FERMT3 - FERMT3 - Wikipedia

FERMT3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YS3
Идентификаторы
Псевдонимы	FERMT3, KIND3, MIG-2, MIG2B, UNC112C, URP2, URP2SF, член семейства фермитинов 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 607901 MGI: 2147790 ГомолоГен: 12877 Генные карты: FERMT3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начинать 64,206,678 бп[1] Конец 64,223,886 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 6,998,958 бп[2] Конец 7,019,469 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание интегрина Сотовый компонент • подосомы • соединение клеток • проекция клетки • внеклеточная экзосома • мембрана • внеклеточная область • просвет альфа-гранул тромбоцитов Биологический процесс • лейкоцитарная клеточная адгезия • интегрин-опосредованный сигнальный путь • регуляция межклеточной адгезии, опосредованная интегрином • активация интегрина • распространение клеток в зависимости от адгезии субстрата • клеточная адгезия • Скопление тромбоцитов • положительное регулирование миграции клеток • дегрануляция тромбоцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	83706	108101
Ансамбль	ENSG00000149781	ENSMUSG00000024965
UniProt	Q86UX7	Q8K1B8
RefSeq (мРНК)	NM_031471 NM_178443 NM_001382361 NM_001382362 NM_001382363 NM_001382364 NM_001382448	NM_153795 NM_001362399
RefSeq (белок)	NP_113659 NP_848537 NP_001369290 NP_001369291 NP_001369292 NP_001369293 NP_001369377	NP_722490 NP_001349328
Расположение (UCSC)	Chr 11: 64.21 - 64.22 Мб	Chr 19: 7 - 7.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог семейства фермитинов 3) (FERMT3), также известный как kindlin-3 (KIND3), MIG2-подобный белок (MIG2B) или unc-112-родственный белок 2 (URP2) - это белок что у людей кодируется FERMT3 ген.^[5][6][7] Семейство белков kindlin, член суперсемейства B4.1, включает три консервативных гомолога белков, kindlin 1, 2 и 3. Каждый из них содержит двудольный домен FERM, состоящий из четырех субдоменов F0, F1, F2 и F3, которые проявляют гомологию с FERM head (H) домен цитоскелета Талин протеин. Киндлины были связаны с Синдром Киндлера, недостаточность адгезии лейкоцитов, рак и другие приобретенные заболевания человека. Они важны в организации фокальных адгезий, которые опосредуют соединения клетки с внеклеточным матриксом и участвуют в других клеточных компартментах, которые контролируют межклеточные контакты и функционирование ядра. Следовательно, они ответственны за межклеточные перекрестные взаимодействия посредством межклеточных контактов и опосредованную интегрином клеточную адгезию через белки фокальной адгезии и в качестве специализированных адгезионных структур гемопоэтических клеток они также присутствуют в кольцевой структуре, окружающей F-актин подосомы. Изоформа 2 может действовать как репрессор НФ-каппа-Б и апоптоз^[8]

Последовательность белка FERMT-3

Эволюция

Было высказано предположение, что эволюционным источником единственного предкового белка киндлина являются самые ранние метазоа, Паразоа. У позвоночных эти предковые белки были подвергнуты процессам дупликации, чтобы получить настоящее семейство Киндлинов. По сравнению с другими членами суперсемейства белков B4.1, домены FERM в гомологах Kindlin обладают большей степенью консервативности.^[9] Наличие вставного домен гомологии плекстрина в пределах FERM домен, предполагает, что многоклеточный эволюция домена FERM происходит от прототипаталин белок в одноклеточных или прото-многоклеточных организмах.^[9][10]

Функция

Структура FERMT 3

Белок FERMT3 играет ключевую роль в регуляции гемостаз и тромбоз.^[10] Этот белок также может помочь поддерживать мембранный скелет эритроциты.^[5] Киндлин 3 - это сигнальный белок цитоскелета, участвующий в активации гликопротеинового рецептора интегрина.^[11] Вместе с Талин протеин он кооперативно связывается с цитоплазматическим доменом бета-интегрина, вызывая переориентацию хвоста, тем самым изменяя конформацию молекулы.^[12] Модификация конформации интегрина служит для диссоциации альфа- и бета-субъединиц, нарушая их взаимодействия и помогая молекуле принять состояние высокого сродства.^[9] FERMT3 функционирует как стабилизатор цитоскелет и регулирует его динамику в подвижности клеток и органелл.^[13]

