Flaviviridae - Flaviviridae

Flaviviridae
Вирус Зика структура и геном вириона
Электронная микрофотография из Гепацивирус C. Шкала шкалы = 50нанометры
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Царство:	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Kitrinoviricota
Класс:	Flasuviricetes
Порядок:	Амарилловиралес
Семья:	Flaviviridae
Рода
Гепацивирус Флавивирус Пегивирус Пестивирус

Flaviviridae это семья вирусы. Естественными хозяевами служат люди и другие млекопитающие. В основном они передаются через членистоногих. векторов (в основном клещи и комары). Семья получила свое название от желтая лихорадка вирус, тип вируса Flaviviridae; Flavus в переводе с латыни означает «желтый», а желтая лихорадка, в свою очередь, была названа из-за ее способности вызывать желтуха в пострадавших.^[1] В настоящее время это семейство состоит из 89 видов, разделенных на четыре рода.^[2][3] Заболевания, связанные с этим семейством, включают: гепатит (гепацивирусы), геморрагические синдромы, смертельные заболевания слизистой оболочки (пестивирусы), геморрагическая лихорадка, энцефалит и врожденный дефект микроцефалии (флавивирусы).^[3][4]

Таксономия

В этом семействе четыре рода:^[2][3]

• Род Флавивирус (типовой вид Желтая лихорадка вирус, другие включают вирус Западного Нила, Вирус денге, и Вирус Зика ).
• Род Гепацивирус (типовой вид Гепацивирус C (вирус гепатита С ), также включает Гепацивирус B (GB вирус B))
• Род Пегивирус (включает в себя Пегивирус А (GB вирус A), Пегивирус С (GB вирус C) и Пегивирус B (ГБ вирус D))
• Род Пестивирус (типовой вид Пестивирус А (вирус вирусной диареи крупного рогатого скота 1 ), другие включают Пестивирус С (вирус классической чумы свиней, ранее вирус холеры свиней)). Вирусы этого рода поражают млекопитающих, кроме человека.

Неклассифицированный

Известны и другие флавивирусы, которые еще предстоит классифицировать. К ним относится вирус акулы Wenling.

Jingmenvirus представляет собой группу неклассифицированных вирусов в семействе, которое включает вирус Алоншань, вирус Гуайко Кулекс, вирус клещей Цзинмэнь и вирус клещей Могиана. Эти вирусы имеют сегментированный геном из 4 или 5 частей. Два из этих сегментов происходят от флавивирусов.

Некоторые вирусы могут быть родственниками флавивирусов, но обладают характеристиками, нетипичными для флавивирусов. К ним относятся цитрусовый Jingmen-подобный вирус, вирус 5 нематод цисты сои, агент личинки Toxocara canis, вирус крикета Ухань и, возможно, связанный вирус горечавки Кобу-шо.

Геном

Геном и полипротеин представителей рода Флавивирус

Члены семьи Flaviviridae иметь одночастные, линейные, одноцепочечные РНК геномы положительной полярности от 9,6 до 12,3 килобаза. 5'-концы флавивирусов несут метилированный нуклеотид cap, в то время как другие члены этого семейства не закрыты и кодируют внутренний сайт входа в рибосому.

Геном кодирует один полипротеин с множеством трансмембранных доменов, который расщепляется протеазами хозяина и вируса на структурные и неструктурные белки. Среди неструктурных белковых продуктов (NS) местоположения и последовательности NS3 и NS5, которые содержат мотивы, необходимые для процессинга полипротеина и репликации РНК, соответственно, относительно хорошо консервативны во всем семействе и могут быть полезны для филогенетического анализа.

Структура вириона

Частицы вируса покрыты оболочкой икосаэдрической и сферической формы, примерно 40–60 нм в диаметре.^[3][4]

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Гепацивирус	Икосаэдрический	Псевдо T = 3	Окутанный	Линейный	Одночастный
Флавивирус	Икосаэдрический	Псевдо T = 3	Окутанный	Линейный	Одночастный
Пегивирус	Икосаэдрический	Псевдо T = 3	Окутанный	Линейный	Одночастный
Пестивирус	Икосаэдрический	Псевдо T = 3	Окутанный	Линейный	Одночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяин достигается путем прикрепления белка E вирусной оболочки к рецепторам хозяина, что опосредует клатрин -опосредованный эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит по вирусной инициации. Вирус покидает клетку-хозяина путем почкования. Естественными хозяевами служат люди и млекопитающие. Вирус передается через переносчиков (клещей и комаров).^[3][4]

Род	Детали хоста	Тканевый тропизм	Детали входа	Детали выпуска	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Гепацивирус	Люди	Эпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенники	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Секреция	Цитоплазма	Цитоплазма	Секс; кровь
Флавивирус	Люди; млекопитающие; комары; клещи	Эпителий: кожа; эпителий: почка; эпителий: кишечник; эпителий: семенники	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Секреция	Цитоплазма	Цитоплазма	Зооноз; укус членистоногого
Пегивирус	Млекопитающие	Никто	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Секреция	Цитоплазма	Цитоплазма	Неизвестно
Пестивирус	Млекопитающие	Никто	Клатрин-опосредованный эндоцитоз	Секреция	Цитоплазма	Цитоплазма	По вертикали: родительский

Клиническое значение

Основные заболевания, вызванные членами семьи Flaviviridae включают:

• Лихорадка денге
• Гепатит С
• японский энцефалит
• Кясанурская болезнь леса
• Энцефалит долины Мюррей
• Сент-Луисский энцефалит
• Клещевой энцефалит
• Энцефалит Западного Нила
• Желтая лихорадка
• Лихорадка Зика

использованная литература

1. "Flaviviridae". Вики Сообщества. Получено 22 июля, 2008.
2. Simmonds, P; Becher, P; Бух, Дж; Gould, E; Мейерс, G; Monath, T; Muerhoff, S; Плетнев, А; Rico-Hesse, R; Смит, Д.; Стэплтон, Дж; Консорциум отчетов ICTV (2017). "Профиль таксономии вирусов ICTV: Flaviviridae". Журнал общей вирусологии. 98 (1): 2–3. Дои:10.1099 / jgv.0.000672. ЧВК  5370391. PMID  28218572.
3. "Flaviviridae". Интернет-отчет ICTV.
4. «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.

внешние ссылки

• Отчет ICTV: Flaviviridae
• Геномы Flaviviridae результаты поиска по базе данных из Ресурсный центр по вирусной биоинформатике
• Viralzone: Flaviviridae
• Ресурс базы данных и анализа вирусных патогенов (ViPR): Flaviviridae
• "Flaviviridae". Браузер таксономии NCBI. 11050.