FNTA - FNTA

Для французского профсоюза см. Национальная федерация сельскохозяйственных рабочих (Франция).

FNTA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JCQ, 1LD7, 1LD8, 1MZC, 1С63, 1SA4, 1TN6, 2F0Y, 2H6F, 2H6G, 2H6H, 2H6I, 2IEJ, 3Э37
Идентификаторы
Псевдонимы	FNTA, FPTA, PGGT1A, PTAR2, фарнезилтрансфераза, CAAX-бокс, альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 134635 MGI: 104683 ГомолоГен: 1534 Генные карты: FNTA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p11.21 Начните 43,034,194 бп[1] Конец 43,085,788 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A2 | 8 14,27 см Начните 25,998,722 бп[2] Конец 26,015,650 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • активность протеин пренилтрансферазы • активность протеина геранилгеранилтрансферазы • связывание микротрубочек • Активность рабгеранилгеранилтрансферазы • связывание рецепторной тирозинкиназы • связывание альфа-тубулина • активность протеина фарнезилтрансферазы • активность регулятора рецепторов ацетилхолина • GO: 0001948 связывание с белками • пренилтрансферазная активность • Активность CAAX-протеина геранилгеранилтрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • протеин-фарнезилтрансферазный комплекс • комплекс, связанный с микротрубочками • Комплекс CAAX-протеин геранилгеранилтрансфераза • клеточная мембрана Биологический процесс • положительная регуляция деацетилирования тубулина • пренилирование белков • геранилгеранилирование белков • развитие нервно-мышечного соединения • кластеризация ацетилхолин-управляемых каналов скелетных мышц • положительная регуляция активности деацетилазы • фарнезилирование белков • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • метаболический процесс рецептора нейротрансмиттера • регуляция активности рецепторов нейромедиаторов • регуляция сигнального пути, опосредованного родопсином Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2339	14272
Ансамбль	ENSG00000168522	ENSMUSG00000015994
UniProt	P49354	Q61239
RefSeq (мРНК)	NM_001018676 NM_001018677 NM_002027	NM_008033
RefSeq (белок)	NP_002018	NP_032059
Расположение (UCSC)	Chr 8: 43.03 - 43.09 Мб	Chr 8: 26 - 26,02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белковая фарнезилтрансфераза / геранилгеранилтрансфераза типа 1 субъединица альфа является фермент что у людей кодируется FNTA ген.^[5][6]

Пренилтрансферазы присоединяют либо фарнезильную группу, либо геранилгеранильную группу в тиоэфирной связи с цистеиновым остатком белка с C-концевым CAAX-боксом. Геранилгеранилтрансфераза CAAX и фарнезилтрансфераза CAAX являются гетеродимерами, которые имеют одну и ту же альфа-субъединицу, но разные бета-субъединицы. Этот ген кодирует альфа-субъединицу этих трансфераз. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

FNTA было показано взаимодействовать с участием Бета-рецептор TGF 1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168522 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015994 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Андрес Д.А., Милатович А., Озчелик Т., Венцлау Дж.М., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л., Франк У. (февраль 1994 г.). «Клонирование кДНК двух субъединиц фарнезилтрансферазы CAAX человека и хромосомное картирование локусов FNTA и FNTB и родственных последовательностей». Геномика. 18 (1): 105–12. Дои:10.1006 / geno.1993.1432. PMID  8276393.
6. «Энтрез Ген: FNTA фарнезилтрансфераза, CAAX box, альфа».
7. Кавабата, М; Имамура Т; Miyazono K; Engel M E; Моисей Х. Л. (декабрь 1995 г.). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста-бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой-альфа». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 270 (50): 29628–31. Дои:10.1074 / jbc.270.50.29628. ISSN  0021-9258. PMID  8530343.

