Дэвид М. Книп - David M. Knipe
Дэвид М. Книп | |
---|---|
Родился | |
Национальность | Соединенные Штаты |
Гражданство | Американец |
Альма-матер | Кейс Вестерн Резервный университет Б.А. Массачусетский Институт Технологий Кандидат наук. Чикагский университет Постдокторантура |
Известен | Вирус простого герпеса исследование Области вирусологии |
Научная карьера | |
Поля | Вирусология Микробиология Иммунобиология |
Учреждения | Гарвардская медицинская школа |
Дэвид М. Книп Хиггинс профессор Микробиология и Молекулярная генетика и исполняющий обязанности сопредседателя кафедры микробиологии и Иммунобиология на Гарвардская медицинская школа в Бостон, Массачусетс[1] и со-главный редактор справочника Области вирусологии.[2] Ранее он работал председателем программы в Вирусология в Гарвардской медицинской школе с 2004 по 2016 год.
Образование
Книп получил образование в Кейс Вестерн Резервный университет, получив степень бакалавра искусств с отличием в биология в 1972 году. В CWRU он проводил исследования с Д-р Роберт Д. Гольдман и показали, что микрофиламенты в клетках млекопитающих актин нитей за счет связывания очищенных тяжелых меромиозин для украшения микрофиламентов в проницаемых клетках.[3] Он продолжил занятия по клеточной биологии в Массачусетский Институт Технологий, получив докторскую степень. в 1976 г .; его диссертационное исследование было сосредоточено на вирус везикулярного стоматита (VSV) под присмотром Д-р Дэвид Балтимор и Доктор Харви Лодиш. Книп первым отделил и перевел VSV мРНК in vitro для определения их кодирующего потенциала. Затем он показал, что VSV гликопротеин (G) и мембранные (М) белки собраны в вирионы двумя отдельными путями. Путь для G-белка помог определить секреторный путь сборки мембранных гликопротеинов, а путь для M-белка определил цитозольный путь сборки мембранного белка.[4][5][6][7]
После завершения учебы в аспирантуре он получил докторскую степень по молекулярной генетике вирус простого герпеса (HSV) на Чикагский университет с участием Д-р Бернард Ройзман. Книп разработал котрансфекция метод картирования мутаций и введения новых последовательностей в геном HSV и показал, что ген ICP4 картирован в повторяющихся последовательностях короткого компонента вирусного генома.[8] Эта методология была использована для картирования вирусных гликопротеинов, морфологии бляшек и маркеров лекарственной устойчивости, а также для создания кандидатной вакцины против генитального герпеса.[9]
Исследование
В 1979 году Книп поступил на факультет Гарвардской медицинской школы в качестве доцента микробиологии и молекулярной генетики и основал свою собственную лабораторию для изучения HSV. Он показал, что ВПГ реплицирует свою ДНК в определенных отделах ядра инфицированной клетки.[10][11] Они также показали, что вирусный геном, связанный с ядерная пластинка для немедленной ранней транскрипции. Эта работа показала, что внутриядерные белки локализуются в определенных сайтах для выполнения своих функций, так же как цитоплазматические белки, как известно, локализуются в определенных сайтах. Это привело к появлению новых областей изучения внутриядерной компартментализации репликации ДНК-вируса. Исследование Книпа показало, что белки репарации и рекомбинации ДНК клетки-хозяина локализованы в компартментах репликации вируса и что некоторые из них подавляют репликацию вируса, а некоторые необходимы для репликации вируса.[12] Он открыл молекулярную основу литической и латентной инфекции вируса простого герпеса посредством определения эпигенетических регуляторных механизмов, в которых: вирусные белки способствуют модификации эухроматина на вирусном хроматине и транскрипции литических генов в эпителиальных клетках; и связанный с вирусной латентностью транскрипт способствует модификации гетерохроматина на вирусном хроматине и подавлению литических генов в нейронах.[13][14][15] Он определил структуру вирусного хроматина во время латентной инфекции нейронов и механизмы, с помощью которых вирусная ДНК подавляется во время латентной инфекции.[16][17][18] Он также определил клеточные белки, которые распознают герпесвирусную ДНК в ядре, инициируют врожденную передачу сигналов и ограничивают экспрессию вирусных генов, и идентифицировал вирусные белки, которые блокируют врожденные ответы хозяина.[19][20][21][22] Его работа показала, что вирусы с дефектной репликацией могут служить вакциной против генитального герпеса и вектором вакцины - одной из этих вакцин против генитального герпеса, HSV-529, является ведущим кандидатом в клинических испытаниях фазы I.[9][23][24]
Награды и отличия
Книп получил несколько наград и наград, в том числе:
- Преддокторская стипендия Национального научного фонда (1972–1975)
- Стипендия Джейн Коффин Чайлдс для получения докторской степени (1976–1978)
- Американское общество лейкемии (ныне Общество лейкемии и лимфомы ) Специальная стипендия (1978–1980)
- Ученый-онколог Американское онкологическое общество, Массачусетский дивизион (1978–1980)
- Премия факультета за исследования, Американское онкологическое общество (1984–1989)
- Премия MERIT (метод расширения исследований во времени), Национальный институт рака (1988–1996)
- Избрание в стипендию Американская академия микробиологии (2009)
- С. Эдвард Салкин Приглашенный профессор, Юго-западный медицинский центр Техасского университета (2013)
Личная жизнь
Книп женат на Сюзанне Книп; у них две дочери и трое внуков.
