EPB49 - EPB49

DMTN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1QZP, 1ZV6
Идентификаторы
Псевдонимы	DMTN, DMT, EPB49, дематин, связывающий актин протеин
Внешние идентификаторы	OMIM: 125305 MGI: 99670 ГомолоГен: 1496 Генные карты: DMTN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p21.3 Начинать 22,048,995 бп[1] Конец 22,082,527 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 D2 | 14 36,32 см Начинать 70,601,263 бп[2] Конец 70,636,048 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание спектрина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание актина • рецепторное связывание • самоассоциация белков • связывание актиновой нити Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • проекция клетки • мембрана • корковый цитоскелет • клеточная мембрана • мембрана с плотной трубчатой ​​сеткой тромбоцитов • клеточная проекционная мембрана • актиновая нить • актиновый цитоскелет • спектрин-ассоциированный цитоскелет • перинуклеарная область цитоплазмы • эндомембранная система • цитоскелет • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • отрицательная регуляция адгезии клетки к субстрату • регулировка сборки ламеллиподиумов • клеточный ответ на ион кальция • регулирование сборки филоподий • реорганизация актинового филамента • регуляция организации актинового цитоскелета • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • положительное регулирование заживления ран • узел пучка актиновых филаментов • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • отрицательная регуляция нацеливания белка на мембрану • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-тирозина • положительная регуляция свертывания крови • кальций-опосредованная передача сигналов с использованием внеклеточного источника кальция • организация цитоскелета • покрытие актиновой нити • трансмембранный транспорт • отрицательная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • положительная регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути • секреция белка тромбоцитами • отрицательная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • кальций-опосредованная передача сигналов с использованием внутриклеточного источника кальция • положительная регуляция миграции фибробластов • отрицательная регуляция узла фокальной адгезии • организация актинового цитоскелета • положительное регулирование агрегации тромбоцитов • клеточный ответ на цАМФ • развитие эритроцитов • регулировка формы клеток • сборка макромолекулярного комплекса • ламеллиподиум в сборе Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2039	13829
Ансамбль	ENSG00000158856	ENSMUSG00000022099
UniProt	Q08495	Q9WV69
RefSeq (мРНК)	NM_001114135 NM_001114136 NM_001114137 NM_001114138 NM_001114139 NM_001302816 NM_001302817 NM_001978 NM_001323378 NM_001323380 NM_001323381 NM_001323382 NM_001323383 NM_001323384 NM_001323385 NM_001323387 NM_001323388 NM_001323389 NM_001323390 NM_001323391 NM_001323392 NM_001323393 NM_001323394 NM_001323395 NM_001323396 NM_001323397 NM_001323398 NM_001323399 NM_001323400 NM_001323401 NM_001323379	NM_001252662 NM_001252663 NM_001252664 NM_001252665 NM_001252666 NM_013514 NM_001360024 NM_001360025 NM_001360026 NM_001360027 NM_001360028 NM_001360029 NM_001360030
RefSeq (белок)	NP_001107607 NP_001107608 NP_001107609 NP_001107610 NP_001107611 NP_001289745 NP_001289746 NP_001310307 NP_001310308 NP_001310309 NP_001310310 NP_001310311 NP_001310312 NP_001310313 NP_001310314 NP_001310316 NP_001310317 NP_001310318 NP_001310319 NP_001310320 NP_001310321 NP_001310322 NP_001310323 NP_001310324 NP_001310325 NP_001310326 NP_001310327 NP_001310328 NP_001310329 NP_001310330 NP_001969	NP_001239591 NP_001239592 NP_001239593 NP_001239594 NP_001239595 NP_038542 NP_001346953 NP_001346954 NP_001346955 NP_001346956 NP_001346957 NP_001346958 NP_001346959
Расположение (UCSC)	Chr 8: 22.05 - 22.08 Мб	Chr 14: 70,6 - 70,64 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дематин это белок что в люди кодируется EPB49 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158856 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022099 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рана А.П., Рафф П., Маалуф Г.Дж., Спайчер Д.В., Чишти А.Х. (август 1993 г.). «Клонирование человеческого эритроидного дематина выявило еще одного члена семьи виллинов». Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (14): 6651–5. Дои:10.1073 / pnas.90.14.6651. ЧВК  46990. PMID  8341682.
6. Кханна Р., Чанг С.Х., Андраби С., Азам М., Ким А., Ривера А., Бругнара С., Лоу PS, Лю С.К., Чишти А.Х. (май 2002 г.). «Головной домен дематина необходим для стабильности мембраны эритроцитов». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (10): 6637–42. Дои:10.1073 / pnas.052155999. ЧВК  124455. PMID  12011427.
7. «Ген Entrez: полоса 4,9 мембранного белка эритроцитов EPB49 (дематин)».

дальнейшее чтение

• Азим А.С., Нолл Дж. Х., Беггс А. Х., Чишти А. Х. (1995). «Клонирование изоформ, связывание актина и хромосомная локализация эритроидного дематина человека, члена суперсемейства виллинов». J. Biol. Chem. 270 (29): 17407–13. Дои:10.1074 / jbc.270.29.17407. PMID  7615546.
• Азим А.С., Марфатия С.М., Корсгрен С. и др. (1996). «Дематин эритроцитов человека и белок 4.2 (паллидин) являются белками, связывающими АТФ». Биохимия. 35 (9): 3001–6. Дои:10.1021 / bi951745y. PMID  8608138.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Миллар JK, Christie S, Porteous DJ (2004). «Дрожжевые двухгибридные скрины задействуют DISC1 в развитии и функционировании мозга». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 311 (4): 1019–25. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.101. PMID  14623284.
• Фрэнк Б.С., Вардар Д., Чишти А.Х., Макнайт С.Дж. (2004). «Структура ЯМР дематиновой головной части выявляет динамическую петлю, которая конформационно изменяется при фосфорилировании в дистальном участке». J. Biol. Chem. 279 (9): 7909–16. Дои:10.1074 / jbc.M310524200. PMID  14660664.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Вермёлен В., Ван Тройс М., Бурри Д. и др. (2006). «Идентификация последовательности PXW как структурного привратника складки C-концевого субдомена головной части». J. Mol. Биол. 359 (5): 1277–92. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.04.042. PMID  16697408.