ГАЗ6 - GAS6

ГАЗ6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1H30, 2C5D, 4RA0
Идентификаторы
Псевдонимы	ГАЗ6, AXLLG, AXSF, специфическая задержка роста 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 600441 MGI: 95660 ГомолоГен: 638 Генные карты: ГАЗ6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q34 Начинать 113,820,549 бп[1] Конец 113,864,076 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A1.1 | 8 6.06 см Начинать 13,465,374 бп[2] Конец 13,494,490 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • рецепторное связывание • связывание рецепторной тирозинкиназы • активность потенциалзависимых кальциевых каналов • рецепторная активность лиганда • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • связывание фосфатидилсерина • связывание ионов металлов • активность активатора протеинтирозинкиназы • связывание ионов кальция • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе • связывание с белками, мостик Сотовый компонент • просвет эндоплазматического ретикулума • цитоплазма • Просвет Гольджи • просвет альфа-гранул тромбоцитов • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • внутриклеточный • внеклеточный Биологический процесс • положительная регуляция естественной дифференцировки клеток-киллеров • клиренс апоптотических клеток • клеточный ответ на витамин К • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • положительная регуляция активности протеинкиназы • отрицательная регуляция развития биоминеральной ткани • отрицательная регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • клеточный ответ на голодание • положительная регуляция фагоцитоза • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • остановка клеточного цикла • положительная регуляция опосредованного цитокинами сигнального пути • положительная регуляция экспрессии генов • дифференцировка дендритных клеток • миграция нейронов • клеточная адгезия • передача сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция клубочковой фильтрации • Хемотаксис В-клеток • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • фагоцитоз • регулирование роста • активация активности протеинкиназы B • отрицательная регуляция продукции фактора некроза опухоли • дегрануляция тромбоцитов • вирусное проникновение • отрицательная регуляция процесса апоптоза олигодендроцитов • миграция лейкоцитов • сигнальный путь белка рецептора, связанного с ферментом • положительная регуляция активности протеинтирозинкиназы • миграция клеток • активация тромбоцитов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование экспорта белка из ядра • регенерация органов животных • клеточный ответ на стимул фактора роста • отрицательная регуляция продукции гамма-интерферона • производство цитокинов макрофагами • клеточный ответ на стимул глюкозы • миграция гемопоэтических стволовых клеток в костный мозг • отрицательная регуляция процесса апоптоза дендритных клеток • трансмембранный транспорт ионов кальция • адгезия клетки к субстрату • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6 • положительная регуляция хемотаксиса дендритных клеток • сигнальный пептидный процессинг • вирусная репликация • клеточная пролиферация • положительное регулирование пролиферации фибробластов • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • отрицательная регуляция процесса апоптоза фибробластов • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • клеточный ответ на лекарство • Скопление тромбоцитов • положительное регулирование передачи сигналов TOR • фосфорилирование пептидил-серина • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • GO: 0022415 вирусный процесс • сборка внеклеточного матрикса • клеточный ответ на интерферон-альфа • фосфорилирование белков • отрицательная регуляция абсорбции почечного альбумина • отрицательная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • преобразование сигнала • коагуляция крови • апоптотический процесс • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • локализация белка на плазматической мембране • регуляция рецепторной активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2621	14456
Ансамбль	ENSG00000183087	ENSMUSG00000031451
UniProt	Q14393	Q61592
RefSeq (мРНК)	NM_001143946 NM_000820 NM_001143945	NM_019521
RefSeq (белок)	NP_000811	NP_062394
Расположение (UCSC)	Chr 13: 113,82 - 113,86 Мб	Chr 8: 13.47 - 13.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Остановка роста - специфическая 6, также известный как ГАЗ6, это человек ген кодирует белок GAS6. Это похоже на Белок S с той же доменной организацией и 43% идентичностью аминокислот. Первоначально он был обнаружен как ген, активируемый фибробластами с задержкой роста.

