Гепацивирус - Hepacivirus

Гепацивирус
Электронная микрофотография гепацивируса С, очищенного из клеточной культуры. Шкала шкалы & = 50 нанометров
Электронная микрофотография из Гепацивирус C очищен от клеточной культуры. Шкала шкалы = 50нанометры
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Kitrinoviricota
Класс:Flasuviricetes
Порядок:Амарилловиралес
Семья:Flaviviridae
Род:Гепацивирус
Типовой вид
Гепацивирус C
Виды
Синонимы

Гепацивирус это род одноцепочечные РНК-вирусы с положительным смыслом в семье Flaviviridae.[3] В гепатит С вирус (HCV), вид Гепацивирус C, инфицирует человека как своего единственного известного естественного хозяина и ассоциируется с гепатит и гепатоцеллюлярная карцинома.[3][4]

Таксономия

Вирусы, принадлежащие к этому роду, были разделены на 14 видов: Гепацивирус A-N.[5][3]

Вид вируса, недавно выделенный от бамбуковой крысы (Rhizomys pruinosus ) принадлежит к этому роду, но, судя по всему, ранее не описывался.[7]

Другой неклассифицированный вирус в этом таксоне - вирус, подобный гепацивирусу уток.[8]

Вирус этого рода выделен от белоголовых орланов (Haliaeetus leucocephalus ) [9]

Другой вирус - Вирус Джогалонг - был описан как принадлежащий к другому виду этого рода.[10]

Структура

Вирусы в роду Гепацивирус окружены сферической геометрией. Диаметр около 50 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 10 килобайт.[3][4]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ГепацивирусИкосаэдрическийПсевдо T = 3ОкутанныйЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусного белка оболочки Е к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин-опосредованный эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит по вирусной инициации. Человек служит естественным хозяином. Пути передачи - половой, кровный и контактный.[3][4]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ГепацивирусЛюдиЭпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенникиКлатрин-опосредованный эндоцитозСекрецияЦитоплазмаЦитоплазмаСекс; кровь

История

Вирус гепатита C (HCV), который является возбудителем гепатит С у человека и представителя вида Гепацивирус C, был открыт в 1989 году.[11] Были названы семь генотипов (1-7) и восемьдесят шесть подтипов (1a, 1b и т.д.) вируса гепатита С.[12]

GBV-B вирус (также известный как GB вирус B), обнаруженный в 1995 году, способен заражать Обезьяны Нового Света, особенно тамарины. Как и ВГС, он передается через кровь и, как и ВГС, связан с вирусный гепатит. Однако GBV-B никогда не выявлялся у диких животных, и его естественный хозяин неизвестен.[11]

Дополнительная информация

Дополнительные гепацивирусы были описаны от летучих мышей, грызунов, включая рыжих полевок, лошадей и собак.[13][14][15]

Крупный рогатый скот также является хозяином для вирусов вида Гепацивирус N.[16][17]

Гепацивирус грызунов встречается у оленьей мыши (Peromyscus maniculatus ).[11]

Вирус, родственный гепацивирусам, был выделен из грациозной кошачьей акулы (Proscyllium habereri ).[18]

Существует как минимум два подтипа гепацивируса лошадей.[19]

Вирусы, наиболее близкие к гепацивирусу С, - это гепацивирусы лошадей этого вида. Гепацивирус А .[20]

Гепацивирус А, заражающий лошадей, также был обнаружен у ослов.[21]

