HNRPUL1 - HNRPUL1

HNRNPUL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ZRJ
Идентификаторы
Псевдонимы	HNRNPUL1, E1B-AP5, E1BAP5, HNRPUL1, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U, подобный 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605800 MGI: 2443517 ГомолоГен: 31419 Генные карты: HNRNPUL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 41,262,496 бп[1] Конец 41,307,787 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A3 Начните 25,721,165 бп[2] Конец 25,754,757 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ферментов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • ответ на вирус • Обработка РНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11100	232989
Ансамбль	ENSG00000105323	ENSMUSG00000040725
UniProt	Q9BUJ2	Q8VDM6
RefSeq (мРНК)	NM_001301016 NM_007040 NM_144732 NM_144733 NM_144734 NM_001321208 NM_001321211	NM_144922 NM_178089 NM_001360789
RefSeq (белок)	NP_001287945 NP_001308137 NP_001308140 NP_008971 NP_653333	NP_659171 NP_835190 NP_001347718
Расположение (UCSC)	Chr 19: 41.26 - 41.31 Мб	Chr 7: 25,72 - 25,75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U-подобный белок 1 это белок что у людей кодируется HNRNPUL1 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует ядерный РНК-связывающий белок семейства гетерогенных ядерных рибонуклеопротеидов (hnRNP). Этот белок специфически связывается с онкобелком аденовируса E1B-55kDa. Он может играть важную роль в транспорте нуклеоцитоплазматической РНК, и его функция модулируется E1B-55kDa в клетках, инфицированных аденовирусом. HNRPUL1 также участвует в сигнальных путях протеинкиназы ATR во время аденовирусной инфекции. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. Также были обнаружены дополнительные варианты, но их полноразмерная природа не установлена.^[7]

Взаимодействия

HNRPUL1 был показан взаимодействовать с участием BRD7^[6] и PRMT2.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105323 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040725 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Габлер С., Шутт Х., Гройтл П., Вольф Х., Шенк Т., Добнер Т. (октябрь 1998 г.). «Связанный с 55 килодальтон E1B белок: клеточный белок с РНК-связывающей активностью, участвующий в ядерно-цитоплазматическом транспорте аденовируса и клеточных мРНК». J Virol. 72 (10): 7960–71. Дои:10.1128 / JVI.72.10.7960-7971.1998. ЧВК  110131. PMID  9733834.
6. Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (апрель 2003 г.). «Регуляция транскрипции гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином E1B-AP5 опосредована образованием комплекса с новым бромодомен-содержащим белком BRD7». Biochem J. 371 (Pt 2): 385–93. Дои:10.1042 / BJ20021281. ЧВК  1223277. PMID  12489984.
7. "Ген Entrez: HNRPUL1 гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U-подобный 1".
8. Kzhyshkowska, J; Schütt H; Liss M; Креммер Э; Stauber R; Wolf H; Добнер Т. (сентябрь 2001 г.). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин E1B-AP5 метилирован в своем Arg-Gly-Gly (RGG) боксе и взаимодействует с человеческой аргининметилтрансферазой HRMT1L1». Biochem. J. 358 (Pt 2): 305–14. Дои:10.1042/0264-6021:3580305. ISSN  0264-6021. ЧВК  1222062. PMID  11513728.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж. П. и др. (2000). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов». РНК. 6 (1): 136–58. Дои:10.1017 / S1355838200991994. ЧВК  1369901. PMID  10668806.
• Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П. и др. (2000). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой». Мол. Cell. Биол. 20 (23): 8996–9008. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. ЧВК  86553. PMID  11073998.
• Kzhyshkowska J, Schütt H, Liss M, et al. (2001). «Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин E1B-AP5 метилирован в своем Arg-Gly-Gly (RGG) боксе и взаимодействует с человеческой аргининметилтрансферазой HRMT1L1». Biochem. J. 358 (Pt 2): 305–14. Дои:10.1042/0264-6021:3580305. ЧВК  1222062. PMID  11513728.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Брилл Л.М., Саломон А.Р., Фикарро С.Б. и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Анальный. Chem. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Kzhyshkowska J, Kremmer E, Hofmann M, et al. (2005). «Метилирование протеина аргинина при литической аденовирусной инфекции». Biochem. J. 383 (Pt 2): 259–65. Дои:10.1042 / BJ20040210. ЧВК  1134066. PMID  15242333.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Баррал П.М., Руш А., Тернелл А.С. и др. (2005). «Взаимодействие члена семейства hnRNP E1B-AP5 с p53». FEBS Lett. 579 (13): 2752–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.03.095. PMID  15907477. S2CID  28875660.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID  16169070.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Шиффман Д., Роуленд С.М., Луи Дж. З. и др. (2006). «Варианты генов VAMP8 и HNRPUL1 связаны с ранним началом инфаркта миокарда». Артериосклер. Тромб. Васк. Биол. 26 (7): 1613–8. Дои:10.1161 / 01.ATV.0000226543.77214.e4. PMID  16690874.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Коллерс С., Мусилова П., Рубес Дж., Роча Д. (2007). «Сравнительное картирование выявляет множественные перестройки между хромосомой 6 свиньи и 19q13 человека». Anim. Genet. 37 (6): 595–6. Дои:10.1111 / j.1365-2052.2006.01516.x. PMID  17121608.