Эпиплакин - Epiplakin

ЭППК1
Идентификаторы
Псевдонимы	ЭППК1, EPIPL, EPIPL1, эпиплакин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607553 MGI: 2386306 ГомолоГен: 20006 Генные карты: ЭППК1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.3 Начните 143,857,324 бп[1] Конец 143,878,467 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание РНК • связывание с белками цитоскелета • связка промежуточных волокон • структурная молекулярная активность • кератиновое связывание нитей Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет • клеточная мембрана • двухклеточное плотное соединение • мембрана • базолатеральная плазматическая мембрана • апиколатеральная плазматическая мембрана • соединение клеток • гемидесмосома • проекция клетки • кератиновая нить • периферия клетки • перинуклеолярный отсек • промежуточная нить Биологический процесс • отрицательная регуляция пролиферации кератиноцитов • отрицательное регулирование миграции клеток • лечение раны • организация промежуточной нити • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • отрицательная регуляция миграции кератиноцитов • отрицательная регуляция заживления ран • регуляция регенерации эпителия • организация цитоскелета • организация цитоскелета промежуточных филаментов • сборка промежуточного пучка волокон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	83481	223650
Ансамбль	ENSG00000261150	ENSMUSG00000115388
UniProt	P58107	Q8R0W0
RefSeq (мРНК)	NM_031308	NM_144848
RefSeq (белок)	NP_112598	NP_659097
Расположение (UCSC)	Chr 8: 143,86 - 143,88 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эпиплакин это белок что у людей кодируется ЭППК1 ген.^[4][5][6] Он принадлежит к семье Плакин белки и содержится в человек эпидермис.^[4] Он состоит из 13 доменов, которые все похожи на B-домен, расположенный на С-конце эпидермального и эпидермиса человека. сердечная мышца белок десмоплакин.^[7] Домены в эпиплакине находятся в диапазоне 46-70% гомологии с этим доменом В в десмоплакине.^[8] Впервые он был идентифицирован как аутоантиген у человека, который страдает редким аутоиммунным заболеванием кожи.^[4] Эпиплакин был секвенирован таким образом, чтобы он содержал в общей сложности 5065 аминокислотных остатков, и исходя из его аминокислотного состава, он имел молекулярную массу около 552 кДа.^[4]

Было обнаружено, что эпиплакин связывается с кератин нитей и может способствовать подавлению роста нитей. Это подозревается из-за того, что связанный с кератином эпиплакин обнаруживается в основном в точках ветвления и конечных точках кератиновых волокон.^[9] Блокирование экспрессии эпиплакина в культивированных роговица эпителиальные клетки через миРНК был связан с более быстрым закрытием ран и более быстрой миграцией клеток роговицы.^[10] Это может быть связано с потерей эпиплакина, приводящей к модификации цитоскелет в эпителиальных клетках ..^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000261150 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Fujiwara S, Takeo N, Otani Y, Parry DA, Kunimatsu M, Lu R и др. (Апрель 2001 г.). «Эпиплакин, новый член семейства Плакинов, первоначально идентифицированный как эпидермальный аутоантиген человека массой 450 кДа. Структура и локализация в тканях». Журнал биологической химии. 276 (16): 13340–7. Дои:10.1074 / jbc.M011386200. PMID  11278896.
5. Джанг С.И., Калинин А., Такахаши К., Мареков Л.Н., Штайнерт П.М. (февраль 2005 г.). «Характеристика человеческого эпиплакина: опосредованное РНКи истощение эпиплакина приводит к разрушению сетей IF кератина и виментина». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 4): 781–93. Дои:10.1242 / jcs.01647. PMID  15671067.
6. «Энтрез Ген: EPPK1 эпиплакин 1».
7. Fujiwara S, Takeo N, Otani Y, Parry DA, Kunimatsu M, Lu R и др. (Апрель 2001 г.). «Эпиплакин, новый член семейства Плакинов, первоначально идентифицированный как эпидермальный аутоантиген человека массой 450 кДа. Структура и локализация в тканях». Журнал биологической химии. 276 (16): 13340–7. Дои:10.1074 / jbc.M011386200. PMID  11278896.
8. Такео Н., Ван В., Мацуо Н., Сумиёси Х., Йошиока Х., Фудзивара С. (ноябрь 2003 г.). «Структура и гетерогенность человеческого гена эпиплакина (EPPK1)». Журнал следственной дерматологии. 121 (5): 1224–6. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12550_5.x. PMID  14708632.
9. Ван В., Сумиёси Х., Йошиока Х., Фудзивара С. (август 2006 г.). «Взаимодействие между эпиплакином и промежуточными филаментами». Журнал дерматологии. 33 (8): 518–27. Дои:10.1111 / j.1346-8138.2006.00127.x. PMID  16923132. S2CID  25372989.
10. Кокадо М., Окада Ю., Миямото Т., Яманака О, Сайка С. (май 2016 г.). «Эффекты нокдауна эпиплакина в культивируемых эпителиальных клетках роговицы». BMC Research Notes. 9 (1): 278. Дои:10.1186 / s13104-016-2082-7. ЧВК  4873999. PMID  27206504.

дальнейшее чтение

• Fujiwara S, Kohno K, Iwamatsu A, Naito I, Shinkai H (май 1996). «Идентификация эпидермального аутоантигена человека массой 450 кДа как нового члена семейства плектинов». Журнал следственной дерматологии. 106 (5): 1125–30. Дои:10.1111 / 1523-1747.ep12340171. PMID  8618051.
• Благоев Б., Кратчмарова И., Онг С.Е., Нильсен М., Фостер Л.Дж., Манн М. (март 2003 г.). «Стратегия протеомики для выяснения функциональных межбелковых взаимодействий, применяемая к передаче сигналов EGF». Природа Биотехнологии. 21 (3): 315–8. Дои:10.1038 / nbt790. PMID  12577067. S2CID  26838266.
• Геваерт К., Гётальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Spazierer D, Fuchs P, Pröll V, Janda L, Oehler S, Fischer I, et al. (Август 2003 г.). «Анализ гена эпиплакина у мышей выявил единственный экзон, кодирующий белок массой 725 кДа, экспрессия которого ограничена эпителиальными тканями». Журнал биологической химии. 278 (34): 31657–66. Дои:10.1074 / jbc.M303055200. PMID  12791695.
• Такео Н., Ван В., Мацуо Н., Сумиёси Х., Йошиока Х., Фудзивара С. (ноябрь 2003 г.). «Структура и гетерогенность человеческого гена эпиплакина (EPPK1)». Журнал следственной дерматологии. 121 (5): 1224–6. Дои:10.1046 / j.1523-1747.2003.12550_5.x. PMID  14708632.
• Ким Дж. Э., Танненбаум SR, Белый FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». Журнал протеомных исследований. 4 (4): 1339–46. Дои:10.1021 / pr050048h. PMID  16083285.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.