная мембрана • комплекс, связанный с микротрубочками • цилиарный кончик • митохондрия • динеиновый комплекс • Сигналосома COP9 • митотическое веретено • микротрубочки • цитоскелет • внеклеточная экзосома • ядро клетки • кинетохора • цитоплазматический динеиновый комплекс • ресничка • мембрана третичных гранул • мембрана гранул, богатая фиколином-1 • центр организации микротрубочек • секреторная гранула • цитоплазма аксона Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие черной субстанции • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • транскрипция, ДНК-шаблон • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза • G2 / M переход митотического клеточного цикла • процесс на основе микротрубочек • внутрибровный ретроградный транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования • макроавтофагия • апоптотический процесс • внутрицилиарный транспорт, участвующий в сборке ресничек • дегрануляция нейтрофилов • сборка подвижных ресничек • стыковка цилиарного базального тела • положительная регуляция неподвижной сборки ресничек • транспорт по микротрубочкам • морфогенез ресничек • положительная регуляция АТФ-зависимой моторной активности микротрубочек, направленная на положительный конец • сцепление сестринских хроматид • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла • транспорт • развитие сперматид • положительная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8655	56455
Ансамбль	ENSG00000088986	ENSMUSG00000009013
UniProt	P63167	P63168
RefSeq (мРНК)	NM_003746 NM_001037494 NM_001037495	NM_019682
RefSeq (белок)	NP_001032583 NP_001032584 NP_003737	NP_062656
Расположение (UCSC)	Chr 12: 120,47 - 120,5 Мб	Chr 5: 115,3 - 115,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Легкая цепь динеина 1, цитоплазматическая это белок что у людей кодируется DYNLL1 ген.^[5][6][7][8]

Функция

Цитоплазматические динеины представляют собой большие ферментные комплексы с молекулярной массой около 1200 кДа. Они содержат две производящие силу головки, образованные в основном из тяжелых цепей динеина, и ножки, соединяющие головки с базальным доменом, который содержит различное количество дополнительных промежуточных цепей. Комплекс участвует во внутриклеточном транспорте и подвижности. Белок, описанный в этой записи, представляет собой легкую цепь и существует как часть этого комплекса, но также физически взаимодействует с нейронами и подавляет активность синтазы оксида азота. Связывание этого белка дестабилизирует нейрональный димер синтазы оксида азота, конформацию, необходимую для активности, и он может регулировать многочисленные биологические процессы за счет своего воздействия на активность синтазы оксида азота. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции.^[8]

Взаимодействия

DYNLL1 был показан взаимодействовать с участием:

