Dicistroviridae - Dicistroviridae

Dicistroviridae
Mn5025fig1mag (a) .jpg
Молекулярные поверхности Вирус триатомы (TrV) и Вирус паралича сверчка (CrPV)
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Класс:Pisoniviricetes
Порядок:Пикорнавиралес
Семья:Dicistroviridae
Рода

Dicistroviridae это семья вирусы в порядке Пикорнавиралес. Беспозвоночные, в том числе тля, цикадки, мухи, пчелы, муравьи, и тутовые шелкопряды, служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом семействе 15 видов, разделенных на три рода.[1][2] Заболевания, связанные с этим семейством, включают: DCV: повышенный репродуктивный потенциал. чрезвычайно патогенен при инъекции с высокой сопутствующей смертностью. CrPV: паралич и смерть.[2][3]

Таксономия

Филогенетическое дерево Dicistroviridae

Хотя многие дицистровирусы изначально были помещены в Picornaviridae, с тех пор они были переведены в свою семью. Название (Dicistro) происходит от характеристики дицистронный расположение генома.

Эта семья является членом Ордена Пикорнавиралес (вместе с семьями Iflaviridae, Picornaviridae, и Secoviridae и Marnaviridae ). В этом порядке порядок генов - это порядок генов неструктурных белков Hel (геликаза) -Pro (протеаза) -RdRp (полимераза). В Dicistroviridae можно отличить от представителей таксонов по расположению их структурных белковых генов на 3'-конце, а не на 5'-конце (как показано в Ифлавирус, Picornaviridae и Secoviridae) и наличием двух геномных сегментов, а не одного (как в Комовирус).[2]

Группа: оцРНК (+)Порядок: ПикорнавиралесСемья: DicistroviridaeРод: Апаравирус

Род: Крипавирус

Род: Триатовирус

[2]

Linepithema humile virus 1 возможно, является членом Dicistroviridae неясного местонахождения.

Структура

Геном вирус паралича сверчка (CrPV) из семьи Dicistroviridea

Вирусы в Dicistroviridae без оболочки, с геометрией икосаэдра и T = псевдо3-симметрией. Диаметр около 30 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 8,5-10,2 килобайт. В геноме есть 2 открытые рамки считывания.[2][3]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
АпаравирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейный
КрипавирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации и пропуска рибосом. Беспозвоночные служат естественным хозяином. Пути передачи - это заражение.[2][3]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
АпаравирусБеспозвоночные: пчелы, шмели.НиктоНеизвестноНеизвестноЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестно
КрипавирусБеспозвоночныеНиктоЭндоцитоз клеточных рецепторовПочкованиеЦитоплазмаЦитоплазмаЕда

Структурные элементы РНК

Многие из Dicistroviridae геномы содержат структурированные элементы РНК. Например, Крипавирусы есть внутренний сайт входа рибосомы,[4] который имитирует Met-тРНК и используется в инициация перевода.[5]

использованная литература

  1. ^ Валлес, СМ; Чен, Y; Ферт, AE; Guérin, DM; Хашимото, Y; Herrero, S; де Миранда-младший; Рябов, Э; Консорциум отчетов ICTV (март 2017 г.). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Dicistroviridae". Журнал общей вирусологии. 98 (3): 355–356. Дои:10.1099 / jgv.0.000756. ЧВК  5797946. PMID  28366189.
  2. ^ а б c d е ж "Dicistrovirdae". Отчет ICTV Online (10).
  3. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  4. ^ Канамори, Й; Накашима Н (2001). «Модель третичной структуры внутреннего сайта входа в рибосому (IRES) для метионин-независимой инициации трансляции». РНК. 7 (2): 266–274. Дои:10.1017 / S1355838201001741. ЧВК  1370084. PMID  11233983.
  5. ^ Малис Н., Маккарти JEG (2010). «Инициирование перевода: можно ожидать вариаций в механизме». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 68 (6): 991–1003. Дои:10.1007 / s00018-010-0588-z. PMID  21076851.
  • Хантер, WB, Katsar, CS, Chaparro, JX. 2006. Молекулярный анализ капсидного белка Вирус Homalodisca coagulata-1, новый вирус, заражающий цикадку, от стекляннокрылого снайпера, Homalodisca coagulata. Журнал насекомых 6:31
  • Ханникатт, LE, Хантер, WB, Cave RD, Пауэлл, Калифорния, Mozoruk, JJ. 2006. Последовательность генома и молекулярная характеристика Вирус Homalodisca coagulata-1, новый вирус, обнаруженный у стекляннокрылого снайпера (Hemiptera: Cicadellidae). Вирусология 350: 67–78
  • Валлес, С.М., Стронг, Калифорния, Данг, П.М., Хантер, В.Б., Перейра, Р.М., Ой, Д.Х., Шапиро, А.М., Уильямс, Д.Ф. 2004. Пикорноподобный вирус от красного завезенного огненного муравья. Solenopsis invicta: первоначальное открытие, последовательность генома и характеристика. Вирусология 328: 151–157
  • Де Миранда, Иоахим Р .; Кордони, Гвидо; Бадж, Джайлз (2010). «Вирус острого пчелиного паралича - вирус Кашмира пчелы - израильский вирусный комплекс острого паралича». Журнал патологии беспозвоночных. 103: S30 – S47. Дои:10.1016 / j.jip.2009.06.014. PMID  19909972.

внешние ссылки