использованная литература

  1. ^ Прингл, К. Р. (1996). "Таксономия вирусов 1996 - бюллетень X Международного конгресса вирусологии в Иерусалиме" (PDF). Архив вирусологии. 141 (11): 2251–6. Дои:10.1007 / BF01718231. ISSN  1432-8798. OCLC  76349762. PMID  8992952. Получено 13 марта 2019. Назвать род, включающий вирусы гепатита С, как род Гепацивирус.
  2. ^ 1ICTV 6-й отчет Мерфи, Ф. А., Фоке, К. М., Бишоп, Д. Х. Л., Габриаль, С. А., Джарвис, А. В. Мартелли, Г. П. Майо, М. А. и Саммерс, М. Д. (редакторы) (1995). Таксономия вирусов. Шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Архив вирусологии Приложение 10, стр. 424 https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%206th%20Report.pdf
  3. ^ а б c d е "Flaviviridae". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV).
  4. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  5. ^ Смит, Дональд Б. Бехер, Пол; Бух, Йенс; Гулд, Эрнест А; Мейерс, Грегор; Монат, Томас; Муэрхофф, А. Скотт; Плетнев Александр; Рико-Гессе, Ребекка; Стэплтон, Джек Т; Симмондс, Питер (2016). «Предлагаемое обновление таксономии родов Hepacivirus и Pegivirus в семействе Flaviviridae». Журнал общей вирусологии. 97 (11): 2894–2907. Дои:10.1099 / jgv.0.000612. ЧВК  5770844. PMID  27692039.
  6. ^ Li LL, Liu MM, Shen S, Zhang YJ, Xu YL, Deng HY, Deng F, Duan ZJ (2019) Обнаружение и характеристика нового гепацивируса у длиннохвостых сусликов (Spermophilus undulatus) в Китае. Arch Virol
  7. ^ Ван Нгуен, Дунг; Ван Нгуен, Куонг; Бонсалл, Дэвид; Нго, вт; Каррик-Мас, Хуан; Фам, Ань; Брайант, Джульетта; Туэйтс, Гай; Бейкер, Стивен; Вулхаус, Марк; Симмондс, Питер (2018). «Обнаружение и характеристика гомологов вирусов гепатита человека и пегивирусов у грызунов и летучих мышей во Вьетнаме». Вирусы. 10 (3): 102. Дои:10.3390 / v10030102. ЧВК  5869495. PMID  29495551.
  8. ^ Chu L, Jin M, Feng C, Wang X, Zhang D (2019) Сильно расходящийся флавивирус, подобный гепацивирусу, у домашних уток. Дж. Ген Вирол
  9. ^ Goldberg TL, Sibley SD, Pinkerton ME, Dunn CD, Long LJ, White LC, Strom SM (2019) Многолетняя смертность и гомолог вируса гепатита C у белоголовых орланов (Haliaeetus leucocephalus), национальной птицы США. Научный журнал 9 (1): 14953
  10. ^ Williams SH, Levy A, Yates RA, Somaweera N, Neville PJ, Nicholson J, Lindsay MDA, Mackenzie JS, Jain K, Imrie A, Smith DW, Lipkin WI (2020) Открытие вируса Джогалонга, нового гепацивируса, идентифицированного в Culex annulirostris (Skuse) комар из региона Кимберли в Западной Австралии. PLoS One 15 (1): e0227114
  11. ^ а б c Стэплтон, Дж. Т.; Foung, S; Muerhoff, A. S; Бух, Дж; Симмондс, П. (2010). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в семействе Flaviviridae». Журнал общей вирусологии. 92 (2): 233–46. Дои:10.1099 / vir.0.027490-0. ЧВК  3081076. PMID  21084497.
  12. ^ «Классификация ВПЦ». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV).
  13. ^ Капур, А; Simmonds, P; Scheel, T. K. H; Hjelle, B; Каллен, Дж. М.; Бурбело, П. Д.; Чаухан, Л. В; Duraisamy, R; Санчес Леон, М; Джайн, К. Vandegrift, K.J; Калишер, К. Н; Райс, К. М.; Липкин, В. I (2013). «Идентификация гомологов вируса гепатита С и пегивирусов на грызунах». мБио. 4 (2): e00216–13. Дои:10,1128 / мBio.00216-13. ЧВК  3622934. PMID  23572554.
