HOMER3 - HOMER3

HOMER3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2П8В, 3CVF
Идентификаторы
Псевдонимы	HOMER3, HOMER-3, VESL3, белок каркаса гомера 3, белок каркаса гомера 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 604800 MGI: 1347359 ГомолоГен: 37972 Генные карты: HOMER3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.11 Начинать 18,929,201 бп[1] Конец 18,941,261 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 B3.3 Начинать 70,282,827 бп[2] Конец 70,294,361 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена • Связывание с рецептором глутамата, сопряженным с G-белком • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • базальная часть клетки • соединение клеток • постсинаптическая мембрана • синапс • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • мембрана • цитоплазма • цитозоль • клеточная мембрана • клеточный компонент • глутаматергический синапс • дендрит • проекция нейрона Биологический процесс • Связанный с G-белком путь передачи сигналов глутаматного рецептора • нацеливание на белок • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-2 • отрицательная регуляция сигнального каскада кальциневрин-NFAT • регуляция постсинаптической активности рецепторов нейромедиаторов • регулирование поступления кальция из магазина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9454	26558
Ансамбль	ENSG00000051128	ENSMUSG00000003573
UniProt	Q9NSC5	Q99JP6
RefSeq (мРНК)	NM_001145721 NM_001145722 NM_001145724 NM_004838	NM_001146153 NM_011984
RefSeq (белок)	NP_001139193 NP_001139194 NP_001139196 NP_004829 NP_001139194.1 NP_001139196.1	NP_001139625 NP_036114
Расположение (UCSC)	Chr 19: 18.93 - 18.94 Мб	Chr 8: 70.28 - 70.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомер белка 3 это белок что у людей кодируется HOMER3 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства дендритных белков гомера. Члены этого семейства регулируют функцию метаботрофных рецепторов глутамата группы 1. Кодируемый белок может участвовать в росте клеток.^[7]

Взаимодействия

HOMER3 был показан взаимодействовать с TRPC1^[8] и RYR1.^[9]

Смотрите также

• HOMER1
• HOMER2

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000051128 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003573 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Соловьев М.М., Сируэла Ф., Чан В.Й., Макилхинни Р.А. (февраль 2000 г.). «Молекулярная характеристика двух структурно различных групп гомеров человека, порожденная обширным альтернативным сплайсингом». Журнал молекулярной биологии. 295 (5): 1185–200. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3436. PMID  10653696.
6. Ту Дж. К., Сяо Б., Юань Дж. П., Ланахан А. А., Леоферт К., Ли М., Линден Д. Д., Уорли П. Ф. (октябрь 1998 г.). «Гомер связывает новый мотив, богатый пролином, и связывает метаботропные рецепторы глутамата группы 1 с рецепторами IP3». Нейрон. 21 (4): 717–26. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80589-9. PMID  9808459. S2CID  2851554.
7. "Entrez Gene: гомолог 3 гомера HOMER3 (дрозофила)".
8. Юань Дж.П., Киселев К., Шин Д.М., Чен Дж., Щейников Н., Канг С.Х., Дехофф М.Х., Шварц М.К., Зеебург П.Х., Муаллем С., Уорли П.Ф. (сентябрь 2003 г.). «Гомер связывает каналы семейства TRPC и необходим для стробирования TRPC1 рецепторами IP3». Клетка. 114 (6): 777–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00716-5. PMID  14505576. S2CID  10552676.
9. Фэн В., Ту Дж., Ян Т., Вернон П.С., Аллен П.Д., Уорли П.Ф., Песса И.Н. (ноябрь 2002 г.). «Гомер регулирует усиление комплекса каналов типа 1 рианодинового рецептора». Журнал биологической химии. 277 (47): 44722–30. Дои:10.1074 / jbc.M207675200. PMID  12223488.

дальнейшее чтение

• Брейкман PR, Ланахан А.А., О'Брайен Р., Рош К., Барнс, Калифорния, Хуганир Р.Л., Уорли П.Ф. (март 1997 г.). «Гомер: белок, избирательно связывающий метаботропные рецепторы глутамата». Природа. 386 (6622): 284–8. Дои:10.1038 / 386284a0. PMID  9069287. S2CID  4346579.
• Сяо Б., Ту Дж. С., Петралия Р.С., Юань Дж. П., Доан А., Бредер С. Д., Руджеро А., Ланахан А. А., Вентхольд Р. Дж., Уорли П. Ф. (октябрь 1998 г.). «Гомер регулирует ассоциацию метаботропных глутаматных рецепторов группы 1 с поливалентными комплексами гомер-связанных синаптических белков». Нейрон. 21 (4): 707–16. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80588-7. PMID  9808458. S2CID  16431031.
• Фэн В., Ту Дж., Ян Т., Вернон П.С., Аллен П.Д., Уорли П.Ф., Песса И.Н. (ноябрь 2002 г.). «Гомер регулирует усиление комплекса каналов типа 1 рианодинового рецептора». Журнал биологической химии. 277 (47): 44722–30. Дои:10.1074 / jbc.M207675200. PMID  12223488.
• Юань ДжП, Киселев К., Шин Д.М., Чен Дж., Щейников Н., Канг С.Х., Дехофф М.Х., Шварц М.К., Зеебург П.Х., Муаллем С., Уорли П.Ф. (сентябрь 2003 г.). «Гомер связывает каналы семейства TRPC и необходим для стробирования TRPC1 рецепторами IP3». Клетка. 114 (6): 777–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00716-5. PMID  14505576. S2CID  10552676.
• Исигуро К., Ксавьер Р. (март 2004 г.). «Гомер-3 регулирует активацию элемента ответа сыворотки в Т-клетках через свой домен EVH1». Кровь. 103 (6): 2248–56. Дои:10.1182 / кровь-2003-08-2671. PMID  14645007.
• Купер СТ, Хэнсон И.М. (2006). «Скрининг белков, которые взаимодействуют с PAX6: C-концевые мутации нарушают взаимодействие с HOMER3, DNCL1 и TRIM11». BMC Genetics. 6: 43. Дои:10.1186/1471-2156-6-43. ЧВК  1208879. PMID  16098226.
• Шрайнер Д., Мюллер К., Хофер Х.В. (октябрь 2006 г.). «Внутриклеточный домен человеческого протокадгерина hFat1 взаимодействует с белками, передающими сигналы Homer». Письма FEBS. 580 (22): 5295–300. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.08.079. PMID  16979624. S2CID  10267922.