ГЗМК - GZMK

ГЗМК
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1МЗА, 1MZD
Идентификаторы
Псевдонимы	ГЗМК, TRYP2, гранзим К
Внешние идентификаторы	OMIM: 600784 MGI: 1298232 ГомолоГен: 20485 Генные карты: ГЗМК
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q11.2 Начинать 55,024,256 бп[1] Конец 55,034,570 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 D2.2 Начинать 113,171,608 бп[2] Конец 113,225,908 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • активность пептидазы серинового типа • гидролазная активность • активность эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • внеклеточная область Биологический процесс • протеолиз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3003	14945
Ансамбль	ENSG00000113088	ENSMUSG00000042385
UniProt	P49863	O35205
RefSeq (мРНК)	NM_002104	NM_008196
RefSeq (белок)	NP_002095	NP_032222
Расположение (UCSC)	Chr 5: 55.02 - 55.03 Мб	Chr 13: 113.17 - 113.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гранзим К это белок что у людей кодируется ГЗМК ген.^[5][6]

Этот генный продукт является членом группы родственных сериновых протеаз из цитоплазматических гранул цитотоксических лимфоцитов. Цитолитические Т-лимфоциты (CTL) и естественные киллеры (NK) обладают замечательной способностью распознавать, связывать и лизировать определенные клетки-мишени. Считается, что они защищают своего хозяина, лизируя клетки, несущие на своей поверхности «чужие» антигены, обычно пептиды или белки, возникающие в результате инфекции внутриклеточными патогенами. Описанный здесь белок не имеет консенсусных последовательностей для N-гликозилирования, присутствующих в других гранзимах.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113088 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042385 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Прзетак М.М., Йоаст С., Шмидт Б.Ф. (июнь 1995 г.). «Клонирование кДНК гранзима 3 человека». FEBS Lett. 364 (3): 268–71. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00407-Z. PMID  7758581. S2CID  29315976.
6. «Ген Entrez: GZMK granzyme K (гранзим 3; триптаза II)».

дальнейшее чтение

• Смит MJ, О'Коннор MD, Трапани JA (1996). «Гранзимы: различные специфичности сериновых протеаз, кодируемые генетически различными подсемействами». J. Leukoc. Биол. 60 (5): 555–62. Дои:10.1002 / jlb.60.5.555. PMID  8929545. S2CID  19732623.
• Ши Л., Кам С.М., Пауэрс Дж. К. и др. (1993). «Очистка трех сериновых протеаз цитотоксических гранул лимфоцитов, которые вызывают апоптоз посредством различных взаимодействий с субстратом и клеткой-мишенью». J. Exp. Med. 176 (6): 1521–9. Дои:10.1084 / jem.176.6.1521. ЧВК  2119451. PMID  1460416.
• Hameed A, Lowrey DM, Lichtenheld M, Podack ER (1988). «Характеристика трех сериновых эстераз, выделенных из клеток-киллеров, активированных IL-2 человека». J. Immunol. 141 (9): 3142–7. PMID  3262682.
• Бейкер Э., Сэйерс Т.Дж., Сазерленд Г.Р., Смит М.Дж. (1994). «Гены, кодирующие сериновые протеазы гранул NK, человеческую триптазу-2 (TRYP2) и человеческий гранзим A (HFSP), оба картируются на хромосоме 5q11-q12 и определяют новый локус для цитотоксических триптаз гранул лимфоцитов». Иммуногенетика. 40 (3): 235–7. Дои:10.1007 / BF00167085. PMID  8039831. S2CID  37615055.
• Сейерс Т.Дж., Ллойд А.Р., Маквикар Д.В. и др. (1996). «Клонирование и экспрессия второй триптазы гранул человеческих естественных клеток-киллеров, HNK-Tryp-2 / granzyme 3». J. Leukoc. Биол. 59 (5): 763–8. Дои:10.1002 / jlb.59.5.763. PMID  8656064. S2CID  18065724.
• Hink-Schauer C, Estébanez-Perpiñá E, Wilharm E, et al. (2003). «Кристаллическая структура 2.2-A человеческого програнзима К обнаруживает твердый зимоген с необычными характеристиками». J. Biol. Chem. 277 (52): 50923–33. Дои:10.1074 / jbc.M207962200. PMID  12384499.
• Фахардо I, Пейлер G (2003). «Образование активных мономеров из тетрамерной бета-триптазы человека». Biochem. J. 369 (Pt 3): 603–10. Дои:10.1042 / BJ20021418. ЧВК  1223112. PMID  12387726.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чжао Т., Чжан Х., Го И и др. (2007). «Гранзим К расщепляет белок сборки нуклеосом SET, чтобы вызвать разрывы одноцепочечной ДНК в клетках-мишенях». Разница в гибели клеток. 14 (3): 489–99. Дои:10.1038 / sj.cdd.4402040. PMID  17008916. S2CID  6044972.
• Чжао Т., Чжан Х, Го И, Фан З (2007). «Гранзим К непосредственно обрабатывает предложение для высвобождения цитохрома с и эндонуклеазы G, что приводит к гибели клеток, зависимой от митохондрий». J. Biol. Chem. 282 (16): 12104–11. Дои:10.1074 / jbc.M611006200. PMID  17308307.
• Rucevic M, Fast LD, Jay GD и др. (2007). «Измененные уровни и молекулярные формы granzyme k в плазме от пациентов с сепсисом». Шок. 27 (5): 488–93. Дои:10.1097 / 01.shk.0000246905.24895.e5. PMID  17438453. S2CID  525904.