Компонент экзосомы 8 - Exosome component 8

EXOSC8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NN6
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOSC8, CIP3, EAP2, OIP2, RRP43, Rrp43p, bA421P11.3, p9, PCH1C, компонент экзосомы 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 606019 MGI: 1916889 ГомолоГен: 12323 Генные карты: EXOSC8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q13.3 Начните 36,998,816 бп[1] Конец 37,009,614 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 С Начните 54,728,678 бп[2] Конец 54,735,393 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность экзорибонуклеазы • Привязка элементов AU-rich • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • идентичное связывание с белками • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • экзосома (комплекс РНКазы) • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерная экзосома (РНКазный комплекс) • цитоплазматическая экзосома (комплекс РНКазы) Биологический процесс • регуляция стабильности мРНК • Обработка РНК • Катаболический процесс РНК • обработка рРНК • экзонуклеолитическая обрезка для получения зрелого 3'-конца 5.8S рРНК из трицистронного транскрипта рРНК (SSU-рРНК, 5.8S рРНК, LSU-рРНК) • ядерно-транскрибируемая мРНК, катаболический процесс, экзонуклеолитический, 3'-5 ' • 3'-конец процессинга мяРНК U1 • 3'-конец процессинга мяРНК U4 • Процессинг 3'-конца мяРНК U5 • экзонуклеолитическая транскрибируемая ядерной мРНК катаболический процесс, вовлеченный в зависимый от деаденилирования распад • наблюдение за ядерной мРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс рРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс тРНК • зависимый от ядерного полиаденилирования катаболический процесс мРНК • биологический процесс • катаболический процесс рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11340	69639
Ансамбль	ENSG00000120699	ENSMUSG00000027752
UniProt	Q96B26	Q9D753
RefSeq (мРНК)	NM_181503	NM_001163570 NM_027148
RefSeq (белок)	NP_852480	NP_001157042 NP_081424
Расположение (UCSC)	Chr 13:37 - 37,01 Мб	Chr 3: 54,73 - 54,74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент экзосомы 8, также известен как EXOSC8, это человек ген, то белок продукт, который является частью экзосомальный комплекс.^[5]

Взаимодействия

Было показано, что компонент экзосомы 8 взаимодействовать с участием:

• Компонент экзосомы 5^[6] и
• Компонент экзосомы 6.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120699 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027752 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: экзосомный компонент 8 EXOSC8".
6. Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / с0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.

дальнейшее чтение

• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Райджмакерс Р., Эгбертс В.В., ван Венроой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белковые взаимодействия между компонентами экзосом человека поддерживают сборку субъединиц РНКазы PH в шестичленное кольцо, подобное PNPase». J. Mol. Биол. 323 (4): 653–63. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00947-6. PMID  12419256.
• Цзян Т., Альтман С. (2002). «Белковая субъединица РНКазы P человека, Rpp14, и ее взаимодействующий партнер, OIP2, обладают 3 '→ 5' экзорибонуклеазной активностью». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (8): 5295–300. Дои:10.1073 / pnas.072083699. ЧВК  122763. PMID  11929972.
• Райджмейкерс Р., Нордман Ю.Е., ван Венройдж В.Дж., Пруейн Г.Дж. (2002). «Белок-белковые взаимодействия hCsl4p с другими субъединицами экзосом человека». J. Mol. Биол. 315 (4): 809–18. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5265. PMID  11812149.
• Chen CY, Gherzi R, Ong SE и др. (2002). «Связывающие белки AU рекрутируют экзосому для разрушения мРНК, содержащих ARE». Ячейка. 107 (4): 451–64. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00578-5. PMID  11719186.
• Цзян Т., Альтман С. (2001). «Белковые взаимодействия с субъединицами ядерной РНКазы Р человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (3): 920–5. Дои:10.1073 / pnas.021561498. ЧВК  14685. PMID  11158571.
• Брауэр Р., Аллманг С., Райджмейкерс Р. и др. (2001). «Три новых компонента экзосомы человека». J. Biol. Chem. 276 (9): 6177–84. Дои:10.1074 / jbc.M007603200. PMID  11110791.
• Уильямс Дж. М., Чен Г. К., Чжу Л., Rest RF (1998). «Использование дрожжевой двугибридной системы для идентификации белков эпителиальных клеток человека, которые связывают гонококковые белки Opa: внутриклеточные гонококки связывают пируваткиназу через свои белки Opa и требуют пирувата хозяина для роста». Мол. Микробиол. 27 (1): 171–86. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1998.00670.x. PMID  9466265.