Densovirinae - Densovirinae

Densovirinae
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Моноднавирия
Королевство:Shotokuvirae
Тип:Cossaviricota
Учебный класс:Quintoviricetes
Заказ:Piccovirales
Семья:Parvoviridae
Подсемейство:Densovirinae
Роды

См. Текст

Densovirinae[1] является подсемейством одноцепочечных ДНК-вирусы в семье Parvoviridae.[2][3] Подсемейство в настоящее время насчитывает 8 признанных родов и 17 видов.[4] Известно, что денсовирусы заражают представителей отрядов насекомых. Blattodea, Двукрылые, Hemiptera, Перепончатокрылые, Чешуекрылые, и Прямокрылые, в то время как некоторые вирусы заражают и размножаются у ракообразных, таких как креветка или же рак, или же морские звезды из типа Иглокожие.[3]

Вирусология

Дензовирусы небольшие (18–26 нанометров в диаметре) и не имеют оболочки. Вирионы имеют форму икосаэдра с числом триангуляции (T) = 1. Их 60 копии белка оболочки вириона. Каждая копия имеет форму, описываемую как «четырехугольный клин в форме воздушного змея», а поверхность выглядит шероховатой с множеством мелких выступов. Вирионы не содержат липиды.[5][6]

Геномы несегментированы, длиной около 4–6 килобаз и обычно содержат два или три открытые рамки для чтения. 5'-открытая рамка считывания кодирует два неструктурных белка (NS-1 и NS-2), а 3 'открытая рамка считывания кодирует два или три капсидных белка (VP1, VP2, VP3). Оба конца 5 'и 3' имеют шпильки. Если присутствует третья открытая рамка считывания (зависит от рода), она кодирует второй неструктурный белок. Геном является анмбисенсом, кодирующим белки как в положительном, так и в отрицательном смысловом направлениях. Транскрипционная регуляция и посттранскрипционная модификация используются для производства различных неструктурных белков и структурных белков.[7][8][9][6]

Вирионы проникают в клетку-хозяин за счет прикрепления к рецепторам хозяина, что может быть опосредовано клатрин-опосредованный эндоцитоз[10] или же клатрин -независимый динамин -зависимый эндоцитоз.[11] Белок NS-1 имеет ДНК-геликазу суперсемейства 3 и мотив эндонуклеазы HuH. Эти мотивы характерны для небольших ДНК-вирусов. Белки, содержащие эти мотивы, связываются с вирусными источниками репликации, раскручивают и разрывают эти источники, обеспечивая доступ белков хозяина к вирусному геному для репликация и транскрипция. Геном воспроизводится с помощью уникального механизма «шпилька». ДНК-шаблонная транскрипция с некоторым альтернативным механизмом сплайсинга - это способ транскрипции.[3][10]

Таксономия

В настоящее время признано восемь родов, включающих в себя 17 видов:

Амбиденсовирус ранее считался родом, но в 2019 году он был разделен на шесть родов с префиксом Aqu-, Blatt-, Hemi-, Пефу-, Прото-, и Сциндо-.[12]

Рекомендации

  1. ^ «Подсемейство: Densovirinae». Отчет ICTV по таксономии вирусов (10-й отчет). ICTV. Получено 13 мая 2020.
  2. ^ Котмор, Сан-Франциско; Agbandje-McKenna, M; Канути, М; Chiorini, JA; Эйс-Хубингер, А; Хьюз, Дж; Mietzsch, M; Modha, S; Ольястро, М; Пензес, JJ; Пинтель, диджей; Цю, Дж; Содерлунд-Венермо, М; Tattersall, P; Tijssen, P; и Консорциум отчетов ICTV (2019). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Parvoviridae". Журнал общей вирусологии. 100 (3): 367–368. Дои:10.1099 / jgv.0.001212. ЧВК  6537627. PMID  30672729.
  3. ^ а б c "10-й отчет ICTV (2018 г.) Parvoviridae".
  4. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 8 мая 2020.
  5. ^ "Densovirinae". ICTVdB - Универсальная база данных вирусов, версия 4. Получено 12 мая 2020.
  6. ^ а б Симпсон А.А., Чипман П.Р., Бейкер Т.С., Тейссен П., Россманн М.Г. (ноябрь 1998 г.). «Структура парвовируса насекомых (Galleria mellonella densovirus) при разрешении 3,7 A». Структура. 6 (11): 1355–67. Дои:10.1016 / S0969-2126 (98) 00136-1. ЧВК  4167665. PMID  9817847.
  7. ^ Pham HT, Huynh OT, Jousset FX, Bergoin M, Tijssen P (август 2013 г.). «Структура генома Junonia coenia Densovirus (JcDNV)». Анонсы генома. 1 (4). Дои:10.1128 / genomeA.00591-13. ЧВК  3738899. PMID  23929483.
  8. ^ Дюма Б., Журдан М., Паско А.М., Бергойн М. (ноябрь 1992 г.). «Полная нуклеотидная последовательность клонированного инфекционного генома Junonia coenia densovirus обнаруживает уникальную организацию среди парвовирусов». Вирусология. 191 (1): 202–22. Дои:10.1016 / 0042-6822 (92) 90182-О. PMID  1413502.
  9. ^ Брюммер А., Схолари Ф., Лопес-Фербер М., Конвей Дж. Ф., Хеват Э. А. (апрель 2005 г.). «Структура парвовируса насекомых (Junonia coenia Densovirus), определенная с помощью криоэлектронной микроскопии». Журнал молекулярной биологии. 347 (4): 791–801. Дои:10.1016 / j.jmb.2005.02.009. PMID  15769470.
  10. ^ а б «Вирусная зона». ExPASy. Получено 12 мая 2020.
  11. ^ Ван И, Госселин Грене А.С., Кастелли И., Черменати Дж., Раваллек М., Фиандра Л., Дебезье С., Мюльто С., Лотреду Н., Дюпрессуар Т., Ли И., Касартелли М., Ольястро М. (ноябрь 2013 г.). «Дензовирус проникает через среднюю кишку насекомых путем трансцитоза и нарушает функцию эпителиального барьера». Журнал вирусологии. 87 (22): 12380–91. Дои:10.1128 / JVI.01396-13. ЧВК  3807927. PMID  24027326.
  12. ^ «История таксономии ICTV: Амбиденсовирус». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 12 мая 2020.