FLOT2 - FLOT2

FLOT2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WIN
Идентификаторы
Псевдонимы	FLOT2, ECS-1, ECS1, ESA, ESA1, M17S1, флотилин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 131560 MGI: 103309 ГомолоГен: 3293 Генные карты: FLOT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 28,879,335 бп[1] Конец 28,897,733 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B5 | 11 46,74 см Начните 78,037,931 бп[2] Конец 78,060,434 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание протеазы • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание ионотропных рецепторов глутамата Сотовый компонент • везикул • эндосома • мембрана • зона контакта ячейка • очаговая адгезия • эндоцитарный пузырек • акросомная мембрана • флотилин комплекс • уропод • базолатеральная плазматическая мембрана • апикальная плазматическая мембрана • кортикальный актиновый цитоскелет • перинуклеарная область цитоплазмы • Caveola • мембранный плот • внеклеточная экзосома • цитоплазматический пузырек • ламеллиподиум • клеточная мембрана • дендритная цитоплазма • синапс • глутаматергический синапс • закрепленный компонент мембраны пресинаптической активной зоны Биологический процесс • положительное регулирование установления полярности Т-клеток • регуляция сигнального пути toll-подобного рецептора 3 • регуляция гетеротипической межклеточной адгезии • стабилизация белка • отрицательная регуляция катаболического процесса белка-предшественника амилоида • отрицательная регуляция экспрессии генов • локализация белка в рафте плазматической мембраны • клеточная адгезия • мембранная сборка плота • регуляция дифференцировки миобластов • развитие эпидермиса • локализация белка на плазматической мембране • антероградный дендритный транспорт • регуляция уровней постсинаптических мембранных рецепторов нейромедиаторов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2319	14252
Ансамбль	ENSG00000132589	ENSMUSG00000061981
UniProt	Q14254	Q60634
RefSeq (мРНК)	NM_004475 NM_001330170	NM_001040403 NM_001284227 NM_001284228 NM_008028 NM_001362625 NM_001362626 NM_001362627
RefSeq (белок)	NP_001317099 NP_004466	NP_001035493 NP_001271156 NP_001271157 NP_032054 NP_001349554 NP_001349555 NP_001349556
Расположение (UCSC)	Chr 17: 28,88 - 28,9 Мб	Chr 11: 78.04 - 78.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Флотилин-2 это белок что у людей кодируется FLOT2 ген.^[5][6]Флотилин 2 (flot-2) представляет собой высококонсервативный белок, выделенный из доменов кавеол / липидных рафтов, которые связывают рецепторы фактора роста, связанные с путями передачи сигнала. Флот-2 связывается с ПАР-1, известный вышестоящий медиатор основных путей передачи сигналов, участвующих в росте клеток и метастаз, и может повлиять опухоль прогрессия.^[7]

Кавеолы ​​- это небольшие домены на внутренней клеточная мембрана участвует в везикулярном движении и передаче сигналов. Этот ген кодирует связанный с кавеолами интегральный мембранный белок, который, как полагают, функционирует в нейронная сигнализация.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132589 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061981 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шредер В. Т., Сицилиано М. Дж., Стюарт-Галетка С. Л., Дувич М. (февраль 1992 г.). «Человеческий ген антигена эпидермальной поверхности (M17S1) расположен в 17q11-12». Геномика. 11 (2): 481–2. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90166-С. PMID  1769667.
6. "Entrez Gene: FLOT2 флотилин 2".
7. Хазарика П., Маккарти М.Ф., Прието В.Г., Джордж С., Бабу Д., Коул Д., Бар-Эли М., Дувич М. (октябрь 2004 г.). «Повышающая регуляция флотилина-2 связана с прогрессированием меланомы и модулирует экспрессию рецептора тромбина, активируемого протеазой, рецептора 1». Рак Res. 64 (20): 7361–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-0823. PMID  15492257.