• BCL2L11,^[9][10]
• DLG4^[11]
• DLGAP1,^[11]
• DYNC1I1,^[12]
• IκBα,^[13]
• MYO5A,^[11]
• NRF1,^[14]
• PAK1,^[10] и
• TP53BP1.^[15]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088986 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009013 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Дик Т., Рэй К., Зальц Г.К., Чиа В. (май 1996 г.). «Мутации цитоплазматического динеина (ddlc1) вызывают морфогенетические дефекты и апоптотическую гибель клеток у Drosophila melanogaster». Молекулярная и клеточная биология. 16 (5): 1966–77. Дои:10.1128 / mcb.16.5.1966. ЧВК  231184. PMID  8628263.
6. Джеффри С.Р., Снайдер С.Х. (ноябрь 1996 г.). «PIN: ассоциированный белковый ингибитор нейрональной синтазы оксида азота». Наука. 274 (5288): 774–7. Дои:10.1126 / science.274.5288.774. PMID  8864115. S2CID  46494691.
7. Пфистер К.К., Фишер Е.М., Гиббонс И.Р., Хейс Т.С., Хольцбаур Е.Л., Макинтош Дж.Р., Портер М.Э., Шроер Т.А., Воган К.Т., Уитман Г.Б., Кинг С.М., Валле РБ (ноябрь 2005 г.). «Номенклатура цитоплазматического динеина». Журнал клеточной биологии. 171 (3): 411–3. Дои:10.1083 / jcb.200508078. ЧВК  2171247. PMID  16260502.
8. «Ген Entrez: динеин DYNLL1, легкая цепь, LC8-тип 1».
9. Day CL, Puthalakath H, Skea G, Strasser A, Barsukov I, Lian LY, Huang DC, Hinds MG (февраль 2004 г.). «Локализация легких цепей 1 и 2 динеина и их проапоптотических лигандов». Биохимический журнал. 377 (Pt 3): 597–605. Дои:10.1042 / BJ20031251. ЧВК  1223895. PMID  14561217.
10. Вадламуди Р.К., Багери-Ярманд Р., Ян З., Баласентил С., Нгуен Д., Сахин А.А., ден Холландер П., Кумар Р. (июнь 2004 г.). «Легкая цепь динеина 1, субстрат, взаимодействующий с p21-активированной киназой 1, способствует злокачественным фенотипам». Раковая клетка. 5 (6): 575–85. Дои:10.1016 / j.ccr.2004.05.022. PMID  15193260.
11. Нейсбитт С., Вальчанофф Дж., Эллисон Д.В., Сала С., Ким Э., Крейг А.М., Вайнберг Р.Дж., Шенг М. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие белкового комплекса, связанного с постсинаптической плотностью-95 / доменом гуанилаткиназы, с легкой цепью миозина-V и динеина». Журнал неврологии. 20 (12): 4524–34. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-12-04524.2000. ЧВК  6772433. PMID  10844022.
12. Дифенбах Р.Дж., Дифенбах Э., Дуглас М.В., Каннингем А.Л. (декабрь 2002 г.). «Тяжелая цепь обычного кинезина взаимодействует с белками SNARE SNAP25 и SNAP23». Биохимия. 41 (50): 14906–15. Дои:10.1021 / bi026417u. PMID  12475239.
13. Crépieux P, Kwon H, Leclerc N, Spencer W., Richard S, Lin R, Hiscott J (декабрь 1997 г.). «I kappaB alpha физически взаимодействует с белком, ассоциированным с цитоскелетом, через его домен сигнального ответа». Молекулярная и клеточная биология. 17 (12): 7375–85. Дои:10.1128 / MCB.17.12.7375. ЧВК  232593. PMID  9372968.
14. Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (декабрь 2000 г.). «Легкая цепь динеина взаимодействует с NRF-1 и EWG, структурно и функционально родственными факторами транскрипции человека и дрозофилы». Журнал клеточной науки. 113 (23): 4263–73. PMID  11069771.
15. Ло К.В., Кан Х.М., Чан Л.Н., Сюй В.Г., Ван К.П., Ву З., Шэн М., Чжан М. (март 2005 г.). «Легкая цепь динеина 8 кДа связывается с p53-связывающим белком 1 и опосредует накопление ядер p53, вызванное повреждением ДНК». Журнал биологической химии. 280 (9): 8172–9. Дои:10.1074 / jbc.M411408200. PMID  15611139.