Клиническое значение

Мутации FERMT3 могут привести к аутосомно-рецессивному недостаточность адгезии лейкоцитов синдром-III (LAD-III).^[5] дефицит активации бета1, бета2 и бета3 интегринов в тромбоциты и лейкоциты, вызывающие кровотечение и рецидивирующие инфекции.^[10] Потеря экспрессии FERMT3 в лейкоцитах ставит под угрозу их адгезию к воспаленному эндотелию и влияет на нейтрофил связывание и распространение, в то время как опосредованное селектином вращение не затрагивается.^[14] Также было обнаружено, что FERMT3 снижает Естественная клетка-убийца Порог активации, такой, что потеря FERMT3 влияет на активацию одного рецептора цитотоксичности, опосредованной NK-клетками, но не влияет на несколько рецепторов, где дефицит белка преодолевается и клетки-мишени погибают.^[15]

Дефицит FERMT3 на функцию интегрина β (2) зависит от обоих типов клеток (естественные клетки-киллеры или Лейкоциты ) и стимул активации интегрина.^[16] Предотвращение активации бета-3 конкретно связано с LAD-3, вызывая Тромбастения Гланцмана симптомы, состояние, при котором у пациентов происходит чрезмерное кровотечение.^[17] Дефицит адгезии лейкоцитов диагностируется клинически и с помощью общего анализа крови, который выявляет лейкоцитоз с нейтрофилия.^[16] Ведение и лечение этого заболевания направлено на борьбу с этими рецидивирующими инфекциями с помощью антибиотиков и переливаний крови, при этом трансплантация костного мозга является единственной лечебной мерой.^{[неосновной источник необходим ]} Неспособность экспрессировать белок FERMT3 нарушает способность образовывать сгустки и коагулировать, предотвращая опосредованную интегрином αIIβ3 агрегацию тромбоцитов.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149781 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024965 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гомолог 3 семейства фермитинов (Drosophila)».
6. Вайнштейн EJ, Bourner M, Head R, Zakeri H, Bauer C, Mazzarella R (апрель 2003 г.). «URP1: член нового семейства белков, связанных с мембраной, содержащих PH и FERM домен, значительно сверхэкспрессируется в карциномах легких и толстой кишки». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1637 (3): 207–16. Дои:10.1016 / S0925-4439 (03) 00035-8. PMID  12697302.
7. Boyd RS, Adam PJ, Patel S, Loader JA, Berry J, Redpath NT, Poyser HR, Fletcher GC, Burgess NA, Stamps AC, Hudson L, Smith P, Griffiths M, Willis TG, Karran EL, Oscier DG, Catovsky D , Терретт Дж. А., Дайер М. Дж. (Август 2003 г.). «Протеомный анализ мембраны клеточной поверхности при хроническом лимфолейкозе: идентификация двух новых белков, BCNP1 и MIG2B». Лейкемия. 17 (8): 1605–12. Дои:10.1038 / sj.leu.2402993. PMID  12886250.
8. Малинин Н.Л., Чжан Л., Чой Дж., Чоча А., Разоренова О., Ма YQ, Подрез Е.А., Тоси М., Леннон Д.П., Каплан А.И., Шурин С.Б., Плау Е.Ф., Бызова Т.В. (март 2009 г.). «Точечная мутация в KINDLIN3 отменяет активацию трех подсемейств интегринов у людей». Природа Медицина. 15 (3): 313–8. Дои:10,1038 / нм.1917. ЧВК  2857384. PMID  19234460.
9. Али Р.Х., Хан А.А. (ноябрь 2014 г.). «Отслеживание эволюции FERM домена киндлинов». Молекулярная филогенетика и эволюция. 80: 193–204. Дои:10.1016 / j.ympev.2014.08.008. PMID  25150025.
10. Лай-Чеонг Дж., Парсонс М., МакГрат Дж. А. (май 2010 г.). «Роль киндлины в клеточной биологии и отношение к болезням человека». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 42 (5): 595–603. Дои:10.1016 / j.biocel.2009.10.015. PMID  19854292.
11. Данен EHJ (2000–13). Интегрины: обзор структурных и функциональных аспектов. База данных Madame Curie Bioscience. Landes Bioscience.
12. Рогнони Э., Рупперт Р., Фесслер Р. (январь 2016 г.). «Семья киндлинов: функции, сигнальные свойства и последствия для болезней человека». Журнал клеточной науки. 129 (1): 17–27. Дои:10.1242 / jcs.161190. PMID  26729028.
13. Sun Z, Costell M, Fässler R (январь 2019 г.). «Активация интегрина талином, киндлином и механическими силами». Природа клеточной биологии. 21 (1): 25–31. Дои:10.1038 / s41556-018-0234-9. PMID  30602766. S2CID  57373556.
14. Штадтманн А., Зарбок А. (январь 2017 г.). «Роль киндлина в привлечении нейтрофилов к участкам воспаления». Текущее мнение в гематологии. 24 (1): 38–45. Дои:10.1097 / MOH.0000000000000294. PMID  27749372. S2CID  24844044.
15. Fagerholm SC, Lek HS, Morrison VL (2014). «Киндлин-3 в иммунной системе». Американский журнал клинической и экспериментальной иммунологии. 3 (1): 37–42. ЧВК  3960760. PMID  24660120.
16. Свенссон Л., Ховарт К., МакДауэлл А., Пацак И., Эванс Р., Уссар С., Мозер М., Метин А., Фрид М., Томлинсон И., Хогг Н. (март 2009 г.). «Дефицит адгезии лейкоцитов-III вызван мутациями в KINDLIN3, влияющими на активацию интегрина». Природа Медицина. 15 (3): 306–12. Дои:10,1038 / нм.1931. ЧВК  2680140. PMID  19234463.
17. Каракёзе Э., Шиллер Х.Б., Фесслер Р. (июль 2010 г.). "Киндлины с первого взгляда". Журнал клеточной науки. 123 (Пт 14): 2353–6. Дои:10.1242 / jcs.064600. PMID  20592181.