  14. ^ Дрекслер, Ян Феликс; Корман, Виктор Макс; Мюллер, Марсель Александр; Лукашев Александр Н; Гмыль Анатолий; Кутар, Бруно; Адам, Александр; Ритц, Дэниел; Leijten, Lonneke M; Ван Рил, Дебби; Каллис, Рене; Клозе, Стефан М; Глоза-Рауш, Флориан; Бингер, Табеа; Аннан, Августина; Аду-Саркоди, рыскание; Оппонг, Самуэль; Бургарель, Матье; Рупп, Даниэль; Хоффманн, Бернд; Шлегель, Матиас; Kümmerer, Beate M; Крюгер, Детлев H; Шмидт-Чанасит, Йонас; Сетиен, Альваро Агилар; Cottontail, Вероника М; Хемачудха, Тирават; Wacharapluesadee, Supaporn; Остерридер, Клаус; и другие. (2013). «Доказательства новых гепацивирусов у грызунов». PLoS Патогены. 9 (6): e1003438. Дои:10.1371 / journal.ppat.1003438. ЧВК  3688547. PMID  23818848.
  15. ^ Лаук, М; Сибли, С. Д; Лара, Дж; Purdy, M.A; Худяков, Ю; Hyeroba, D; Тумукунде, А; Вени, G; Switzer, W.M; Chapman, C.A; Hughes, A. L; Фридрих, Т. С; О'Коннор, Д. Х; Гольдберг, Т. Л. (2013). «Новый гепацивирус с необычно длинным и внутренне нарушенным белком NS5A у дикого приматы Старого Света». Журнал вирусологии. 87 (16): 8971–81. Дои:10.1128 / JVI.00888-13. ЧВК  3754081. PMID  23740998.
  16. ^ Корман, Виктор Макс; Грундхофф, Адам; Бахлейн, Кристина; Фишер, Николь; Гмыль Анатолий; Волльни, Роберт; Дей, Диксон; Ритц, Дэниел; Бингер, Табеа; Аданква, Эрнест; Марфо, Квадво Сарфо; Аннисон, Лоуренс; Аннан, Августина; Аду-Саркоди, рыскание; Оппонг, Самуэль; Бехер, Пол; Дростен, Кристиан; Дрекслер, Ян Феликс (2015). «Сильно дивергентные гепацивирусы африканского крупного рогатого скота». Журнал вирусологии. 89 (11): 5876–82. Дои:10.1128 / JVI.00393-15. ЧВК  4442428. PMID  25787289.
  17. ^ Бахлейн, Кристина; Фишер, Николь; Грундхофф, Адам; Алави, Малик; Инденбиркен, Даниэла; Постель, Александр; Барон Анна Лена; Оффингер, Дженнифер; Беккер, Катрин; Бейнеке, Андреас; Регаге, Юрген; Бехер, Пол (2015). «Выявление нового гепацивируса домашнего скота из Германии». Журнал вирусологии. 89 (14): 7007–15. Дои:10.1128 / JVI.00534-15. ЧВК  4473572. PMID  25926652.
  18. ^ Ши, Ман; Линь, Сиань-Дань; Василакис, Никос; Тиан, Цзюнь-Хуа; Ли, Ци-Сю; Чен, Лян-Цзюнь; Иствуд, Джиллиан; Дяо, Сю-Нянь; Чен, Мин-Хуэй; Чен, Сяо; Цинь, Синь-Чэн; Уайден, Стивен Джи; Wood, Thomas G; Теш, Роберт Б; Сюй, Цзяньго; Холмс, Эдвард С; Чжан, Юн-Чжэнь (2016). «Дивергентные вирусы, обнаруженные у членистоногих и позвоночных, пересматривают историю эволюции Flaviviridae и родственных вирусов». Журнал вирусологии. 90 (2): 659–69. Дои:10.1128 / JVI.02036-15. ЧВК  4702705. PMID  26491167.
  19. ^ Проность, S; Оттенок, E; Фортье, С; Фурсин, М; Фортье, G; Desbrosse, F; Рей, Ф. А; Pitel, P.-H; Ричард, Э; Сонье, Б. (2017). «Распространенность инфекций гепацивируса лошадей во Франции и данные о двух вирусных подтипах, циркулирующих во всем мире». Трансграничные и новые болезни. 64 (6): 1884–1897. Дои:10.1111 / т. 12587. PMID  27882682.
  20. ^ Тезе, Жюльен; Лоус, София; Паркер, Джо; Pybus, Оливер G (2015). «Эволюционный и филогенетический анализ гепацивирусов и пегивирусов». Геномная биология и эволюция. 7 (11): 2996–3008. Дои:10.1093 / gbe / evv202. ЧВК  5635594. PMID  26494702.
  21. ^ Вальтер С., Раше А., Морейра-Сото А., Пфендер С., Блеца М., Корман В.М., Агилар-Сетиен А., Гарсия-Лейси Ф., Ханс А., Тодт Д., Шулер Г., Шнайдерман-Торбан А., Штайнман А., Ронкорони С., Венециано В, Русенова №12, Сандев №12, Русенов А., Запрянова Д., Гарсия-Боканегра I, Джорес Дж., Карлуччо А., Веронези М.С., Каваллери JMV, Дростен С, Lemey P, Steinmann E, Drexler JF (2016) Дифференциальные модели инфекции и недавнее эволюционное происхождение лошадиного гепацивируса у ослов. Дж Вирол 91 (1)

внешние ссылки