Внехромосомный массив - Extrachromosomal array

An внехромосомный массив это метод для мозаичный анализ в генетика. Это космид, и содержит два функционирующих (дикого типа ) тесно связаны гены: а интересующий ген и маркер для мозаики. Такой массив вводится в линия зародыша клетки, которые уже содержат мутант (в частности, Потеря функции ) аллели всех трех генов в их хромосомная ДНК. Космид, неправильно упакованный во время митоз, иногда присутствует только в одной дочерней клетке после клеточного деления. Дочерняя ячейка, содержащая массив, выражает интересующий ген; ячейка, в которой отсутствует массив, - нет.

В маркер для мозаики это ген, который проявляет видимую фенотип изменение между функционирующими и нефункционирующими аллелями. Например, ncl-1, расположенный в хромосомной ДНК, демонстрирует более крупный ядрышко чем аллель дикого типа, который находится в массиве. Таким образом, клетки с более крупными ядрышками обычно не сохраняют внехромосомный массив.

В интересующий ген является целью мозаичного анализа. Клетки, лишенные внехромосомного массива, также не имеют интересующего функционального гена. Клеткам, которые нормально развиваются без массива, не требуется интересующий ген для нормального функционирования. Говорят, что клетки, которые не развиваются нормально, нуждаются в гене. Таким образом можно идентифицировать те клеточные линии, которым требуется конкретный ген.

Внехромосомные массивы заменяют более ранний метод с использованием дублированного участка хромосомы, называемого бесплатное копирование. Последний метод требует, чтобы интересующий ген и мозаичный маркер были тесно связаны при дупликации; первый позволяет свободно выбирать мозаичный маркер и целевой ген.

Рекомендации

Миллер Л.М., Варинг Д.А., Ким С.К. (1996). Анализ мозаики с использованием ncl-1 (+) внехромосомный массив показывает, что лин-31 действует в клетках Pn.p во время Caenorhabditis elegans развитие вульвы. Генетика 143 (3): 1181-1191.