дальнейшее чтение

• Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А., Бибер Ф.Р., Мортон С.К. (сентябрь 1994 г.). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика. 23 (1): 42–50. Дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID  7829101.
• Crépieux P, Kwon H, Leclerc N, Spencer W., Richard S, Lin R, Hiscott J (декабрь 1997 г.). «I kappaB alpha физически взаимодействует с белком, ассоциированным с цитоскелетом, через свой домен сигнального ответа». Молекулярная и клеточная биология. 17 (12): 7375–85. Дои:10.1128 / MCB.17.12.7375. ЧВК  232593. PMID  9372968.
• Tochio H, Ohki S, Zhang Q, Li M, Zhang M (ноябрь 1998 г.). «Структура раствора белкового ингибитора нейрональной синтазы оксида азота». Структурная биология природы. 5 (11): 965–9. Дои:10.1038/2940. PMID  9808041. S2CID  28591803.
• Родригес-Креспо I, Штрауб В., Гавиланес Ф., Ортис де Монтельяно PR (ноябрь 1998 г.). «Связывание легкой цепи динеина (PIN) с нейрональной синтазой оксида азота в отсутствие ингибирования». Архивы биохимии и биофизики. 359 (2): 297–304. Дои:10.1006 / abbi.1998.0928. PMID  9808772.
• Fan JS, Zhang Q, Li M, Tochio H, Yamazaki T., Shimizu M, Zhang M (декабрь 1998 г.). «Белковый ингибитор нейрональной синтазы оксида азота, PIN, связывается с фрагментом фермента, содержащим 17 аминокислотных остатков». Журнал биологической химии. 273 (50): 33472–81. Дои:10.1074 / jbc.273.50.33472. PMID  9837926.
• Puthalakath H, Huang DC, O'Reilly LA, King SM, Strasser A (март 1999 г.). «Проапоптотическая активность Bim члена семейства Bcl-2 регулируется взаимодействием с моторным комплексом динеина». Молекулярная клетка. 3 (3): 287–96. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80456-6. PMID  10198631.
• Лян Дж., Джеффри С.Р., Го В., Снайдер С.Х., Кларди Дж. (Август 1999 г.). «Структура димера PIN / LC8 со связанным пептидом». Структурная биология природы. 6 (8): 735–40. Дои:10.1038/11501. PMID  10426949. S2CID  30155673.
• Эпштейн Э., Села-Браун А., Рингель И., Килав Р., Кинг С. М., Бенашски С. Е., Исраэли Дж. К., Сильвер Дж., Навех-Мани Т. (февраль 2000 г.). «Связывание легкой цепи динеина с 3'-нетранслируемой последовательностью опосредует ассоциацию мРНК паратироидного гормона с микротрубочками». Журнал клинических исследований. 105 (4): 505–12. Дои:10.1172 / JCI8557. ЧВК  289163. PMID  10683380.
• Нейсбитт С., Вальчанофф Дж., Эллисон Д.В., Сала С., Ким Е., Крейг А.М., Вайнберг Р.Дж., Шенг М. (июнь 2000 г.) «Взаимодействие белкового комплекса, связанного с постсинаптической плотностью-95 / доменом гуанилаткиназы, с легкой цепью миозина-V и динеина». Журнал неврологии. 20 (12): 4524–34. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-12-04524.2000. ЧВК  6772433. PMID  10844022.
• Джейкоб Й., Бадран Х., Чеккальди П.Е., Тордо Н. (ноябрь 2000 г.). «Цитоплазматический динеин LC8 взаимодействует с фосфопротеином лиссавируса». Журнал вирусологии. 74 (21): 10217–22. Дои:10.1128 / JVI.74.21.10217-10222.2000. ЧВК  102062. PMID  11024152.
• Herzig RP, Andersson U, Scarpulla RC (декабрь 2000 г.). «Легкая цепь динеина взаимодействует с NRF-1 и EWG, структурно и функционально родственными факторами транскрипции человека и дрозофилы». Журнал клеточной науки. 113 (23): 4263–73. PMID  11069771.
• Харагути К., Сато К., Янаи Х., Хамада Ф., Кавабучи М., Акияма Т. (ноябрь 2000 г.). «Связанный с hDLG белок DAP взаимодействует с легкой цепью динеина и нейрональной синтазой оксида азота». Гены в клетки. 5 (11): 905–911. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00374.x. PMID  11122378. S2CID  37107139.
• Ло К.В., Нейсбитт С., Фан Дж. С., Шэн М., Чжан М. (апрель 2001 г.). «Легкая цепь динеина 8 кДа связывается со своими мишенями через консервативный (K / R) мотив XTQT». Журнал биологической химии. 276 (17): 14059–66. Дои:10.1074 / jbc.M010320200. PMID  11148209.
• Яно Х., Ли Ф.С., Конг Х., Чуанг Дж., Аревало Дж., Перес П., Сунг С., Чао М.В. (февраль 2001 г.). «Ассоциация рецепторов нейротрофина Trk с компонентами цитоплазматического динеинового двигателя». Журнал неврологии. 21 (3): RC125. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-03-j0003.2001. ЧВК  6762309. PMID  11157096.
• Fan J, Zhang Q, Tochio H, Li M, Zhang M (февраль 2001 г.). «Структурная основа различного зависимого от последовательности распознавания мишени легкой цепью динеина 8 кДа». Журнал молекулярной биологии. 306 (1): 97–108. Дои:10.1006 / jmbi.2000.4374. PMID  11178896.
• Биелли А., Тёрнквист П.О., Хендрик А.Г., Финн Р., Фицджеральд К., Маккаффри М.В. (март 2001 г.). «Малая GTPase Rab4A взаимодействует с центральной областью цитоплазматической легкой промежуточной цепи-1 динеина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 281 (5): 1141–53. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4468. PMID  11243854.
• Yu J, Yu L, Chen Z, Zheng L, Chen X, Wang X, Ren D, Zhao S (март 2002 г.). «Белковый ингибитор нейрональной синтазы оксида азота взаимодействует с ингибиторами протеинкиназы А». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 99 (2): 145–9. Дои:10.1016 / S0169-328X (02) 00104-3. PMID  11978406.
• Fuhrmann JC, Kins S, Rostaing P, El Far O, Kirsch J, Sheng M, Triller A, Betz H, Kneussel M (июль 2002 г.). «Гефирин взаимодействует с легкими цепями 1 и 2 динеина, составляющими комплексы моторных белков». Журнал неврологии. 22 (13): 5393–402. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-13-05393.2002. ЧВК  6758200. PMID  12097491.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P63167 (Легкая цепь динеина 1, цитоплазматическая) на PDBe-KB.