HIST1H4I - HIST1H4I

H4C9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4H9O, 3WKJ, 3AYW, 3WA9, 5B0Z, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3AV2, 3WTP, 3AV1, 3AZK, 3X1V, 5AV8, 1F66, 4QUU, 3CFS, 4YYK, 4QUT, 3NQJ, 3A6N, 3W99, 5AVC, 2RS9, 3F9Z, 3QZT, 3QBY, 3W97, 4М38, 4YM6, 3CFV, 4HGA, 1EQZ, 2RJE, 3QZV, 1HQ3, 4H9P, 3AZL, 3AFA, 1TZY, 3UVY, 5CPK, 3JPX, 4U9W, 4N3W, 4YYJ, 4ГД, 4H9N, 4H9R, 3AZI, 4LD9, 3UVX, 3АЖ, 5BNX, 4N4F, 1U35, 4ГГ, 3O36, 2ARO, 5AV9, 4H9S, 3AZF, 3W98, 4GQB, 4H9Q, 5BNV, 3WAA, 3AZG, 3AZE, 2RNY, 1ZKK, 2QQS, 2LVM, 3X1T, 3AN2, 2кВт, 3QZS, 3F9W, 5FFW, 5CPJ, 3F9X, 3IJ1, 4YM5, 3AZJ, 4YY6, 3AZN, 2IG0, 4YYH, 4YYI, 5CPI, 3W96, 3R45, 2КВН, 3F9Y, 5AV6, 3AZM, 5BO0, 3X1S, 4QYD, 4 КГК, 3UVW, 4ГГ, 3X1U, 3UW9, 2F8N, 3NQU, 5B0Y, 4ГГМ, 5C3I, 4Z5T, 5B24, 5FA5, 4Z2M, 5E5A, 5FWE, 5B2I, 5B40, 5B2J, 5JA4, 5AY8, 4ZUX
Идентификаторы
Псевдонимы	H4C9, H4 / m, H4FM, H4M, гистоновый кластер 1, H4i, гистоновый кластер 1, член семейства H4 i, кластерный гистон 9 H4, HIST1H4I, H4C5, H4C4, H4C12, H4-16, H4C3, H4C13, H4C11, H4C1, H4C14, H4C15, H4C8, H4C6, H4C2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602833 MGI: 2448427 ГомолоГен: 134482 Генные карты: H4C9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.1 Начните 27,138,588 бп[1] Конец 27,139,881 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.1 Начните 23,531,050 бп[2] Конец 23,531,519 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • связывание гистонов • Связывание РНК Сотовый компонент • мембрана • хромосома • нуклеоплазма • внеклеточная область • ядерная хромосома • нуклеосома • внеклеточная экзосома • ядро клетки • ядерная хромосома, теломерная область • внеклеточный матрикс • ядерная нуклеосома • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • теломерная организация • метаболический процесс клеточного белка • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • гетеротетрамеризация белков • отрицательная регуляция дифференцировки мегакариоцитов • CENP-A-содержащая сборка нуклеосом • Сборка нуклеосом, зависимая от репликации ДНК • подавление хроматина на рДНК • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • ДНК-шаблонная транскрипция, инициация • Независимая от репликации ДНК сборка нуклеосом • восстановление двухниточного разрыва за счет негомологичного соединения концов • сборка комплекса бета-катенин-TCF • покрытие теломер • сборка нуклеосом • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8294	69386
Ансамбль	ENSG00000276180	ENSMUSG00000060981
UniProt	P62805	P62806
RefSeq (мРНК)	NM_003495	NM_153173
RefSeq (белок)	NP_003537 NP_003486 NP_003535 NP_003539 NP_003531 NP_003536	NP_783585 NP_783588 NP_835583 NP_783583 NP_835499 NP_835500 NP_291074 NP_783586 NP_694813 NP_835515 NP_783587 NP_835582 NP_001182350
Расположение (UCSC)	Chr 6: 27.14 - 27.14 Мб	Chr 13: 23.53 - 23.53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H4 это белок что у людей кодируется HIST1H4I ген.^[5][6][7][8]