дальнейшее чтение

• Адамсон П., Маршалл С.Дж., Холл А, Тилбрук, Пенсильвания (1992). «Посттрансляционные модификации белков p21rho». J. Biol. Chem. 267 (28): 20033–8. PMID  1400319.
• Манн В., Робертс Д., Тобин А. и др. (1990). «Идентификация и предварительная характеристика протеин-цистеин фарнезилтрансферазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (19): 7541–5. Bibcode:1990ПНАС ... 87.7541М. Дои:10.1073 / пнас.87.19.7541. ЧВК  54783. PMID  2217184.
• Армстронг С.А., Ханна В.К., Гольдштейн Дж.Л., Браун М.С. (1995). «Геранилгеранилтрансфераза CAAX передает фарнезил так же эффективно, как геранилгеранил, на RhoB». J. Biol. Chem. 270 (14): 7864–8. Дои:10.1074 / jbc.270.14.7864. PMID  7713879.
• Zhang FL, Diehl RE, Kohl NE и др. (1994). «Клонирование кДНК и экспрессия крысиного и человеческого белка геранилгеранилтрансферазы типа I». J. Biol. Chem. 269 (5): 3175–80. PMID  8106351.
• Sinensky M, Fantle K, Trujillo M и др. (1994). «Путь переработки преламина А.». J. Cell Sci. 107. (Pt 1): 61–7. PMID  8175923.
• Андрес Д.А., Гольдштейн Д.Л., Хо Ю.К., Браун М.С. (1993). «Мутационный анализ альфа-субъединицы протеина фарнезилтрансферазы. Доказательства каталитической роли». J. Biol. Chem. 268 (2): 1383–90. PMID  8419339.
• Омер К.А., Крал А.М., Диль Р.Э. и др. (1993). «Характеристика рекомбинантной человеческой фарнезил-протеинтрансферазы: клонирование, экспрессия, связывание фарнезилдифосфата и функциональная гомология с дрожжевыми пренил-протеинтрансферазами». Биохимия. 32 (19): 5167–76. Дои:10.1021 / bi00070a028. PMID  8494894.
• Кавабата М., Имамура Т., Миязоно К. и др. (1996). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста-бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой-альфа». J. Biol. Chem. 270 (50): 29628–31. Дои:10.1074 / jbc.270.50.29628. PMID  8530343.
• Ван Т., Дэниэлсон П.Д., Ли Б.И. и др. (1996). «Субъединица альфа фарнезилтрансферазы p21 (RAS) в TGF-бета и передаче сигналов активина». Наука. 271 (5252): 1120–2. Bibcode:1996Sci ... 271.1120W. Дои:10.1126 / science.271.5252.1120. PMID  8599089. S2CID  83164753.
• Nantais DE, Schwemmle M, Stickney JT и др. (1996). «Пренилирование интерферон-гамма-индуцированного GTP-связывающего белка: человеческого гуанилат-связывающего белка, huGBP1». J. Leukoc. Биол. 60 (3): 423–31. Дои:10.1002 / jlb.60.3.423. PMID  8830800. S2CID  33727864.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Goalstone ML, Дразнин Б (1996). «Влияние инсулина на активность фарнезилтрансферазы в адипоцитах 3T3-L1». J. Biol. Chem. 271 (44): 27585–9. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27585. PMID  8910345.
• Prakash B, Praefcke GJ, Renault L и др. (2000). «Структура человеческого гуанилат-связывающего белка 1, представляющего уникальный класс GTP-связывающих белков». Природа. 403 (6769): 567–71. Дои:10.1038/35000617. PMID  10676968. S2CID  4431592.
• Zeng Q, Si X, Horstmann H, et al. (2000). «Зависимая от пренилирования ассоциация протеин-тирозинфосфатаз PRL-1, -2 и -3 с плазматической мембраной и ранней эндосомой». J. Biol. Chem. 275 (28): 21444–52. Дои:10.1074 / jbc.M000453200. PMID  10747914.
• Ашар Х.Р., Джеймс Л., Грей К. и др. (2000). «Ингибиторы фарнезилтрансферазы блокируют фарнезилирование CENP-E и CENP-F и изменяют ассоциацию CENP-E с микротрубочками». J. Biol. Chem. 275 (39): 30451–7. Дои:10.1074 / jbc.M003469200. PMID  10852915.
• Guenzi E, Töpolt K, Cornali E, et al. (2001). «Спиральный домен GBP-1 опосредует ингибирование пролиферации эндотелиальных клеток воспалительными цитокинами». EMBO J. 20 (20): 5568–77. Дои:10.1093 / emboj / 20.20.5568. ЧВК  125279. PMID  11598000.
• Лонг С.Б., Хэнкок П.Дж., Крал А.М. и др. (2001). «Кристаллическая структура человеческого белка фарнезилтрансферазы раскрывает основу для ингибирования тетрапептидами CaaX и их миметиками». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (23): 12948–53. Bibcode:2001PNAS ... 9812948L. Дои:10.1073 / pnas.241407898. ЧВК  60805. PMID  11687658.
• Белл И.М., Галликкио С.Н., Абрамс М. и др. (2002). «Ингибиторы 3-аминопирролидинона фарнезилтрансферазы: разработка макроциклических соединений с улучшенной фармакокинетикой и превосходной клеточной активностью». J. Med. Chem. 45 (12): 2388–409. Дои:10.1021 / jm010531d. PMID  12036349.
• Лонг С.Б., Кейси П.Дж., Биз Л.С. (2002). «Путь реакции протеина фарнезилтрансферазы при атомном разрешении». Природа. 419 (6907): 645–50. Bibcode:2002Натурал.419..645л. Дои:10.1038 / nature00986. PMID  12374986. S2CID  4412580.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P49354 (Белковая фарнезилтрансфераза / геранилгеранилтрансфераза альфа типа 1) на PDBe-KB.