HIP1R - HIP1R

HIP1R
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1R0D
Идентификаторы
Псевдонимы	HIP1R, HIP12, HIP3, ILWEQ, взаимодействующий с гентингтином белок 1, родственный
Внешние идентификаторы	OMIM: 605613 MGI: 1352504 ГомолоГен: 78348 Генные карты: HIP1R
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.31 Начинать 122,834,453 бп[1] Конец 122,862,961 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начинать 123,973,628 бп[2] Конец 124,005,558 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • связывание фосфатидилинозита • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • Привязка домена SH3 • клатриновое связывание • связывание легкой цепи клатрина • активность адаптера клатрина • активность гомодимеризации белков • связывание фосфатидилинозитол-3,4-бисфосфата • активность гетеродимеризации белков • связывание актиновой нити • связывание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • яма, покрытая клатрином • цитоскелет • мембрана везикул, покрытая клатрином • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • эндомембранная система • мембрана • цитоплазматический пузырек • везикула, покрытая клатрином • цитоплазма • митохондрия • цитозоль • клеточная кора • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • апикальная плазматическая мембрана • мембрана с оборками • дендритная цитоплазма • тело нейрональной клетки • дендритный позвоночник • синаптическая мембрана • Адаптерный комплекс АП-2 • актиновый кортикальный пластырь Биологический процесс • эндоцитоз • рецептор-опосредованного эндоцитоза • апоптотический процесс • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • регуляция эндоцитоза • отрицательная регуляция полимеризации актиновых филаментов • положительное регулирование связывания белков • регуляция организации актинового цитоскелета • отрицательная регуляция опосредованного комплексом Arp2 / 3 нуклеации актина • положительная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • сборка клатринового пальто • стабилизация белка • развитие пищеварительной системы • регулирование секреции желудочного сока • мембранная организация • положительная регуляция проницаемости митохондриальной внешней мембраны, участвующая в сигнальном пути апоптоза • положительное регулирование сборки клатринового покрытия • положительная регуляция сигнального пути рецептора бета-фактора роста тромбоцитов • регуляция клатрин-зависимого эндоцитоза • организация актиновых филаментов • положительная регуляция рецепторно-опосредованного эндоцитоза Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9026	29816
Ансамбль	ENSG00000130787	ENSMUSG00000000915
UniProt	O75146	Q9JKY5
RefSeq (мРНК)	NM_001303097 NM_001303099 NM_003959	NM_145070
RefSeq (белок)	NP_001290026 NP_001290028 NP_003950	NP_659507
Расположение (UCSC)	Chr 12: 122,83 - 122,86 Мб	Chr 5: 123.97 - 124.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гентингтин-взаимодействующий белок 1-родственный белок это белок что у людей кодируется HIP1R ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130787 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000000915 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Brett TJ, Legendre-Guillemin V, McPherson PS, Fremont DH (февраль 2006 г.). «Структурное определение F-актин-связывающего THATCH-домена из HIP1R». Нат Структ Мол Биол. 13 (2): 121–30. Дои:10.1038 / nsmb1043. PMID  16415883. S2CID  1456946.
6. «Ген Entrez: HIP1R, взаимодействующий с гентингтином, белок 1, родственный».

дальнейшее чтение

• Паркер Дж. А., Мецлер М., Георгиу Дж. И др. (2007). «Белок 1, взаимодействующий с Хантингтином, влияет на пресинаптическую функцию червей и мышей и защищает нейроны Caenorhabditis elegans от токсичности мутантного полиглутамина». J. Neurosci. 27 (41): 11056–64. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.1941-07.2007. ЧВК  6672856. PMID  17928447.
• Брэдли С.В., Хюн Т.С., Оравец-Уилсон К.И. и др. (2007). «Дегенеративные фенотипы, вызванные комбинированным дефицитом мышиного HIP1 и HIP1r, спасаются человеческим HIP1». Гм. Мол. Genet. 16 (11): 1279–92. Дои:10.1093 / hmg / ddm076. PMID  17452370.
• Провансальский Н., Шинк Э., Харви М. и др. (2005). «Анализ полиморфизма тандемных повторов с переменным числом тандемных повторов в гене, взаимодействующем с гентингтином, связанном с белком-1, для прогнозирования биполярного аффективного расстройства». Прог. Neuropsychopharmacol. Биол. Психиатрия. 28 (8): 1299–303. Дои:10.1016 / j.pnpbp.2004.07.001. PMID  15588756. S2CID  23161289.
• Сенетар М.А., Фостер С.Дж., Макканн РО (2005). «Внутритериальное ингибирование опосредует взаимодействие белков модуля I / LWEQ Talin1, Talin2, Hip1 и Hip12 с актином». Биохимия. 43 (49): 15418–28. Дои:10.1021 / bi0487239. PMID  15581353.
• Наварро-Лерида I, Мартинес Морено М., Ронкал Ф. и др. (2004). «Протеомная идентификация белков мозга, которые взаимодействуют с легкой цепью динеина LC8». Протеомика. 4 (2): 339–46. Дои:10.1002 / pmic.200300528. PMID  14760703. S2CID  8868600.
• Энгквист-Гольдштейн А.Е., Чжан С.Х., Каррено С. и др. (2004). «РНКи-опосредованное подавление Hip1R приводит к стабильной ассоциации между эндоцитарным аппаратом и аппаратом сборки актина». Мол. Биол. Клетка. 15 (4): 1666–79. Дои:10.1091 / mbc.E03-09-0639. ЧВК  379265. PMID  14742709.
• Хюн Т.С., Рао Д.С., Сен-Дик Д. и др. (2004). «HIP1 и HIP1r стабилизируют рецепторные тирозинкиназы и связывают 3-фосфоинозитиды через домены гомологии N-конца эпсина». J. Biol. Chem. 279 (14): 14294–306. Дои:10.1074 / jbc.M312645200. PMID  14732715.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Legendre-Guillemin V, Metzler M, Charbonneau M, et al. (2002). «HIP1 и HIP12 демонстрируют дифференциальное связывание с F-актином, AP2 и клатрином. Идентификация нового взаимодействия с легкой цепью клатрина». J. Biol. Chem. 277 (22): 19897–904. Дои:10.1074 / jbc.M112310200. PMID  11889126.
• Чопра В.С., Мецлер М., Распер Д.М. и др. (2001). «HIP12 является непроапоптотическим членом семейства генов, включая HIP1, белок, взаимодействующий с хантингтином». Мамм. Геном. 11 (11): 1006–15. Дои:10.1007 / s003350010195. PMID  11063258. S2CID  19956774.
• Секи Н., Мурамацу М., Сугано С. и др. (1999). «Клонирование, анализ экспрессии и хромосомная локализация HIP1R, изолога белка, взаимодействующего с хантингтином (HIP1)». J. Hum. Genet. 43 (4): 268–71. Дои:10.1007 / с100380050087. PMID  9852681.
• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Пуигверт А. (1976). «Калицевая уродинамика». Урол. Int. 30 (4): 282–96. Дои:10.1159/000279990. PMID  1189126.