HIST1H2BA - HIST1H2BA

H2BC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3WKJ
Идентификаторы
Псевдонимы	H2BC1, H2BFU, STBP, TSH2B, TSH2B.1, bA317E16.3, TH2B, гистоновый кластер 1, H2ba, гистоновый кластер 1, член семейства H2B a, hTSH2B, HIST1H2BA, гистоновый кластер H2B 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609904 MGI: 2448375 ГомолоГен: 69356 Генные карты: H2BC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.2 Начните 25,726,777 бп[1] Конец 25,727,292 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • связывание гистонов • молекулярная функция Сотовый компонент • нуклеосома • внешний компонент плазматической мембраны • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • хромосома • нуклеоплазма • ядерная нуклеосома • Комплекс упаковки ДНК Биологический процесс • миграция мононуклеарных клеток • сборка нуклеосом • положительное регулирование связывания • разборка нуклеосом • активация плазминогена • воспалительная реакция • сперматогенез, обмен хромосомных белков • организация хроматина • убиквитинирование белков • Упаковка ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	255626	319177
Ансамбль	ENSG00000146047	н / д
UniProt	Q96A08	P70696
RefSeq (мРНК)	NM_170610	NM_175663
RefSeq (белок)	NP_733759	NP_783594
Расположение (UCSC)	Chr 6: 25,73 - 25,73 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2B типа 1-A это белок что у людей кодируется HIST1H2BA ген.^[4][5][6]

Гистоны - это основные ядерные белки, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Нуклеосомы состоят из приблизительно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг октамера гистонов, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Волокно хроматина дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген не имеет интрона и кодирует специфичный для семенников / сперматозоидов член семейства гистонов H2B. Транскрипты этого гена содержат палиндромный терминатор.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000146047 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
5. Заленский А.О., Сийно Ю.С., Гинеитис А.А., Заленская И.А., Томилин Н.В., Яу П., Брэдбери Е.М. (ноябрь 2002 г.). "Человеческий семенник / сперматозоид гистона H2B (hTSH2B). Молекулярное клонирование и характеристика". J Biol Chem. 277 (45): 43474–80. Дои:10.1074 / jbc.M206065200. PMID  12213818.
6. «Ген Entrez: гистоновый кластер 1 HIST1H2BA, H2ba».

дальнейшее чтение

• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ли А., Маффи А.Х., Эбботт В.Д. и др. (2005). «Характеристика нуклеосом, состоящих из человеческого семенников / сперматозоидов варианта гистона H2B (hTSH2B)». Биохимия. 44 (7): 2529–35. Дои:10.1021 / bi048061n. PMID  15709765.
• Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). «Ингибирование ацетилирования ядер гистонов канцерогенным никелем (II)». Мол. Cell. Биохим. 279 (1–2): 133–9. Дои:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID  16283522. S2CID  25071586.
• Zhu B, Zheng Y, Pham AD, et al. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B человека: вовлеченные факторы и их роль в регуляции гена HOX». Мол. Клетка. 20 (4): 601–11. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID  16307923.
• Паври Р., Чжу Б., Ли Г. и др. (2006). «Моноубиквитинирование гистона H2B действует совместно с FACT, регулируя удлинение с помощью РНК-полимеразы II». Клетка. 125 (4): 703–17. Дои:10.1016 / j.cell.2006.04.029. PMID  16713563. S2CID  2614680.
• Ким С.К., Спрунг Р., Чен И. и др. (2006). «Субстратное и функциональное разнообразие ацетилирования лизина, выявленное протеомным исследованием». Мол. Клетка. 23 (4): 607–18. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID  16916647.