Ендров - Endrov

Ендров
Эндров изображение windows
Эндров изображение windows
Разработчики)Йохан Хенрикссон (Каролинский институт )
Стабильный выпуск
2.15 / 17 июня 2009 г. (официальный релиз)
Операционная системаЛюбые (Ява -на основании)
ТипОбработка изображений & Анализ изображений
ЛицензияНовая лицензия BSD
Интернет сайтwww.endrov.net

Ендров[1] является Открытый исходный код архитектура плагина предназначен для анализа изображений и обработки данных.[2] Основываясь на Ява, он переносится и может запускаться как локально, так и как апплет. Он вырос из потребности в передовом программном обеспечении с открытым исходным кодом, которое может справиться со сложными пространственно-временными данными изображений, в основном получаемыми с микроскопов в биологических исследованиях. Он заимствует большую часть философии от ImageJ но стремится заменить его, имея более современный дизайн.

Эндров вырос из потребности в программном обеспечении для картирования эмбриогенеза C.elegans.[3]

Ведущий разработчик Йохан Хенрикссон является доктором философии. студент на Каролинский институт.

Характеристики

Endrov - это одновременно библиотека и программа для визуализации. В дизайне сделан сильный акцент на отделении кода графического интерфейса пользователя от типов данных, фильтров и других подключаемых модулей обработки данных. Идея состоит в том, что программу можно использовать для повседневного использования или создания прототипов, а для более крупной пакетной обработки или интеграции код вызывается как библиотека.

Как программа Endrov может делать то, что вы ожидаете от обычного программного обеспечения для обработки изображений. Он предназначен для взлома; интеграция новых инструментов редактирования, окон и типов данных должна быть простой. Основными особенностями, которые отличают его от других программ обработки изображений, является то, что он может обрабатывать дополнительные измерения (XYZ, время, канал), которые необходимы для более серьезной микроскопии. Фильтры также можно использовать без непосредственного применения, и их можно объединить в последовательности фильтров. Данные (например, полученные в результате анализа) хранятся вместе с изображениями.

Собственный формат изображения - OST, но поддерживаются наиболее распространенные форматы.

Сравнение с ImageJ

ImageJ старше и, следовательно, более зрелый и имеет больше плагинов. Это ограничивает количество изменений ImageJ без нарушения обратной совместимости, что со временем приводит к накоплению недостатков дизайна. Эндров жертвует всей обратной совместимостью ради чистого дизайна. В то время как ImageJ состоит из ядра и довольно независимых плагинов, Endrov имеет несколько основных функций и множество зависимостей плагин-плагин. Цель состоит в том, чтобы усилить интеграцию и увеличить инкапсуляцию, тем самым уменьшить избыточность кода и упростить обслуживание. Например, графический интерфейс отделен от большинства плагинов алгоритмов; алгоритмы просто предоставляют описания ввода и вывода.

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Эндров был впервые представлен на международном уровне на International Worm Meeting 2007: Йохан Хенрикссон и др.: Virtual-Worm Base - инструмент для изучения происхождения и экспрессии специфичных для клеток генов в C. elegans
  2. ^ «Ендров: интегрированная платформа для анализа изображений» Природные методы. Проверено 22 сентября 2013 года.
  3. ^ Хенч, Дж; Хенрикссон, Дж; Lüppert, M; Бюрглин, Т.Р. (2009). «Пространственно-временная эталонная модель эмбриогенеза Caenorhabditis elegans с картами контакта клеток». Биология развития. 333 (1): 1–13. Дои:10.1016 / j.ydbio.2009.06.014. PMID  19527702.

внешние ссылки