Функция

Gas6 - это домен гамма-карбоксиглутаминовой кислоты (Gla) -содержащий белок, который, как считается, участвует в стимуляции пролиферации клеток.^[5]

Взаимодействия

Gas6 был показан взаимодействовать с Тирозинкиназа рецептора AXL, МерТК и TYRO3.^[6][7]

Присутствие Gla требует витамин К-зависимой ферментативной реакции, которая карбоксилирует гамма-углерод определенных глутаминовых остатков белка во время его производства в эндоплазматическом ретикулуме. Действие витамина К имеет важное значение для функции GAS6.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183087 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031451 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: GAS6, специфичный для остановки роста 6".
6. Марк М.Р., Чен Дж., Хаммондс Р.Г., Садик М., Годовск П.Дж. (апрель 1996 г.). «Характеристика Gas6, члена суперсемейства белков, содержащих домен G, в качестве лиганда для Rse и Axl». J. Biol. Chem. 271 (16): 9785–9. Дои:10.1074 / jbc.271.16.9785. PMID  8621659.
7. Нагата К., Охаши К., Накано Т., Арита Х., Зонг К., Ханафуса Х., Мизуно К. (ноябрь 1996 г.). «Идентификация продукта гена 6, специфичного для остановки роста, в качестве общего лиганда для тирозинкиназ рецепторов Axl, Sky и Mer». J. Biol. Chem. 271 (47): 30022–7. Дои:10.1074 / jbc.271.47.30022. PMID  8939948.
8. Беллидо-Мартин, L; де Фрутос, PG (2008). «Витамин К-зависимые действия Gas6». Витамины и гормоны. 78: 185–209. Дои:10.1016 / S0083-6729 (07) 00009-X. HDL:10261/37140. PMID  18374195.