Гистоны - это основные ядерные белки, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которого примерно 146 п.н. ДНК обернуты в повторяющиеся единицы, называемые нуклеосомами. Линкерный гистон, H1, взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и функционирует в уплотнении хроматина в структуры более высокого порядка. Этот ген не имеет интронов и кодирует члена семейства гистонов H4. Транскрипты этого гена лишены полиА-хвостов, но вместо этого содержат палиндромный терминатор. Этот ген находится в микрокластере гистонов на хромосоме 6p21.33.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000276180 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000060981 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Акасака Т., Миура И., Такахаши Н., Акасака Х, Йонетани Н., Оно Х, Фукухара С., Окума М. (январь 1997 г.). «Повторяющаяся транслокация t (3; 6) (q27; p21) в неходжкинской лимфоме приводит к замене 5'-регуляторной области BCL6 новым гистоновым геном H4». Рак Res. 57 (1): 7–12. PMID  8988030.
6. Альбиг В., Денеке Д. (февраль 1998 г.). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Hum Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
7. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
8. "Ген Entrez: HIST1H4I гистоновый кластер 1, H4i".

дальнейшее чтение

• Альбиг В., Кардалину Э., Драбент Б. и др. (1991). «Изоляция и характеристика двух гистоновых генов человека H1 в кластерах основных гистоновых генов». Геномика. 10 (4): 940–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-Ф. PMID  1916825.
• Тернер Б.М., О'Нил LP, Аллан И.М. (1989). «Ацетилирование гистона H4 в клетках человека. Частота ацетилирования в различных сайтах, определенная иммунным мечением сайт-специфическими антителами». FEBS Lett. 253 (1–2): 141–5. Дои:10.1016/0014-5793(89)80947-0. PMID  2474456. S2CID  42476424.
• Паули Ю., Хрисогелос С., Стейн Г. и др. (1987). «Взаимодействия белок-ДНК in vivo перед регулируемым клеточным циклом гена гистона H4 человека». Наука. 236 (4806): 1308–11. Дои:10.1126 / science.3035717. PMID  3035717.
• Эбралидсе К.К., Грачев С.А., Мирзабеков А.Д. (1988). «Высокоосновной домен гистона H4, связанный с резко изогнутой областью нуклеосомной ДНК». Природа. 331 (6154): 365–7. Дои:10.1038 / 331365a0. PMID  3340182. S2CID  4351515.
• Сьерра Ф, Стейн Дж, Стейн Дж (1983). «Структура и транскрипция гена гистона H4 человека in vitro». Нуклеиновые кислоты Res. 11 (20): 7069–86. Дои:10.1093 / nar / 11.20.7069. ЧВК  326439. PMID  6314274.
• Драбент Б., Кардалину Е., Боде С., Денеке Д. (1995). «Ассоциация генов гистона H4 с геном гистона H1t, специфичным для семенников млекопитающих». ДНК клетки биол. 14 (7): 591–7. Дои:10.1089 / dna.1995.14.591. PMID  7626218.
• Альбиг В., Меерганс Т., Денеке Д. (1997). «Характеристика гена H1.5 завершает набор генов подтипа H1 человека». Ген. 184 (2): 141–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00582-3. PMID  9031620.
• Альбиг В., Киошис П., Поустка А. и др. (1997). «Организация гена гистонов человека: нерегулярное расположение в большом кластере». Геномика. 40 (2): 314–22. Дои:10.1006 / geno.1996.4592. PMID  9119399.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Cell. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Альбиг В., Траппе Р., Кардалину Э. и др. (1999). «Комплемент гистонового гена H2A и H2B человека». Биол. Chem. 380 (1): 7–18. Дои:10.1515 / BC.1999.002. PMID  10064132. S2CID  12807248.
• Ан Дж, Груэн Дж. Р. (1999). «Геномная организация кластеров гистонов на человеческом 6p21.3». Мамм. Геном. 10 (7): 768–70. Дои:10.1007 / s003359901089. PMID  10384058. S2CID  28275496.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.