дальнейшее чтение

• Etzioni A (октябрь 2009 г.). «Генетическая этиология дефектов адгезии лейкоцитов». Текущее мнение в иммунологии. 21 (5): 481–6. Дои:10.1016 / j.coi.2009.07.005. PMID  19647987.
• Мори А., Фейгельсон С.В., Ярали Н., Килич С.С., Байхан Г.И., Гершони-Барух Р., Эциони А., Алон Р. (сентябрь 2008 г.). «Киндлин-3: новый ген, участвующий в патогенезе LAD-III». Кровь. 112 (6): 2591. Дои:10.1182 / кровь-2008-06-163162. PMID  18779414.</ref>
• Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Геномные исследования. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Бялковска К., Ма YQ, Бледзка К., Соссей-Алауи К., Изем Л., Чжан Х, Малинин Н., Цинь Дж., Бызова Т., Плау Е.Ф. (июнь 2010 г.). «Коактиватор интегрина Киндлин-3 экспрессируется и функционирует в негематопоэтической клетке, эндотелиальной клетке». Журнал биологической химии. 285 (24): 18640–9. Дои:10.1074 / jbc.M109.085746. ЧВК  2881789. PMID  20378539.
• Макдауэл А., Свенссон Л., Стэнли П., Пацак И., Чакраварти П., Ховарт К., Сабнис Х., Брионес М., Хогг Н. (июнь 2010 г.). «Две мутации в гене KINDLIN3 у нового пациента с недостаточностью адгезии лейкоцитов III степени выявляют различные эффекты на функцию лейкоцитов in vitro». Кровь. 115 (23): 4834–42. Дои:10.1182 / кровь-2009-08-238709. PMID  20357244.
• Харбургер Д.С., Буауина М., Колдервуд Д.А. (апрель 2009 г.). «Киндлин-1 и -2 напрямую связываются с С-концевой областью цитоплазматических хвостов бета-интегрина и проявляют интегрин-специфические эффекты активации». Журнал биологической химии. 284 (17): 11485–97. Дои:10.1074 / jbc.M809233200. ЧВК  2670154. PMID  19240021.
• Маневич-Мендельсон Э, Фейгельсон С.В., Пасвольский Р., Акер М., Грабовский В., Шульман З., Килич С.С., Розенталь-Альери М.А., Бен-Дор С., Мори А., Бернар А., Мозер М., Эциони А., Алон Р. (сентябрь 2009 г. ). «Потеря Kindlin-3 в LAD-III устраняет адгезию LFA-1, но не VLA-4, возникающую в условиях сдвигового потока». Кровь. 114 (11): 2344–53. Дои:10.1182 / кровь-2009-04-218636. PMID  19617577.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.