Компонент экзосомы 7 - Exosome component 7

EXOSC7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NN6
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOSC7, EAP1, RRP42, Rrp42p, hRrp42p, p8, компонент экзосомы 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 606488 MGI: 1913696 ГомолоГен: 8994 Генные карты: EXOSC7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.31 Начните 44,975,241 бп[1] Конец 45,036,066 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F4 Начните 123,113,215 бп[2] Конец 123,136,129 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • активность экзорибонуклеазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • Привязка элементов AU-rich Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • экзосома (комплекс РНКазы) • ядрышко • нуклеоплазма • ядро клетки • ядерная экзосома (РНКазный комплекс) • цитоплазматическая экзосома (комплекс РНКазы) Биологический процесс • регуляция стабильности мРНК • Катаболический процесс РНК • обработка рРНК • экзонуклеолитическая обрезка для получения зрелого 3'-конца 5.8S рРНК из трицистронного транскрипта рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • ядерно-транскрибируемая мРНК, катаболический процесс, экзонуклеолитический, 3'-5 ' • 3'-конец процессинга мяРНК U1 • 3'-конец процессинга мяРНК U4 • Процессинг 3'-конца мяРНК U5 • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • наблюдение за ядерной мРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс рРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс тРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс мРНК • катаболический процесс рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23016	66446
Ансамбль	ENSG00000075914	ENSMUSG00000025785
UniProt	Q15024	Q9D0M0
RefSeq (мРНК)	NM_015004	NM_001081188
RefSeq (белок)	NP_055819	NP_001074657
Расположение (UCSC)	Chr 3: 44.98 - 45.04 Мб	Chr 9: 123.11 - 123.14 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент экзосомы 7, также известен как EXOSC7, это человек ген, белковый продукт которого входит в состав экзосомальный комплекс.^[5]

Взаимодействия

Компонент 7 экзосомы может взаимодействовать с участием:

• Компонент экзосомы 1,^[6][7]
• Компонент экзосомы 2,^[6] и
• Компонент экзосомы 6.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075914 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025785 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Entrez Gene: экзосомный компонент 7 EXOSC7».
6. Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / с0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
7. Raijmakers R, Noordman YE, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (январь 2002 г.). «Белок-белковые взаимодействия hCsl4p с другими субъединицами экзосом человека». J. Mol. Биол. 315 (4): 809–18. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID  11812149.

дальнейшее чтение

• Батлер Дж. С. (2002). «Инь и янь экзосомы». Тенденции Cell Biol. 12 (2): 90–6. Дои:10.1016 / S0962-8924 (01) 02225-5. PMID  11849973.
• Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID  7788527.
• Брауэр Р., Аллманг С., Райджмейкерс Р. и др. (2001). «Три новых компонента экзосомы человека». J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. Дои:10.1074 / jbc.M007603200. PMID  11110791.
• Chen CY, Gherzi R, Ong SE и др. (2002). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Ячейка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186. S2CID  14817671.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Райджмейкерс Р., Нордман Ю.Е., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белок-белковые взаимодействия hCsl4p с другими субъединицами экзосом человека». J. Mol. Биол. 315 (4): 809–18. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID  11812149.
• Брауэр Р., Ври Эгбертс В. Т., Хенгстман Г. Дж. И др. (2002). «Аутоантитела, направленные к новым компонентам комплекса PM / Scl, экзосомы человека». Артрит Res. 4 (2): 134–8. Дои:10.1186 / ar389. ЧВК  83843. PMID  11879549.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венроой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.