FUSIP1 - FUSIP1

SRSF10
Идентификаторы
Псевдонимы	SRSF10, FUSIP1, FUSIP2, NSSR, PPP1R149, SFRS13, SFRS13A, SRp38, SRrp40, TASR, TASR1, TASR2, фактор сплайсинга, богатый серином / аргинином 10, фактор сплайсинга, богатый серином и аргинином 10
Внешние идентификаторы	OMIM: 605221 MGI: 1333805 ГомолоГен: 134051 Генные карты: SRSF10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.11 Начните 23,964,347 бп[1] Конец 23,980,927 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начните 135,855,747 бп[2] Конец 135,869,908 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • развернутое связывание с белками • Привязка домена RS • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • ядерное пятнышко Биологический процесс • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • сплайсосомная сборка комплекса три-мяРНП • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • Выбор сайта сплайсинга мРНК • экспорт мРНК из ядра • Сплайсинг РНК • регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы • цитозольный транспорт • регуляция сплайсинга РНК • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • Распознавание сайта 5'-сплайсинга мРНК • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10772	14105
Ансамбль	ENSG00000188529	ENSMUSG00000028676
UniProt	O75494 Q5JRI1	Q9R0U0
RefSeq (мРНК)	NM_001191005 NM_001191006 NM_001191007 NM_001191009 NM_001300936 NM_001300937 NM_006625 NM_054016	NM_001080387 NM_001284195 NM_001284196 NM_010178
RefSeq (белок)	NP_001177934 NP_001177935 NP_001177936 NP_001177938 NP_001287865 NP_001287866 NP_006616 NP_473357 NP_001287865.1	NP_001073856 NP_001271124 NP_001271125 NP_034308
Расположение (UCSC)	Chr 1: 23.96 - 23.98 Мб	Chr 4: 135,86 - 135,87 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

FUS-взаимодействующий протеин 1, богатый серином и аргинином это белок что у людей кодируется SFRS13A ген.^[5][6][7]

Функция

Этот генный продукт входит в группу серин-аргинин (SR ) семейство белков, которое участвует в конститутивном и регулируемом сплайсинге РНК. Члены этого семейства характеризуются N-концевыми мотивами RNP1 и RNP2, которые необходимы для связывания с РНК, и множественными С-концевыми повторами SR / RS, которые важны для опосредования ассоциации с другими клеточными белками. Этот белок может влиять на выбор сайта сплайсинга пре-мРНК аденовируса E1A. Он взаимодействует с TLS онкобелка и устраняет влияние TLS на сплайсинг пре-мРНК E1A. Альтернативная сварка этого гена приводит как минимум к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы. Кроме того, существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сайты полиА.^[7]

Взаимодействия

FUSIP1 был показан взаимодействовать с участием FUS.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188529 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028676 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ян Л., Эмбри Л. Дж., Цай С., Хикштейн Д. Д. (ноябрь 1998 г.). «Онкопротеин TLS взаимодействует с серин-аргининовыми белками, участвующими в сплайсинге РНК». J. Biol. Chem. 273 (43): 27761–4. Дои:10.1074 / jbc.273.43.27761. PMID  9774382.
6. Клинтон Дж. М., Чански Х. А., Оделл Д. Д., Зелинска-Квятковска А., Хикштейн Д. Д., Ян Л. (март 2002 г.). «Характеристика и экспрессия человеческого гена, кодирующего два белка серин-аргинина, ассоциированных с транслокационной липосаркомой (TASR)». Ген. 284 (1–2): 141–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00382-7. PMID  11891055.
7. «Ген Entrez: FUSIP1 FUS взаимодействующий белок (богатый серином / аргинином) 1».
8. Ян Л., Эмбри Л.Дж., Хикштейн Д.Д. (май 2000 г.). «Слитый белок лейкемии TLS-ERG ингибирует сплайсинг РНК, опосредованный серин-аргининовыми белками». Мол. Cell. Биол. 20 (10): 3345–54. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. ЧВК  85627. PMID  10779324.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ян Л., Эмбри Л. Дж., Хикштейн Д. Д. (2000). «Слитый белок лейкемии TLS-ERG ингибирует сплайсинг РНК, опосредованный серин-аргининовыми белками». Мол. Cell. Биол. 20 (10): 3345–54. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3345-3354.2000. ЧВК  85627. PMID  10779324.
• Каупер А.Е., Касерес Дж.Ф., Майеда А., Скреатон Г.Р. (2001). «Серин-аргинин (SR) белковоподобные факторы, которые противодействуют аутентичным белкам SR и регулируют альтернативный сплайсинг». J. Biol. Chem. 276 (52): 48908–14. Дои:10.1074 / jbc.M103967200. PMID  11684676.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298.
• Шин С., Мэнли Дж. Л. (2002). «SR-белок SRp38 подавляет сплайсинг в клетках M фазы». Ячейка. 111 (3): 407–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 01038-3. PMID  12419250.
• Ли Дж., Хокинс И.С., Харви С.Д., Дженнингс Дж. Л., Линк А. Дж., Паттон Дж. Г. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Мол. Cell. Биол. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК  207616. PMID  14559993.
• Шин С., Фэн Й, Мэнли Дж. Л. (2004). «Дефосфорилированный SRp38 действует как репрессор сплайсинга в ответ на тепловой шок». Природа. 427 (6974): 553–8. Дои:10.1038 / природа02288. PMID  14765198.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс С. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Дж. Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Шин С., Клейман Ф. Е., Мэнли Дж. Л. (2005). «Множественные свойства репрессора сплайсинга SRp38 отличают его от типичных белков SR». Мол. Cell. Биол. 25 (18): 8334–43. Дои:10.1128 / MCB.25.18.8334-8343.2005. ЧВК  1234314. PMID  16135820.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.