использованная литература
- ^ «Кафедра микробиологии и иммунобиологии | Факультет и их исследования». Получено 15 января, 2015.
- ^ «Полевая вирусология». Получено 15 января, 2015.
- ^ Goldman, R.D .; Книп, Д. М. (1973). «Функции цитоплазматических волокон в подвижности немышечных клеток». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 37: 523–534. Дои:10.1101 / sqb.1973.037.01.063.
- ^ Knipe, D. M .; Lodish, H. F .; Балтимор, Д. (1977). «Локализация двух клеточных форм вирусного гликопротеина везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1121–1127. ЧВК 515653. PMID 191639.
- ^ Knipe, D. M .; Балтимор, Д .; Лодиш, Х. Ф. (1977). «Отдельные пути созревания основных структурных белков вируса везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1128–1139. ЧВК 515654. PMID 191640.
- ^ Knipe, D. M .; Lodish, H. F .; Балтимор, Д. (1977). «Анализ дефектов термочувствительных мутантов вируса везикулярного стоматита: внутриклеточная деградация специфических вирусных белков». Журнал вирусологии. 21 (3): 1140–1148. ЧВК 515655. PMID 191641.
- ^ Knipe, D. M .; Балтимор, Д .; Лодиш, Х. Ф. (1977). «Созревание вирусных белков в клетках, инфицированных термочувствительными мутантами вируса везикулярного стоматита». Журнал вирусологии. 21 (3): 1149–1158. ЧВК 515656. PMID 191642.
- ^ Knipe, D. M .; Ruyechan, W. T .; Ройзман, Б .; Халлибертон, И. В. (1978). «Молекулярная генетика вируса простого герпеса: демонстрация областей обязательной и необязательной идентичности в диплоидных областях генома путем замены и вставки последовательности». Труды Национальной академии наук. 75 (8): 3896–3900. Дои:10.1073 / пнас.75.8.3896. ISSN 0027-8424. ЧВК 392895. PMID 211508.
- ^ а б Да Коста, X.J .; Jones, C.A .; Книп, Д. М. (1999). «Иммунизация против генитального герпеса вакцинным вирусом, имеющим дефекты продуктивной и латентной инфекции». Труды Национальной академии наук. 96 (12): 6994–6998. Дои:10.1073 / пнас.96.12.6994. ISSN 0027-8424. ЧВК 22033. PMID 10359827.
- ^ Куинлан, Маргарет П .; Чен, Лан Бо; Книп, Дэвид М. (1984). «Внутриядерное расположение ДНК-связывающего белка вируса простого герпеса определяется статусом репликации вирусной ДНК». Ячейка. 36 (4): 857–868. Дои:10.1016/0092-8674(84)90035-7. ISSN 0092-8674.
- ^ Копс, Энн де Брюн; Книп, Дэвид М. (1988). «Для образования структур репликации ДНК в клетках, инфицированных вирусом герпеса, требуется белок, связывающий вирусную ДНК». Ячейка. 55 (5): 857–868. Дои:10.1016/0092-8674(88)90141-9. ISSN 0092-8674.
- ^ Тейлор, Т. Дж .; Книп, Д. М. (2004). "Протеомика репликационных отделов вируса простого герпеса: ассоциация белков репликации, восстановления, рекомбинации и ремоделирования хроматина клеточной ДНК с ICP8". Журнал вирусологии. 78 (11): 5856–5866. Дои:10.1128 / JVI.78.11.5856-5866.2004. ISSN 0022-538X. ЧВК 415816. PMID 15140983.
- ^ Wang, Q.-Y .; Чжоу, C .; Johnson, K. E .; Colgrove, R.C .; Coen, D. M .; Книп, Д. М. (2005). «Ген транскрипта, связанный с латентным вирусом герпеса, способствует сборке гетерохроматина на промоторах вирусного литического гена при латентной инфекции». Труды Национальной академии наук. 102 (44): 16055–16059. Дои:10.1073 / pnas.0505850102. ISSN 0027-8424. ЧВК 1266038. PMID 16247011.
