GCC2 - GCC2

GCC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3BBP
Идентификаторы
Псевдонимы	GCC2, GCC185, RANBP2L4, REN53, GRIP и домен coiled-coil, содержащий 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 612711 MGI: 1917547 ГомолоГен: 45639 Генные карты: GCC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q12.3 Начинать 108,449,191 бп[1] Конец 108,509,415 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • сеть транс-Гольджи • аппарат Гольджи • мембрана • цитозоль • нуклеоплазма Биологический процесс • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны • транспорт белка • закрепление микротрубочек • белок, нацеленный на лизосомы • ретроградный транспорт, эндосома к Гольджи • поздняя эндосома до транспорта Гольджи • регуляция выхода белка из эндоплазматического ретикулума • Организация центра организации микротрубочек • переработка эндосомы в транспорт Гольджи • Формирование ленты Гольджи • локализация белка в аппарате Гольджи • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9648	70297
Ансамбль	ENSG00000135968	ENSMUSG00000038039
UniProt	Q8IWJ2	Q8CHG3
RefSeq (мРНК)	NM_181453	NM_027375
RefSeq (белок)	NP_852118	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 2: 108,45 - 108,51 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

GRIP и белок 2, содержащий домен спиральной спирали это белок что у людей кодируется GCC2 ген.^[4][5]

Белок, кодируемый этим геном, является периферическим мембранный белок локализован на сеть транс-Гольджи. Он чувствителен к брефельдин А. Этот кодируемый белок содержит GRIP домен который предполагается использовать для таргетинга. Два попеременно соединенных варианты расшифровки кодирование разных изоформы были описаны для этого гена.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135968 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Люк М.Р., Кьер-Нильсен Л., Браун Д.Л., Стоу Д.Л., Глисон, Пенсильвания (февраль 2003 г.). «Опосредованное GRIP-доменом нацеливание двух новых белков спиральной спирали, GCC88 и GCC185, в субкомпартменты транс-сети Гольджи». J Biol Chem. 278 (6): 4216–26. Дои:10.1074 / jbc.M210387200. PMID  12446665.
5. «Ген Энтреза: GCC2 GRIP и домен спиральной спирали, содержащий 2».

дальнейшее чтение

• Derby MC, Lieu ZZ, Brown D и др. (2007). «Транс-сеть Гольджи golgin, GCC185, необходима для транспорта от эндосомы к Гольджи и поддержания структуры Гольджи». Трафик. 8 (6): 758–73. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2007.00563.x. PMID  17488291. S2CID  21624858.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Редди СП, Бургете А.С., Шридеви К. и др. (2007). «Функциональная роль GCC185 Golgin в рециклинге маннозо-6-фосфатных рецепторов». Мол. Биол. Клетка. 17 (10): 4353–63. Дои:10.1091 / mbc.E06-02-0153. ЧВК  1635343. PMID  16885419.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Люк MR, Houghton F, Perugini MA, Gleeson PA (2005). «Белки GRIP-домена транс-сети Гольджи образуют α-спиральные гомодимеры». Biochem. J. 388 (Pt 3): 835–41. Дои:10.1042 / BJ20041810. ЧВК  1183463. PMID  15654769.
• Дерби М.С., ван Влит С., Браун Д. и др. (2005). «Белки домена GRIP млекопитающих различаются по своим свойствам связывания с мембраной и задействованы в разных доменах TGN». J. Cell Sci. 117 (Pt 24): 5865–74. Дои:10.1242 / jcs.01497. PMID  15522892.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Лу Л., Хонг В. (2004). «Взаимодействие Arl1-GTP с доменами GRIP привлекает аутоантигены Golgin-97 и Golgin-245 / p230 на Гольджи». Мол. Биол. Клетка. 14 (9): 3767–81. Дои:10.1091 / mbc.E03-01-0864. ЧВК  196566. PMID  12972563.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Krackhardt AM, Witzens M, Harig S и др. (2002). «Идентификация опухолевых антигенов при хроническом лимфолейкозе с помощью SEREX». Кровь. 100 (6): 2123–31. Дои:10.1182 / кровь-2002-02-0513. PMID  12200376.
• Эйхмюллер С., Усенер Д., Даммер Р. и др. (2001). «Серологическое обнаружение антигенов, связанных с кожной Т-клеточной лимфомой». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (2): 629–34. Дои:10.1073 / pnas.021386498. ЧВК  14639. PMID  11149944.
• Сканлан М.Дж., Гордан Д.Д., Уильямсон Б. и др. (1999). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Int. J. Рак. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.