HNRPH1 - HNRPH1

HNRNPH1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2LXU
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPH1, HNRPH, HNRPH1, hnRNPH, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1 (H), гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601035 MGI: 1891925 ГомолоГен: 31318 Генные карты: HNRNPH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.3 Начните 179,614,178 бп[1] Конец 179,634,784 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начните 50,376,990 бп[2] Конец 50,386,528 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание поли (U) РНК Сотовый компонент • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • мембрана • нуклеоплазма • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • регуляция сплайсинга РНК • обработка мРНК • Обработка РНК • Сплайсинг РНК • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • Метаболический процесс РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3187	59013
Ансамбль	ENSG00000169045	ENSMUSG00000007850
UniProt	P31943	O35737
RefSeq (мРНК)	NM_001257293 NM_005520 NM_001363572	NM_021510 NM_001347487
RefSeq (белок)	NP_001244222 NP_005511 NP_001350501 NP_001351154 NP_001351155 NP_001351156 NP_001351157 NP_001351158 NP_001351159 NP_001351160 NP_001351161 NP_001351162 NP_001351163 NP_001351164 NP_001351165 NP_001351166 NP_001351167 NP_001351168 NP_001351169 NP_001351170 NP_001351171 NP_001351172 NP_001351173 NP_001351174 NP_001351175 NP_001351176 NP_001351177 NP_001351179 NP_001351180 NP_001351181 NP_001351182 NP_001351183 NP_001351184	NP_001334416 NP_067485 NP_001349451 NP_001349452 NP_001349453 NP_001349454 NP_001349455 NP_001349456 NP_001349457 NP_001349458 NP_001349459 NP_001349461 NP_001349462 NP_001349463
Расположение (UCSC)	Chr 5: 179.61 - 179.63 Мб	Chr 11: 50.38 - 50.39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин H это белок ^[5] что у людей кодируется HNRNPH1 ген.^[6][7]

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов (hnRNP). HnRNPs являются белками, связывающими РНК, и они образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК. В то время как все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, кажется, перемещаются между ядром и цитоплазмой. Белки hnRNP обладают отчетливыми свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, имеет три повтора доменов квази-RRM, которые связываются с РНК. Он очень похож на члена семьи HNRPF. Считается, что этот ген потенциально участвует в наследственном фенотипе лимфедемы I типа.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169045 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000007850 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пенумучу, Шриниваса; Чиу, Лян-Юань; Meagher, Jennifer L .; Hansen, Alexandar L .; Стаки, Жанна А .; Толберт, Блэнтон С. (18.08.2018). «Дифференциальная конформационная динамика, закодированная линкером Inter-qRRM hnRNP H». Журнал Американского химического общества. 140 (37): 11661–11673. Дои:10.1021 / jacs.8b05366. ISSN  0002-7863. ЧВК  6648666. PMID  30122033.
6. Оноре Б., Расмуссен Х. Х., Ворум Х, Дейгаард К., Лю Х, Громов П., Мадсен П., Гессер Б., Томмеруп Н., Селис Дж. Э. (январь 1996 г.). «Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины H, H 'и F являются членами повсеместно экспрессируемого подсемейства родственных, но различных белков, кодируемых генами, отображаемыми в различных хромосомах». J Biol Chem. 270 (48): 28780–9. Дои:10.1074 / jbc.270.48.28780. PMID  7499401.
7. «Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин HNRPH1 H1 (H)».

дальнейшее чтение

• Расмуссен Х. Х., Ван Дамм Дж., Пуйпе М. и др. (1993). «Микропоследовательности 145 белков, записанные в базе данных двумерных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез. 13 (12): 960–9. Дои:10.1002 / elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
• Доусон SJ, Белый LA (1992). «Лечение эндокардита Haemophilus aphrophilus ципрофлоксацином». J. Инфекция. 24 (3): 317–20. Дои:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID  1602151.
• Матунис MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). «Белок hnRNP F: уникальная первичная структура, свойства связывания нуклеиновых кислот и субклеточная локализация». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (6): 1059–67. Дои:10.1093 / nar / 22.6.1059. ЧВК  307930. PMID  7512260.
• Гамбери С., Изаурральде Э, Бейзель С., Маттай И. В. (1997). «Взаимодействие между человеческим ядерным белковым комплексом, связывающим кепку, и hnRNP F.» Мол. Cell. Биол. 17 (5): 2587–97. Дои:10.1128 / MCB.17.5.2587. ЧВК  232108. PMID  9111328.
• Чоу М.Ю., Ладья N, Турк CW, Черный DL (1999). «hnRNP H является компонентом комплекса энхансера сплайсинга, который активирует альтернативный экзон c-src в нейрональных клетках». Мол. Cell. Биол. 19 (1): 69–77. Дои:10.1128 / MCB.19.1.69. ЧВК  83866. PMID  9858532.
• Эванс А.Л., Брайс Г., Сотирова В. и др. (1999). «Картирование первичной врожденной лимфедемы в области 5q35.3». Am. J. Hum. Genet. 64 (2): 547–55. Дои:10.1086/302248. ЧВК  1377764. PMID  9973292.
• Оноре Б., Ворум Х, Баандруп У. (1999). «hnRNPs H, H 'и F ведут себя по-разному в отношении посттрансляционного расщепления и субклеточной локализации». FEBS Lett. 456 (2): 274–80. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00911-4. PMID  10456323. S2CID  7617501.
• Марковцов В., Николич Ю.М., Гольдман Ю.А. и др. (2000). «Совместная сборка комплекса hnRNP, индуцированная тканеспецифическим гомологом белка, связывающего полипиримидиновый тракт». Мол. Cell. Биол. 20 (20): 7463–79. Дои:10.1128 / MCB.20.20.7463-7479.2000. ЧВК  86300. PMID  11003644.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Angenstein F, Evans AM, Settlage RE et al. (2002). «Рецептор активированной С-киназы является частью комплексов мессенджеров рибонуклеопротеидов, связанных с полиА-мРНК в нейронах». J. Neurosci. 22 (20): 8827–37. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-20-08827.2002. ЧВК  6757688. PMID  12388589.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ли Дж., Хокинс И.К., Харви С.Д. и др. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Мол. Cell. Биол. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК  207616. PMID  14559993.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Оноре Б., Баандруп Ю., Ворум Х (2004). «Гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины F и H / H 'демонстрируют дифференциальную экспрессию в нормальных и выбранных раковых тканях». Exp. Cell Res. 294 (1): 199–209. Дои:10.1016 / j.yexcr.2003.11.011. PMID  14980514.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Лин К.Т., Лу Р.М., Тарн В.Й. (2004). «Белки, содержащие домен WW, взаимодействуют с ранней сплайсосомой и участвуют в сплайсинге пре-мРНК in vivo». Мол. Cell. Биол. 24 (20): 9176–85. Дои:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. ЧВК  517884. PMID  15456888.