H2AFY2 - H2AFY2

MACROH2A2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2XD7
Идентификаторы
Псевдонимы	MACROH2A2, macroH2A2, член семейства гистонов H2A Y2, H2AFY2, гистон macroH2A.2
Внешние идентификаторы	OMIM: 616141 MGI: 3037658 ГомолоГен: 10246 Генные карты: MACROH2A2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начинать 70,052,846 бп[1] Конец 70,112,282 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начинать 61,738,665 бп[2] Конец 61,784,147 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • активность гетеродимеризации белков • связывание хроматина с ДНК Сотовый компонент • ESC / E (Z) комплекс • нуклеоплазма • хромосома • ядерный хроматин • нуклеосома • хроматин • внеклеточная экзосома • Тело Барра • ядерная хромосома, теломерная область • ядро клетки Биологический процесс • сборка нуклеосом • подавление хроматина • отрицательная регуляция транскрипции ядерного транскрипта большой рРНК с промотора РНК-полимеразы I. • положительная регуляция дифференцировки кератиноцитов • компенсация дозировки • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • установление локализации белка в хроматине • развитие мозга • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • регулирование роста клеток • ковалентная модификация хроматина • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55506	404634
Ансамбль	ENSG00000099284	ENSMUSG00000020086
UniProt	Q9P0M6	Q8CCK0
RefSeq (мРНК)	NM_018649	NM_207000
RefSeq (белок)	NP_061119	NP_996883
Расположение (UCSC)	Chr 10: 70.05 - 70.11 Мб	Chr 10: 61,74 - 61,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Корневой гистоновый макро-H2A.2 это белок что у людей кодируется H2AFY2 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000099284 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020086 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чедвик Б.П., Уиллард Х.Ф. (май 2001 г.). «Варианты гистона H2A и неактивная Х-хромосома: идентификация второго варианта macroH2A». Хум Мол Генет. 10 (10): 1101–13. Дои:10.1093 / hmg / 10.10.1101. PMID  11331621.
6. Костанци К., Пирсон-младший (июнь 2001 г.). «MACROH2A2, новый член семейства коровых гистонов MARCOH2A». J Biol Chem. 276 (24): 21776–84. Дои:10.1074 / jbc.M010919200. PMID  11262398.
7. "Энтрез Ген: H2AFY2 Семейство гистонов H2A, член Y2".

дальнейшее чтение

• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чжан Р., Пустовойтов М.В., Е X и др. (2005). «Формирование MacroH2A-содержащих гетерохроматиновых фокусов, связанных со старением, и старение, вызванное ASF1a и HIRA». Dev. Клетка. 8 (1): 19–30. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.10.019. PMID  15621527.