дальнейшее чтение

• Шредер В. Т., Стюарт-Галетка С., Мандавилли С. и др. (1994). «Клонирование и характеристика нового антигена поверхности эпидермальных клеток (ESA)». J. Biol. Chem. 269 (31): 19983–91. PMID  8051082.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Волонте Д., Гальбиати Ф., Ли С. и др. (1999). «Флотилины / кавателлины по-разному экспрессируются в клетках и тканях и образуют гетеро-олигомерный комплекс с кавеолинами in vivo. Характеристика и картирование эпитопов нового зонда моноклональных антител флотилина-1». J. Biol. Chem. 274 (18): 12702–9. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12702. PMID  10212252.
• Хазарика П., Дхам Н., Патель П. и др. (1999). «Флотилин 2 отличается от поверхностного эпидермального антигена (ESA) и связан с образованием филоподий». J. Cell. Биохим. 75 (1): 147–59. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991001) 75: 1 <147 :: AID-JCB15> 3.0.CO; 2-D. PMID  10462713.
• Зальцер У., Прохазка Р. (2001). «Стоматин, флотилин-1 и флотилин-2 являются основными интегральными белками липидных рафтов эритроцитов». Кровь. 97 (4): 1141–3. Дои:10.1182 / blood.V97.4.1141. PMID  11159550.
• Соломон С., Масиламани М., Раджендран Л. и др. (2002). «Связанный с микродоменом липидного рафта белок reggie-1 / флотилин-2 экспрессируется в В-клетках человека и локализуется на плазматической мембране и центросоме в PBMC».. Иммунобиология. 205 (1): 108–19. Дои:10.1078/0171-2985-00114. PMID  11999340.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессирующей последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М. и др. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–16. Дои:10.1074 / jbc.M210455200. PMID  12493773.
• Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е. и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Хазарика П., Маккарти М.Ф., Прието В.Г. и др. (2004). «Повышающая регуляция флотилина-2 связана с прогрессированием меланомы и модулирует экспрессию рецептора тромбина, активируемого протеазой, рецептора 1». Рак Res. 64 (20): 7361–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-0823. PMID  15492257.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Брачо С., Дуня И., Романо М. и др. (2006). «Кавеолины и флотилин-2 присутствуют в крови Plasmodium vivax». Паразитол. Res. 99 (2): 153–9. Дои:10.1007 / s00436-006-0139-6. PMID  16521037. S2CID  1099026.
• Доэрти С.Д., Прието В.Г., Джордж С. и др. (2007). «Высокая экспрессия флотилина-2 связана с метастазами в лимфатических узлах и глубиной Бреслоу в меланоме». Меланома Рес. 16 (5): 461–3. Дои:10.1097 / 01.cmr.0000222592.75858.20. PMID  17013097. S2CID  9758718.
• Цзян М., Дин И, Су И и др. (2007). «Взаимодействие аргиназы и флотилина переносит аргиназу на мембрану красных кровяных телец». FEBS Lett. 580 (28–29): 6561–4. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.11.003. PMID  17113085. S2CID  20180459.
• Sugawara Y, Nishii H, Takahashi T и др. (2007). «Белки липидного рафта flotillins / reggies взаимодействуют с Galphaq и участвуют в Gq-опосредованной активации митоген-активируемой протеинкиназы p38 через тирозинкиназу». Cell. Сигнал. 19 (6): 1301–8. Дои:10.1016 / j.cellsig.2007.01.012. PMID  17307333.
• Langhorst MF, Solis GP, Hannbeck S и др. (2007). «Связывание микродоменов мембраны с цитоскелетом: регуляция латеральной подвижности реджи-1 / флотилина-2 путем взаимодействия с актином». FEBS Lett. 581 (24): 4697–703. Дои:10.1016 / j.febslet.2007.08.074. PMID  17854803. S2CID  13258838.
• Раджендран Л., Бекманн Дж., Магенау А. и др. (2009). «Флотилины участвуют в поляризации примитивных и зрелых гемопоэтических клеток». PLOS ONE. 4 (12): e8290. Дои:10.1371 / journal.pone.0008290. ЧВК  2794375. PMID  20027317.
• Pust S, Dyve AB, Torgersen ML и др. (2010). «Взаимодействие между транспортом токсинов и локализацией флотилинов». PLOS ONE. 5 (1): e8844. Дои:10.1371 / journal.pone.0008844. ЧВК  2809741. PMID  20107503.
• Штюрмер CA (2010). «Связь reggie / flotillin с ростом». Тенденции Cell Biol. 20 (1): 6–13. Дои:10.1016 / j.tcb.2009.10.003. PMID  19896850.
• Солис Г.П., Малага-Трилло Э, Платтнер Х. и др. (2010). «Клеточные роли прионного белка в связи с микродоменами реджи / флотилина» (PDF). Фронт. Biosci. 15: 1075–85. Дои:10.2741/3662. PMID  20515742.
• Людвиг А., Отто Г. П., Риенто К. и др. (2010). «Микродомены флотилина взаимодействуют с кортикальным цитоскелетом, чтобы контролировать образование уроподов и рекрутирование нейтрофилов». J. Cell Biol. 191 (4): 771–84. Дои:10.1083 / jcb.201005140. ЧВК  2983060. PMID  21059848.
• Cornfine S, Himmel M, Kopp P и др. (2011). «Кинезин KIF9 и белки регги / флотилин регулируют деградацию матрикса подосомами макрофагов». Клетка Mol Biol. 22 (2): 202–15. Дои:10.1091 / mbc.E10-05-0394. ЧВК  3020916. PMID  21119006.
• Ge L, Qi W, Wang LJ, Miao HH и др. (2011). «Флотилины играют важную роль в поглощении холестерина, опосредованном C1-подобным 1 Ниманна-Пика». Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (2): 551–6. Дои:10.1073 / pnas.1014434108. ЧВК  3021008. PMID  21187433.
• Сонг Дж., Чен В., Лу З. и др. (2011). «Растворимая экспрессия, очистка и характеристика рекомбинантного человеческого флотилина-2 (reggie-1) в Escherichia coli». Мол Биол Реп. 38 (3): 2091–8. Дои:10.1007 / s11033-010-0335-4. PMID  20857209. S2CID  26736046.