- ^ Клифф, А. Р .; Книп, Д. М. (2008). «Вирус простого герпеса ICP0 способствует как удалению гистонов, так и ацетилированию вирусной ДНК во время литической инфекции». Журнал вирусологии. 82 (24): 12030–12038. Дои:10.1128 / JVI.01575-08. ISSN 0022-538X. ЧВК 2593313. PMID 18842720.
- ^ Книп, Дэвид М .; Клифф, Анна (2008). "Контроль хроматина литической и латентной инфекции вируса простого герпеса". Обзоры природы Микробиология. 6 (3): 211–221. Дои:10.1038 / nrmicro1794. ISSN 1740-1526. PMID 18264117.
- ^ Клифф, А. Р .; Гарбер, Д. А .; Книп, Д. М. (2009). «Транскрипция транскрипта, связанного с латентностью вируса простого герпеса, способствует образованию факультативного гетерохроматина на литических промоторах». Журнал вирусологии. 83 (16): 8182–8190. Дои:10.1128 / JVI.00712-09. ISSN 0022-538X. ЧВК 2715743. PMID 19515781.
- ^ Клифф, А. Р .; Coen, D. M .; Книп, Д. М. (2013). «Кинетика факультативной ассоциации белков гетерохроматина и группы Polycomb с геномом вируса простого герпеса при установлении скрытой инфекции» (PDF). мБио. 4 (1): e00590-12 – e00590-12. Дои:10,1128 / мBio.00590-12. ISSN 2150-7511.
- ^ Книп, Дэвид М .; Либерман, Пол М .; Jung, Jae U .; McBride, Alison A .; Моррис, Кевин В .; Отт, Мелани; Марголис, Дэвид; Ньето, Амелия; Невелс, Майкл; Парки, Робин Дж .; Кристи, Томас М. (2013). «Снимки: хроматиновый контроль вирусной инфекции». Вирусология. 435 (1): 141–156. Дои:10.1016 / j.virol.2012.09.023. ISSN 0042-6822. ЧВК 3531885. PMID 23217624.
- ^ Орзалли, М. Х .; DeLuca, N.A .; Книп, Д. М. (2012). «Ядерная индукция IFI16 передачи сигналов IRF-3 во время герпесвирусной инфекции и деградация IFI16 вирусным белком ICP0». Труды Национальной академии наук. 109 (44): E3008 – E3017. Дои:10.1073 / pnas.1211302109. ISSN 0027-8424. ЧВК 3497734. PMID 23027953.
- ^ Орзалли, М. Х .; Conwell, S.E .; Berrios, C .; DeCaprio, J.A .; Книп, Д. М. (2013). «Ядерный интерферон-индуцируемый белок 16 способствует подавлению герпесвирусной и трансфицированной ДНК». Труды Национальной академии наук. 110 (47): E4492 – E4501. Дои:10.1073 / pnas.1316194110. ISSN 0027-8424. ЧВК 3839728. PMID 24198334.
- ^ Орзалли, Меган Х .; Книп, Дэвид М. (2014). «Клеточное зондирование вирусной ДНК и механизмы уклонения от вирусов». Ежегодный обзор микробиологии. 68 (1): 477–492. Дои:10.1146 / annurev-micro-091313-103409. ISSN 0066-4227. ЧВК 4348004. PMID 25002095.
- ^ Орзалли, Меган Х .; Broekema, Nicole M .; Diner, Benjamin A .; Хэнкс, Дастин С .; Elde, Nels C .; Cristea, Ileana M .; Книп, Дэвид М. (2015). «cGAS-опосредованная стабилизация IFI16 способствует врожденной передаче сигналов во время инфицирования вирусом простого герпеса». Труды Национальной академии наук. 112 (14): E1773 – E1781. Дои:10.1073 / pnas.1424637112. ISSN 0027-8424. ЧВК 4394261. PMID 25831530.
- ^ Dudek, T. E .; Torres-Lopez, E .; Crumpacker, C .; Книп, Д. М. (2011). «Доказательства различий в иммунологических и патогенетических свойствах штаммов вируса простого герпеса 2 из США и Южной Африки». Журнал инфекционных болезней. 203 (10): 1434–1441. Дои:10.1093 / infdis / jir047. ISSN 0022-1899. ЧВК 3080912. PMID 21498376.
- ^ Книп, Дэвид М .; Кори, Лоуренс; Коэн, Джеффри I .; Дело, Кэролайн Д. (2014). Резюме и рекомендации семинара Национального института аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID) по теме «Вакцины против вируса простого герпеса нового поколения»"". Вакцина. 32 (14): 1561–1562. Дои:10.1016 / j.vaccine.2014.01.052. ISSN 0264-410X. ЧВК 4786164. PMID 24480025.