FASTKD5 - FASTKD5

FASTKD5
Идентификаторы
Псевдонимы	FASTKD5, dJ1187M17.5, FAST киназные домены 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 614272 MGI: 2139469 ГомолоГен: 36400 Генные карты: FASTKD5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 20 (человек)
Конец	3,159,865 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	130,630,027 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность протеинкиназы; • связывание рРНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК;
Сотовый компонент	• гранула рибонуклеопротеина; • митохондриальный нуклеоид; • митохондрия;
Биологический процесс	• клеточное дыхание; • фосфорилирование белков; • обработка мРНК; • процессинг митохондриальной РНК;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	60493
	380601
	ENSG00000215251
	ENSMUSG00000079043
	Q7L8L6
	Q7TMV3
	NM_021826
	NM_001146084; NM_198176; NM_001377124; NM_001377125
	NP_068598
	NP_001139556; NP_937819; NP_001364053; NP_001364054
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок 5, содержащий киназный домен FAST (FASTKD5) - это белок что у людей кодируется FASTKD5 ген на хромосоме 20.^[5]^[6] Этот белок является частью семейства FASTKD, известного своей регуляцией энергетического баланса митохондрии под напряжением.^[7]^[8] FASTKD5 также необходим гранулам РНК для обработки мРНК-предшественников, не фланкированных тРНК.^[9]

Структура

FASTKD5 имеет общие структурные характеристики семейства FASTKD, включая амино-концевой митохондриальный целевой домен и три C-терминал домены: два FAST-киназоподобных домена (FAST_1 и FAST_2) и РНК-связывающий домен (RAP).^[7]^[8] Митохондриальный нацеливающий домен направляет FASTKD5 на импорт в митохондрии. Хотя функции C-концевых доменов неизвестны, RAP, возможно, связывает РНК во время транс-сплайсинга.^[7] Этот белок образует белковый комплекс 103 кДа с неидентифицированными белками.^[9]

Функция

Как член семейства FASTKD, FASTKD5 локализуется в митохондриях, чтобы модулировать их энергетический баланс, особенно в условиях стресса. Хотя он повсеместно экспрессируется во всех тканях, FASTKD5 в большей степени проявляется в скелетных мышцах, сердечной мышце и других тканях, обогащенных митохондриями.^[7] FASTKD5 также локализуется в гранулах РНК, безмембранных телах, содержащих мРНК и ассоциированные РНК-связывающие белки, где он облегчает посттранскрипционный процессинг РНК. Этот белок необходим для созревания мРНК-предшественников, которые не фланкируются тРНК, и, следовательно, не могут быть обработаны каноническим путем созревания мРНК.^[9]

Клиническое значение

Хотя связь с FASTKD5 остается не охарактеризованной, накопление аномальных гранул РНК может привести к некоторым нейродегенеративные заболевания.^[9]

Взаимодействия

FASTKD5 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000215251 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079043 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ UniProt: Q7L8L6
^ «Ген Entrez: домены киназы FAST 5».
^ ^а ^б ^c ^d Симарро М., Хименес-Кассина А., Кедерша Н., Лазаро Дж. Б., Адельмант Г. О., Марто Дж. А., Ри К., Тисдейл С., Даниал Н., Бенарафа С., Ордунья А., Андерсон П. (октябрь 2010 г.). «Протеин 3, содержащий быстрый киназный домен, является митохондриальным белком, необходимым для клеточного дыхания». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 401 (3): 440–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. ЧВК 2963690. PMID 20869947.
^ ^а ^б Йунг К.Т., Дас С., Чжан Дж., Ломничи А., Охеда С.Р., Сюй К.Ф., Нойберт Т.А., Самуэльс Х.Х. (июнь 2011 г.). «Новый транскрипционный комплекс, который избирательно модулирует апоптоз клеток рака груди посредством регуляции FASTKD2». Молекулярная и клеточная биология. 31 (11): 2287–98. Дои:10.1128 / MCB.01381-10. ЧВК 3133243. PMID 21444724.
^ ^а ^б ^c ^d ^е ^ж ^грамм Антоника Х., Шубридж Э.А. (февраль 2015 г.). «Гранулы митохондриальной РНК являются центрами посттранскрипционной обработки РНК и биогенеза рибосом». Отчеты по ячейкам. 10 (6): 920–932. Дои:10.1016 / j.celrep.2015.01.030. PMID 25683715.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000215251 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079043 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[uniprot-5] UniProt: Q7L8L6

[entrez-6] «Ген Entrez: домены киназы FAST 5».

[pmid20869947-7] а ^б ^c ^d Симарро М., Хименес-Кассина А., Кедерша Н., Лазаро Дж. Б., Адельмант Г. О., Марто Дж. А., Ри К., Тисдейл С., Даниал Н., Бенарафа С., Ордунья А., Андерсон П. (октябрь 2010 г.). «Протеин 3, содержащий быстрый киназный домен, является митохондриальным белком, необходимым для клеточного дыхания». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 401 (3): 440–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. ЧВК 2963690. PMID 20869947.

[pmid21444724-8] а ^б Йунг К.Т., Дас С., Чжан Дж., Ломничи А., Охеда С.Р., Сюй К.Ф., Нойберт Т.А., Самуэльс Х.Х. (июнь 2011 г.). «Новый транскрипционный комплекс, который избирательно модулирует апоптоз клеток рака груди посредством регуляции FASTKD2». Молекулярная и клеточная биология. 31 (11): 2287–98. Дои:10.1128 / MCB.01381-10. ЧВК 3133243. PMID 21444724.

[pmid25683715-9] а ^б ^c ^d ^е ^ж ^грамм Антоника Х., Шубридж Э.А. (февраль 2015 г.). «Гранулы митохондриальной РНК являются центрами посттранскрипционной обработки РНК и биогенеза рибосом». Отчеты по ячейкам. 10 (6): 920–932. Дои:10.1016 / j.celrep.2015.01.030. PMID 25683715.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]