дальнейшее чтение

• Мари А.О., Джнейд Х., Паласиос И.Ф., Розенфилд К., Макрей Калифорния, Фицджеральд Д.Д. (2007). «Специфический ген остановки роста (GAS) 6 модулирует образование тромбоцитов и гомеостаз сосудистой стенки и представляет собой привлекательную лекарственную мишень». Curr. Pharm. Des. 13 (26): 2656–61. Дои:10.2174/138161207781662948. PMID  17897008.
• Варнум BC, Янг С., Эллиотт Дж., Гарсия А., Бартли Т.Д., Фриделл Ю.В., Хант Р.В., Трейл Дж., Клогстон К., Тосо Р.Дж. (1995). «Тирозинкиназа рецептора Axl, стимулированная витамином К-зависимым белком, кодируемым геном 6, специфичным для остановки роста». Природа. 373 (6515): 623–6. Дои:10.1038 / 373623a0. PMID  7854420.
• Ститт Т.Н., Конн Дж., Гор М., Лай К., Бруно Дж., Радзеевски К., Маттссон К., Фишер Дж., Гис Д. Р., Джонс П. Ф. (1995). «Белок фактора антикоагуляции S и его родственник, Gas6, являются лигандами для семейства рецепторных тирозинкиназ Tyro 3 / Axl». Клетка. 80 (4): 661–70. Дои:10.1016/0092-8674(95)90520-0. PMID  7867073.
• Манфиолетти Дж., Бранколини С., Аванци Дж., Шнайдер С. (1993). «Белок, кодируемый геном, специфичным для остановки роста (gas6), является новым членом витамин К-зависимых белков, связанных с белком S, отрицательным корегулятором в каскаде свертывания крови». Мол. Клетка. Биол. 13 (8): 4976–85. Дои:10.1128 / MCB.13.8.4976. ЧВК  360142. PMID  8336730.
• Saccone S, Marcandalli P, Gostissa M, Schneider C, Della Valle G (1996). «Присвоение гена GAS6 человека хромосоме 13q34 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 30 (1): 129–31. Дои:10.1006 / geno.1995.0027. PMID  8595896.
• Ли Р., Чен Дж., Хэммондс Дж., Филлипс Х., Арманини М., Вуд П., Бандж Р., Годовски П. Дж., Сливковски М. С., Мазер Дж. П. (1996). «Идентификация Gas6 как фактора роста шванновских клеток человека». J. Neurosci. 16 (6): 2012–9. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.16-06-02012.1996. ЧВК  6578513. PMID  8604045.
• Марк М.Р., Чен Дж., Хаммондс Р.Г., Садик М., Годовск П.Дж. (1996). «Характеристика Gas6, члена суперсемейства белков, содержащих домен G, в качестве лиганда для Rse и Axl». J. Biol. Chem. 271 (16): 9785–9. Дои:10.1074 / jbc.271.16.9785. PMID  8621659.
• Горуппи С., Руаро Э., Шнайдер С. (1996). «Gas6, лиганд рецептора тирозинкиназы Axl, обладает митогенной активностью и активностью выживания для истощенных сывороткой фибробластов NIH3T3». Онкоген. 12 (3): 471–80. PMID  8637702.
• Нагата К., Охаши К., Накано Т., Арита Х., Зонг К., Ханафуса Х., Мизуно К. (1997). «Идентификация продукта гена 6, специфичного для остановки роста, в качестве общего лиганда для тирозинкиназ рецепторов Axl, Sky и Mer». J. Biol. Chem. 271 (47): 30022–7. Дои:10.1074 / jbc.271.47.30022. PMID  8939948.
• Loeser RF, Varnum BC, Carlson CS, Goldring MB, Liu ET, Sadiev S, Kute TE, Wallin R (1997). «Экспрессия в хондроцитах человека специфичного для остановки роста гена 6 и рецептора тирозинкиназы axl: потенциальная роль в аутокринной передаче сигналов в хряще». Ревматоидный артрит. 40 (8): 1455–65. Дои:10.1002 / арт.1780400814. PMID  9259426.
• Маркандалли П., Гостисса М., Варнум Б., Горуппи С., Шнайдер С. (1997). «Идентификация и тканевая экспрессия варианта сплайсинга для генного газа, специфичного для остановки роста6». FEBS Lett. 415 (1): 56–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01094-6. PMID  9326368.
• Goruppi S, Yamane H, Marcandalli P, Garcia A, Clogston C, Gostissa M, Varnum B, Schneider C (1997). «Продукт варианта сплайсинга gas6 позволяет высвобождать домен, ответственный за активацию рецептора тирозинкиназы Axl». FEBS Lett. 415 (1): 59–63. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01093-4. PMID  9326369.
• Накано Т., Ишимото Ю., Кишино Дж., Умеда М., Иноуэ К., Нагата К., Охаши К., Мизуно К., Арита Х. (1997). «Клеточная адгезия к фосфатидилсерину, опосредованная продуктом гена 6, специфичного для остановки роста». J. Biol. Chem. 272 (47): 29411–4. Дои:10.1074 / jbc.272.47.29411. PMID  9367994.
• Прието А.Л., Вебер Дж. Л., Лай С. (2000). «Экспрессия рецепторных протеин-тирозинкиназ Tyro-3, Axl и mer в развивающейся центральной нервной системе крыс». J. Comp. Neurol. 425 (2): 295–314. Дои:10.1002 / 1096-9861 (20000918) 425: 2 <295 :: AID-CNE11> 3.0.CO; 2-G. PMID  10954847.
• Анжелилло-Шеррер А., де Фрутос П., Апарисио С., Мелис Е., Сави П., Лупу Ф., Арноут Дж., Деверчин М., Хойлаертс М., Герберт Дж., Коллен Д., Дальбек Б., Кармелиет П. (2001). «Дефицит или ингибирование Gas6 вызывает дисфункцию тромбоцитов и защищает мышей от тромбоза». Nat. Med. 7 (2): 215–21. Дои:10.1038/84667. PMID  11175853.
• Сан В.С., Мисао Р., Ивагаки С., Фудзимото Дж., Тамая Т. (2003). «Совместная экспрессия гена 6, специфичного для остановки роста, и рецепторных тирозинкиназ, Axl и Sky, в эндометрии матки человека и эндометриозе яичников». Мол. Гм. Репрод. 8 (6): 552–8. Дои:10,1093 / моль · ч / 8,6,552. PMID  12029073.
• Сасаки Т., Князев П.Г., Чебуркин Ю., Геринг В., Тиси Д., Ульрих А., Тимпл Р., Хоэнестер Е. (2003). «Кристаллическая структура C-концевого фрагмента белка, специфичного для остановки роста Gas6. Активация рецепторной тирозинкиназы с помощью ламинин G-подобных доменов». J. Biol. Chem. 277 (46): 44164–70. Дои:10.1074 / jbc.M207340200. PMID  12218057.
• Ито М., Накашима М., Накаяма Т., Охцуру А., Нагаяма И., Такамура Н., Демедчик Е.П., Секин И., Ямасита С. (2003). «Экспрессия тирозинкиназы рецепторного типа Axl и ее лиганда Gas6 в детских карциномах щитовидной железы вокруг Чернобыля». Щитовидная железа. 12 (11): 971–5. Дои:10.1089/105072502320908303. PMID  12490074.
• Шанкар С.Л., О'Гуин К., Каммер М., Макморрис Ф.А., Ститт Т.Н., Баш Р.С., Варнум Б., Шафит-Загардо Б. (2003). «Продукт гена, специфичного для остановки роста, Gas6, способствует выживанию олигодендроцитов человека через фосфатидилинозитол-3-киназозависимый путь». J. Neurosci. 23 (10): 4208–18. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-10-04208.2003. ЧВК  6741089. PMID  12764109.