EDEM1 - EDEM1

EDEM1
Идентификаторы
Псевдонимы	EDEM1, EDEM, усиление деградации ER альфа-маннозидазы, подобного протеину 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607673 MGI: 2180139 ГомолоГен: 33836 Генные карты: EDEM1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п26.1 Начинать 5,187,646 бп[1] Конец 5,219,958 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 E2 Начинать 108,828,641 бп[2] Конец 108,859,356 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • неправильно свернутый белок • маннозил-олигосахарид 1,2-альфа-маннозидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • отделение контроля качества эндоплазматического ретикулума • Мембрана Гольджи • агрессивный Биологический процесс • Обработка N-гликанов • положительная регуляция ретроградного транспорта белков, ER в цитозоль • обрезка концевой маннозы на ветви C • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • ответ на развернутый белок • убиквитин-зависимый гликопротеиновый путь ERAD • тримминг маннозы участвует в пути гликопротеина ERAD • убиквитин-зависимый путь ERAD Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9695	192193
Ансамбль	ENSG00000134109	ENSMUSG00000030104
UniProt	Q92611	Q925U4
RefSeq (мРНК)	NM_014674	NM_138677
RefSeq (белок)	NP_055489	NP_619618
Расположение (UCSC)	Chr 3: 5.19 - 5.22 Мб	Chr 6: 108,83 - 108,86 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Усиливающая деградацию ER альфа-маннозидаза-подобная 1 является фермент что у людей кодируется EDEM1 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134109 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030104 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Молинари М., Каланка В., Галли С., Лукка П., Паганетти П. (февраль 2003 г.). «Роль EDEM в высвобождении неправильно свернутых гликопротеинов из цикла калнексина». Наука. 299 (5611): 1397–400. Дои:10.1126 / science.1079474. PMID  12610306. S2CID  24092303.
6. «Ген Entrez: усилитель деградации EDEM1 ER, маннозидаза альфа-подобная 1».

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК Res. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
• Хосокава Н., Вада И., Хасегава К. и др. (2001). «Новый ER альфа-маннозидазоподобный белок ускоряет ER-ассоциированную деградацию». EMBO Rep. 2 (5): 415–22. Дои:10.1093 / embo-reports / kve084. ЧВК  1083879. PMID  11375934.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ода Y, Хосокава Н., Вада I, Нагата К. (2003). «EDEM как акцептор неправильно свернутых гликопротеинов, высвобождаемых из калнексина». Наука. 299 (5611): 1394–7. Дои:10.1126 / science.1079181. PMID  12610305. S2CID  28716209.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Оливари С., Галли С., Аланен Х. и др. (2005). «Новый индуцированный стрессом вариант EDEM, регулирующий деградацию гликопротеинов, связанную с эндоплазматическим ретикулумом». J. Biol. Chem. 280 (4): 2424–8. Дои:10.1074 / jbc.C400534200. PMID  15579471.
• Ода Й., Окада Т., Йошида Х. и др. (2006). «Derlin-2 и Derlin-3 регулируются ответом на развернутый белок млекопитающих и необходимы для ER-ассоциированной деградации». J. Cell Biol. 172 (3): 383–93. Дои:10.1083 / jcb.200507057. ЧВК  2063648. PMID  16449189.
• Хосокава Н., Вада И., Нацука Ю., Нагата К. (2006). «EDEM ускоряет ERAD, предотвращая образование аберрантного димера неправильно свернутого альфа-1-антитрипсина». Гены Клетки. 11 (5): 465–76. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.00957.x. PMID  16629899. S2CID  19832510.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Zuber C, Cormier JH, Guhl B и др. (2007). «EDEM1 выявляет везикулярный транспортный путь контроля качества из эндоплазматического ретикулума, не вовлекающий сайты выхода COPII». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (11): 4407–12. Дои:10.1073 / pnas.0700154104. ЧВК  1810509. PMID  17360537.