H2AFJ - H2AFJ

H2AJ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4EDU
Идентификаторы
Псевдонимы	H2AJ, Член семейства гистонов H2A J, H2AFJ, гистон H2A.J
Внешние идентификаторы	MGI: 3606192 ГомолоГен: 128575 Генные карты: H2AJ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12п12.3 Начинать 14,774,383 бп[1] Конец 14,778,002 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 G1 Начинать 136,808,244 бп[2] Конец 136,810,074 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • молекулярная функция Сотовый компонент • ядерный хроматин • внеклеточная экзосома • хромосома • нуклеосома • ядро клетки Биологический процесс • подавление хроматина • организация хроматина • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55766	232440
Ансамбль	ENSG00000246705	ENSMUSG00000060032
UniProt	Q9BTM1	Q8R1M2
RefSeq (мРНК)	NM_018267 NM_177925	NM_177688
RefSeq (белок)	NP_808760	NP_808356
Расположение (UCSC)	Chr 12: 14.77 - 14.78 Мб	Chr 6: 136,81 - 136,81 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2A.J это белок что у людей кодируется H2AFJ ген.^[5]

Гистоны - это основные ядерные белки, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Нуклеосомы состоят из приблизительно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Волокно хроматина дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген расположен на хромосоме 12 и кодирует вариант гистона H2A. Белок отличается на С-конце по сравнению с консенсусным членом семейства гистонов Н2А.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000246705 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060032 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Энтрез Ген: H2AFJ H2A гистоновое семейство, член J".

дальнейшее чтение

• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Чедвик Б.П., Уиллард Х.Ф. (2001). «Варианты гистона H2A и неактивная Х-хромосома: идентификация второго варианта macroH2A». Гм. Мол. Genet. 10 (10): 1101–13. Дои:10.1093 / hmg / 10.10.1101. PMID  11331621.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.